More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1539 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1539  glycine cleavage system protein H  100 
 
 		 127 aa  255  1e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.463905  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23430  glycine cleavage system H protein  54.33 
 
 		 128 aa  125  3e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000556712  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3183  glycine cleavage system protein H  48 
 
 		 126 aa  121  3e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.0000000182392  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1944  glycine cleavage system H protein  50 
 
 		 130 aa  120  9e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000190356 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1698  glycine cleavage system H protein  48.41 
 
 		 126 aa  120  9e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2869  glycine cleavage system protein H  48 
 
 		 129 aa  118  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0485  glycine cleavage system protein H  47.2 
 
 		 126 aa  115  9.999999999999999e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0231  glycine cleavage system protein H  44.09 
 
 		 126 aa  116  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1497  glycine cleavage system H protein  46.03 
 
 		 126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0225  glycine cleavage system protein H  43.65 
 
 		 127 aa  114  3e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0929838 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1719  glycine cleavage system H protein  45.16 
 
 		 130 aa  115  3e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.891721 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1577  glycine cleavage system H protein  48.36 
 
 		 125 aa  115  3e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.731987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3298  glycine cleavage system H protein  45.31 
 
 		 129 aa  114  3.9999999999999997e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.123967  normal  0.480249 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1467  glycine cleavage system protein H  47.97 
 
 		 126 aa  114  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0733861 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2577  glycine cleavage system protein H  48.03 
 
 		 130 aa  114  3.9999999999999997e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0304435  normal  0.0181641 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0832  glycine cleavage system protein H  48 
 
 		 126 aa  114  5e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00486711  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3084  glycine cleavage system protein H  47.24 
 
 		 127 aa  114  5e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0764  glycine cleavage system protein H  45.97 
 
 		 126 aa  114  5e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0849  glycine cleavage system protein H  48 
 
 		 126 aa  114  5e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000024227  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0213  glycine cleavage system protein H  44.09 
 
 		 129 aa  114  6e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05972  glycine cleavage system protein H  49.18 
 
 		 126 aa  113  6.9999999999999995e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0051  glycine cleavage system H protein  46.55 
 
 		 127 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4038  glycine cleavage system H protein  49.18 
 
 		 128 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0664903  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0154  glycine cleavage system protein H  47.15 
 
 		 131 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.326161  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0135  glycine cleavage system protein H  45.53 
 
 		 131 aa  111  3e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1893  glycine cleavage system protein H  45.53 
 
 		 127 aa  111  3e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.262641 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1693  glycine cleavage system protein H  42.86 
 
 		 127 aa  111  3e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.418268  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2933  glycine cleavage system protein H  46.46 
 
 		 127 aa  111  3e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00141908  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0897  glycine cleavage system H protein  44 
 
 		 135 aa  110  5e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00473644  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3324  glycine cleavage H-protein  43.09 
 
 		 155 aa  110  6e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2460  glycine cleavage system protein H  45.38 
 
 		 126 aa  110  6e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00460  glycine dehydrogenase (decarboxylating), putative  45.53 
 
 		 160 aa  110  8.000000000000001e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.528435  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0339  glycine cleavage system protein H  45.08 
 
 		 130 aa  109  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000111817  normal  0.10942 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1827  glycine cleavage system H protein  44.8 
 
 		 128 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000163584  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1191  glycine cleavage system protein H  44.88 
 
 		 130 aa  109  1.0000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3206  glycine cleavage system protein H  48.04 
 
 		 128 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000136098  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000233  glycine cleavage system H protein  48.72 
 
 		 126 aa  108  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0721  glycine cleavage system H protein  45.6 
 
 		 126 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2621  glycine cleavage system protein H  44.53 
 
 		 128 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.233728  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2715  glycine cleavage system protein H  44.53 
 
 		 128 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12390  glycine cleavage system H protein  42.02 
 
 		 123 aa  109  2.0000000000000002e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00556536  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1901  glycine cleavage system H protein  44 
 
 		 137 aa  108  3e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.119893  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4142  glycine cleavage system H protein  45.45 
 
 		 124 aa  108  3e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2758  glycine cleavage system protein H  44.72 
 
 		 130 aa  107  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2004  glycine cleavage system H protein  44.53 
 
 		 127 aa  107  4.0000000000000004e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.829681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0798  glycine cleavage system protein H  49.14 
 
 		 126 aa  107  5e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00579569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0805  glycine cleavage system protein H  49.14 
 
 		 126 aa  107  5e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000312809  normal  0.950872 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1626  glycine cleavage system H protein  42.28 
 
 		 122 aa  107  6e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0332  glycine cleavage system protein H  44.55 
 
 		 129 aa  106  8.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1244  glycine cleavage system protein H  43.75 
 
 		 128 aa  106  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00862  glycine cleavage system protein H  46.34 
 
 		 129 aa  106  9.000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2523  glycine cleavage system protein H  43.75 
 
 		 127 aa  106  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.85836  normal  0.122501 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1812  glycine cleavage system protein H  44.72 
 
 		 131 aa  105  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2284  glycine cleavage system H protein  47.97 
 
 		 129 aa  106  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.868083  hitchhiker  0.0000750772 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1711  glycine cleavage system H protein  46.28 
 
 		 126 aa  105  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.147296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5135  glycine cleavage system protein H  42.97 
 
 		 127 aa  105  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00103553  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2653  glycine cleavage system H protein  44 
 
 		 129 aa  105  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000387916 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2994  glycine cleavage system H protein  44.92 
 
 		 126 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2284  glycine cleavage system protein H  54 
 
 		 127 aa  105  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.31012  normal  0.75932 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0128  glycine cleavage system H protein  44.92 
 
 		 126 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3927  glycine cleavage system H protein  44.92 
 
 		 126 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0419405  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1850  glycine cleavage system H protein  41.41 
 
 		 129 aa  105  2e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4814  glycine cleavage system protein H  42.97 
 
 		 127 aa  105  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00016491  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3254  glycine cleavage system H protein  44.92 
 
 		 126 aa  105  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3060  glycine cleavage system H protein  44.92 
 
 		 126 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0953  glycine cleavage system protein H  46.96 
 
 		 126 aa  105  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1543  glycine cleavage system H protein  44.92 
 
 		 126 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.532725  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1982  glycine cleavage system H protein  43.31 
 
 		 130 aa  105  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0297807  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3310  glycine cleavage system H protein  44.92 
 
 		 126 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68860  glycine cleavage system protein H  41.32 
 
 		 129 aa  105  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1563  glycine cleavage system H protein  44 
 
 		 129 aa  105  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000855574  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2720  glycine cleavage system protein H  44.26 
 
 		 129 aa  105  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0615009  normal  0.778842 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5130  glycine cleavage system protein H  42.97 
 
 		 127 aa  105  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365083  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4859  glycine cleavage system protein H  42.97 
 
 		 127 aa  105  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000908449  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4700  glycine cleavage system protein H  42.97 
 
 		 127 aa  105  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000213752  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4716  glycine cleavage system protein H  42.97 
 
 		 127 aa  105  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000916909  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3363  glycine cleavage system H protein  47.06 
 
 		 127 aa  104  3e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.722606 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3586  glycine cleavage system protein H  42.97 
 
 		 127 aa  105  3e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000166607  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5228  glycine cleavage system protein H  42.97 
 
 		 127 aa  105  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000143615  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0142  glycine cleavage system protein H  39.84 
 
 		 126 aa  105  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.207968  normal  0.345489 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5097  glycine cleavage system protein H  42.97 
 
 		 127 aa  105  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3063  glycine cleavage system protein H  41.8 
 
 		 129 aa  104  3e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.210618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5133  glycine cleavage system protein H  42.97 
 
 		 127 aa  105  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000135708  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0736  glycine cleavage system protein H  48.33 
 
 		 122 aa  104  4e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0105  glycine cleavage system protein H  42.97 
 
 		 127 aa  104  4e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000835004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3998  glycine cleavage system H protein  44.92 
 
 		 126 aa  104  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3845  glycine cleavage system H protein  45.13 
 
 		 128 aa  104  5e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0985  glycine cleavage system H protein  42.31 
 
 		 132 aa  104  5e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00310181  hitchhiker  0.00751565 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1662  glycine cleavage system protein H  45.45 
 
 		 135 aa  103  5e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.293907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3881  glycine cleavage system protein H  45.63 
 
 		 126 aa  104  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0618  glycine cleavage system protein H  42.62 
 
 		 129 aa  104  5e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.475927  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0144  glycine cleavage system protein H  41.46 
 
 		 126 aa  104  5e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.87599 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0132  glycine cleavage system H protein  41.46 
 
 		 153 aa  104  5e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0712  glycine cleavage system protein H  47.5 
 
 		 122 aa  104  5e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0534  glycine cleavage system H protein  44.44 
 
 		 127 aa  103  6e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1124  glycine cleavage system H protein  42.97 
 
 		 129 aa  103  6e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5959  glycine cleavage system protein H  46.39 
 
 		 142 aa  103  7e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.723705  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5253  glycine cleavage system protein H  42.61 
 
 		 127 aa  103  7e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0717  glycine cleavage system H protein  48.25 
 
 		 128 aa  103  7e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1328  glycine cleavage system H protein  45.54 
 
 		 126 aa  103  8e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>