More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1906 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1906  glycine cleavage system protein H  100 
 
 		 120 aa  241  3e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0411351 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0839  glycine cleavage system protein H  58.54 
 
 		 130 aa  143  6e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0623  glycine cleavage system protein H  57.72 
 
 		 130 aa  140  6e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0864  glycine cleavage system protein H  60.16 
 
 		 128 aa  140  6e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.786548  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0868  glycine cleavage system protein H  60.16 
 
 		 128 aa  140  6e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3831  glycine cleavage system protein H  60.16 
 
 		 128 aa  140  6e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.396771  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3310  glycine cleavage system protein H  54.92 
 
 		 136 aa  139  9.999999999999999e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1711  glycine cleavage system H protein  63.21 
 
 		 126 aa  138  3e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.147296  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3436  glycine cleavage system protein H  55.74 
 
 		 135 aa  137  3.9999999999999997e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3915  glycine cleavage system H protein  57.72 
 
 		 128 aa  136  7.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3323  glycine cleavage system protein H  57.38 
 
 		 129 aa  136  7.999999999999999e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2720  glycine cleavage system protein H  59.84 
 
 		 129 aa  135  1e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0615009  normal  0.778842 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0618  glycine cleavage system protein H  61.67 
 
 		 129 aa  134  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.475927  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2758  glycine cleavage system protein H  59.84 
 
 		 130 aa  134  3.0000000000000003e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3591  glycine cleavage system protein H  57.5 
 
 		 129 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.961592  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3800  glycine cleavage system protein H  61.67 
 
 		 129 aa  134  4e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3676  glycine cleavage system protein H  61.67 
 
 		 129 aa  134  4e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.134478  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3618  glycine cleavage system protein H  61.67 
 
 		 129 aa  134  4e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02736  glycine cleavage system protein H  56.56 
 
 		 129 aa  133  9e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0429973  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0788  glycine cleavage system H protein  56.56 
 
 		 129 aa  133  9e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471951  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4195  glycine cleavage system protein H  56.56 
 
 		 129 aa  133  9e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3289  glycine cleavage system protein H  56.56 
 
 		 129 aa  133  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3286  glycine cleavage system protein H  56.56 
 
 		 129 aa  133  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3063  glycine cleavage system protein H  56.56 
 
 		 129 aa  133  9e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0805  glycine cleavage system protein H  56.56 
 
 		 129 aa  133  9e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0782061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3036  glycine cleavage system protein H  56.56 
 
 		 129 aa  133  9e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.197625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3212  glycine cleavage system protein H  56.56 
 
 		 129 aa  133  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0254293  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3391  glycine cleavage system protein H  56.56 
 
 		 129 aa  133  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.317969  normal  0.844228 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02699  hypothetical protein  56.56 
 
 		 129 aa  133  9e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0553776  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3224  glycine cleavage system protein H  56.56 
 
 		 129 aa  133  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3325  glycine cleavage system protein H  56.56 
 
 		 129 aa  133  9e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13860  glycine cleavage system H protein  57.6 
 
 		 128 aa  132  9.999999999999999e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3063  glycine cleavage system protein H  60.16 
 
 		 129 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.210618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3231  glycine cleavage system protein H  56.67 
 
 		 129 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.816191  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0780  glycine cleavage system protein H  60 
 
 		 129 aa  131  3e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3330  glycine cleavage system protein H  60 
 
 		 129 aa  131  3e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.277505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3500  glycine cleavage system protein H  60 
 
 		 129 aa  131  3e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.497243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3302  glycine cleavage system protein H  60.66 
 
 		 129 aa  131  3e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.13973  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0623  glycine cleavage system protein H  59.02 
 
 		 129 aa  130  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0735032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3968  glycine cleavage system protein H  59.35 
 
 		 129 aa  130  5e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0721397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3150  glycine cleavage system protein H  59.32 
 
 		 129 aa  130  6e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000198497  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3210  glycine cleavage system protein H  59.17 
 
 		 129 aa  130  6e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0184338  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0536  glycine cleavage system H protein  52.85 
 
 		 127 aa  130  6.999999999999999e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00862  glycine cleavage system protein H  55.37 
 
 		 129 aa  129  1.0000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5427  glycine cleavage system protein H  56.8 
 
 		 127 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.801429  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1698  glycine cleavage system H protein  54.17 
 
 		 126 aa  129  1.0000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1525  glycine cleavage system H protein  52.5 
 
 		 129 aa  128  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260803 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0712  glycine cleavage system protein H  54.87 
 
 		 122 aa  128  2.0000000000000002e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3674  glycine cleavage system protein H  56.91 
 
 		 129 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2004  glycine cleavage system H protein  57.38 
 
 		 127 aa  128  3e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.829681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2284  glycine cleavage system H protein  53.33 
 
 		 129 aa  128  3e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.868083  hitchhiker  0.0000750772 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1275  glycine cleavage system H protein  55.83 
 
 		 129 aa  127  4.0000000000000003e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.421201  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0736  glycine cleavage system protein H  53.98 
 
 		 122 aa  127  6e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3072  glycine cleavage system protein H  54.47 
 
 		 131 aa  127  7.000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.132267 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1693  glycine cleavage system protein H  49.17 
 
 		 127 aa  126  8.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.418268  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0907  glycine cleavage H-protein  52.89 
 
 		 130 aa  126  9.000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1812  glycine cleavage system protein H  52.46 
 
 		 131 aa  126  1.0000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1612  glycine cleavage system protein H  52.5 
 
 		 127 aa  126  1.0000000000000001e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.645617  normal  0.608002 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3481  glycine cleavage system protein H  53.97 
 
 		 126 aa  126  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1719  glycine cleavage system H protein  53.28 
 
 		 130 aa  125  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.891721 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0834  glycine cleavage system protein H  58.47 
 
 		 129 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5018  glycine cleavage system protein H  55.2 
 
 		 127 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0323678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3363  glycine cleavage system H protein  55.24 
 
 		 127 aa  125  3e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.722606 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27674  predicted protein  52.99 
 
 		 134 aa  124  3e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5253  glycine cleavage system protein H  55.2 
 
 		 127 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0447  glycine cleavage system H protein  55.56 
 
 		 126 aa  124  4.0000000000000003e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.197212  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4859  glycine cleavage system protein H  49.59 
 
 		 127 aa  124  5e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000908449  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4700  glycine cleavage system protein H  49.59 
 
 		 127 aa  124  5e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000213752  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4716  glycine cleavage system protein H  49.59 
 
 		 127 aa  124  5e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000916909  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5100  glycine cleavage system protein H  55.2 
 
 		 127 aa  124  5e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.831636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5228  glycine cleavage system protein H  49.59 
 
 		 127 aa  124  5e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000143615  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5097  glycine cleavage system protein H  49.59 
 
 		 127 aa  124  5e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1650  glycine cleavage system protein H  48.31 
 
 		 127 aa  124  5e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0275395  normal  0.35687 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0436  glycine cleavage system H protein  49.18 
 
 		 126 aa  124  6e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2284  glycine cleavage system protein H  52.42 
 
 		 127 aa  124  6e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.31012  normal  0.75932 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5193  glycine cleavage system protein H  55.2 
 
 		 127 aa  123  7e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.458089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3586  glycine cleavage system protein H  49.59 
 
 		 127 aa  123  7e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000166607  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0051  glycine cleavage system H protein  60.17 
 
 		 127 aa  123  8.000000000000001e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0798  glycine cleavage system protein H  57.28 
 
 		 126 aa  123  8.000000000000001e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00579569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0805  glycine cleavage system protein H  57.28 
 
 		 126 aa  123  8.000000000000001e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000312809  normal  0.950872 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5135  glycine cleavage system protein H  49.59 
 
 		 127 aa  123  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00103553  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5130  glycine cleavage system protein H  49.59 
 
 		 127 aa  123  9e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365083  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0290  glycine cleavage system protein H  49.17 
 
 		 130 aa  123  9e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.148153  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5133  glycine cleavage system protein H  49.59 
 
 		 127 aa  123  9e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000135708  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1903  glycine cleavage system protein H  49.17 
 
 		 130 aa  123  9e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4814  glycine cleavage system protein H  49.59 
 
 		 127 aa  122  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00016491  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3330  glycine cleavage system protein H  52.38 
 
 		 126 aa  122  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.348405  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0832  glycine cleavage system protein H  47.2 
 
 		 126 aa  122  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00486711  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0849  glycine cleavage system protein H  47.2 
 
 		 126 aa  122  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000024227  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1124  glycine cleavage system H protein  52.46 
 
 		 129 aa  122  2e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0339  glycine cleavage system protein H  56.3 
 
 		 130 aa  122  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000111817  normal  0.10942 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0105  glycine cleavage system protein H  49.59 
 
 		 127 aa  122  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000835004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1893  glycine cleavage system protein H  55.96 
 
 		 127 aa  122  2e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.262641 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0676  glycine cleavage system H protein  50.39 
 
 		 127 aa  122  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3298  glycine cleavage system H protein  48.36 
 
 		 129 aa  121  3e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.123967  normal  0.480249 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0811  glycine cleavage system protein H  49.11 
 
 		 130 aa  121  3e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.061834  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0225  glycine cleavage system protein H  48.33 
 
 		 127 aa  121  4e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0929838 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0485  glycine cleavage system protein H  45.6 
 
 		 126 aa  121  4e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0055  glycine cleavage system protein H  47.62 
 
 		 126 aa  120  6e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0953  glycine cleavage system protein H  49.15 
 
 		 126 aa  120  7e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>