More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1626 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1626  glycine cleavage system H protein  100 
 
 		 122 aa  243  9e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1612  glycine cleavage system protein H  50.83 
 
 		 127 aa  125  2.0000000000000002e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.645617  normal  0.608002 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5130  glycine cleavage system protein H  50.4 
 
 		 127 aa  124  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365083  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5133  glycine cleavage system protein H  50.4 
 
 		 127 aa  124  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000135708  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0142  glycine cleavage system protein H  48.36 
 
 		 126 aa  125  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.207968  normal  0.345489 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4814  glycine cleavage system protein H  49.6 
 
 		 127 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00016491  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5097  glycine cleavage system protein H  49.6 
 
 		 127 aa  123  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4859  glycine cleavage system protein H  49.6 
 
 		 127 aa  123  8.000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000908449  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4700  glycine cleavage system protein H  49.6 
 
 		 127 aa  123  8.000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000213752  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4716  glycine cleavage system protein H  49.6 
 
 		 127 aa  123  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000916909  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5228  glycine cleavage system protein H  49.6 
 
 		 127 aa  123  8.000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000143615  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0105  glycine cleavage system protein H  49.6 
 
 		 127 aa  122  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000835004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3586  glycine cleavage system protein H  49.6 
 
 		 127 aa  122  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000166607  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3060  glycine cleavage system H protein  45.9 
 
 		 126 aa  121  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2994  glycine cleavage system H protein  45.9 
 
 		 126 aa  121  4e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0128  glycine cleavage system H protein  45.9 
 
 		 126 aa  121  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3927  glycine cleavage system H protein  45.9 
 
 		 126 aa  121  4e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0419405  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5135  glycine cleavage system protein H  48.8 
 
 		 127 aa  121  4e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00103553  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1543  glycine cleavage system H protein  45.9 
 
 		 126 aa  121  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.532725  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3310  glycine cleavage system H protein  45.9 
 
 		 126 aa  121  4e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3998  glycine cleavage system H protein  46.28 
 
 		 126 aa  120  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2910  glycine cleavage system protein H  48.76 
 
 		 126 aa  120  5e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0145  glycine cleavage system protein H  48.76 
 
 		 126 aa  120  5e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0158  glycine cleavage system protein H  47.97 
 
 		 126 aa  120  6e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0832  glycine cleavage system protein H  48.39 
 
 		 126 aa  120  9e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00486711  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3254  glycine cleavage system H protein  45.9 
 
 		 126 aa  119  9e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0849  glycine cleavage system protein H  48.39 
 
 		 126 aa  120  9e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000024227  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2621  glycine cleavage system protein H  44.8 
 
 		 128 aa  119  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.233728  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2715  glycine cleavage system protein H  44.8 
 
 		 128 aa  119  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1244  glycine cleavage system protein H  44.8 
 
 		 128 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0132  glycine cleavage system H protein  46.28 
 
 		 153 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0144  glycine cleavage system protein H  46.72 
 
 		 126 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.87599 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27674  predicted protein  46.61 
 
 		 134 aa  117  4.9999999999999996e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3150  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 129 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000198497  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1719  glycine cleavage system H protein  49.17 
 
 		 130 aa  117  7.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.891721 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0721  glycine cleavage system H protein  44.8 
 
 		 126 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3183  glycine cleavage system protein H  48.65 
 
 		 126 aa  116  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.0000000182392  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1982  glycine cleavage system H protein  47.58 
 
 		 130 aa  116  9.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0297807  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0247  glycine cleavage system protein H  45.83 
 
 		 128 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0897  glycine cleavage system H protein  48.33 
 
 		 135 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00473644  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0447  glycine cleavage system H protein  43.55 
 
 		 126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.197212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2523  glycine cleavage system protein H  45.6 
 
 		 127 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.85836  normal  0.122501 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2933  glycine cleavage system protein H  47.2 
 
 		 127 aa  115  3e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00141908  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1698  glycine cleavage system H protein  47.11 
 
 		 126 aa  114  3e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0231  glycine cleavage system protein H  47.5 
 
 		 126 aa  114  3e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5450  glycine cleavage system protein H  46.49 
 
 		 121 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0749655 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68860  glycine cleavage system protein H  46.67 
 
 		 129 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1577  glycine cleavage system H protein  46.55 
 
 		 125 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.731987  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47270  Glycine cleavage system H protein  48.25 
 
 		 129 aa  114  5e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.666574  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3072  glycine cleavage system protein H  49.17 
 
 		 131 aa  113  6.9999999999999995e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.132267 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0689  glycine cleavage system protein H  45.69 
 
 		 125 aa  114  6.9999999999999995e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.904294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2720  glycine cleavage system protein H  45.9 
 
 		 129 aa  113  6.9999999999999995e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0615009  normal  0.778842 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1944  glycine cleavage system H protein  45.6 
 
 		 130 aa  113  7.999999999999999e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000190356 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3302  glycine cleavage system protein H  48.36 
 
 		 129 aa  113  8.999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.13973  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0485  glycine cleavage system protein H  43.55 
 
 		 126 aa  112  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0780  glycine cleavage system protein H  47.54 
 
 		 129 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0332  glycine cleavage system protein H  50.98 
 
 		 129 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5253  glycine cleavage system protein H  47.46 
 
 		 127 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2392  glycine cleavage system H protein  47.83 
 
 		 119 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.368043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3330  glycine cleavage system protein H  47.54 
 
 		 129 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.277505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0623  glycine cleavage system protein H  47.54 
 
 		 129 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0735032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3500  glycine cleavage system protein H  47.54 
 
 		 129 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.497243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3330  glycine cleavage system protein H  46.72 
 
 		 126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.348405  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0154  glycine cleavage system protein H  45.83 
 
 		 131 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.326161  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1285  glycine cleavage system protein H  47.41 
 
 		 121 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.390609  normal  0.169764 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0213  glycine cleavage system protein H  43.09 
 
 		 129 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0135  glycine cleavage system protein H  45 
 
 		 131 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1516  glycine cleavage system H protein  48.33 
 
 		 125 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0307602  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1107  glycine cleavage system H protein  50 
 
 		 126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2460  glycine cleavage system protein H  46.22 
 
 		 126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2758  glycine cleavage system protein H  44.54 
 
 		 130 aa  111  3e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3210  glycine cleavage system protein H  46.72 
 
 		 129 aa  111  3e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0184338  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2046  glycine cleavage system protein H  43.44 
 
 		 129 aa  111  3e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2284  glycine cleavage system protein H  47.93 
 
 		 127 aa  111  3e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.31012  normal  0.75932 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3755  glycine cleavage system H protein  46.15 
 
 		 128 aa  111  4.0000000000000004e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.301262  normal  0.144879 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0051  glycine cleavage system H protein  43.7 
 
 		 127 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0734  glycine cleavage system protein H  46.22 
 
 		 124 aa  110  4.0000000000000004e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.5619  normal  0.0299013 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1732  glycine cleavage system protein H  48.25 
 
 		 121 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1893  glycine cleavage system protein H  42.98 
 
 		 127 aa  111  4.0000000000000004e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.262641 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3968  glycine cleavage system protein H  46.72 
 
 		 129 aa  110  5e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0721397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01656  glycine cleavage system protein H  48 
 
 		 131 aa  110  5e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.671039  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13340  glycine cleavage system H protein  43.09 
 
 		 127 aa  110  5e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0618  glycine cleavage system protein H  46.72 
 
 		 129 aa  110  5e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.475927  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3618  glycine cleavage system protein H  46.72 
 
 		 129 aa  110  5e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3800  glycine cleavage system protein H  46.72 
 
 		 129 aa  110  5e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1906  glycine cleavage system protein H  44.07 
 
 		 120 aa  110  5e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0411351 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3676  glycine cleavage system protein H  46.72 
 
 		 129 aa  110  5e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.134478  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0317  glycine cleavage system H protein  45.45 
 
 		 128 aa  110  6e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0834  glycine cleavage system protein H  46.67 
 
 		 129 aa  110  6e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3674  glycine cleavage system protein H  47.54 
 
 		 129 aa  110  6e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23430  glycine cleavage system H protein  44.17 
 
 		 128 aa  110  6e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000556712  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3206  glycine cleavage system protein H  41.67 
 
 		 128 aa  110  7.000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000136098  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3063  glycine cleavage system protein H  45.9 
 
 		 129 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.210618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2869  glycine cleavage system protein H  42.74 
 
 		 129 aa  110  8.000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1711  glycine cleavage system H protein  40.32 
 
 		 126 aa  110  9e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.147296  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5193  glycine cleavage system protein H  45.9 
 
 		 127 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.458089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5959  glycine cleavage system protein H  47.37 
 
 		 142 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.723705  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2347  glycine cleavage system H protein  43.97 
 
 		 118 aa  109  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.250825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3739  glycine cleavage system protein H  48.21 
 
 		 121 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0626114  normal  0.594072 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3481  glycine cleavage system protein H  45.08 
 
 		 126 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>