More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2347 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2347  glycine cleavage system H protein  100 
 
 		 118 aa  233  5.0000000000000005e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.250825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2298  glycine cleavage system protein H  62.71 
 
 		 118 aa  146  8e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2392  glycine cleavage system H protein  61.34 
 
 		 119 aa  146  1.0000000000000001e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.368043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2194  glycine cleavage system protein H  62.71 
 
 		 118 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0869  glycine cleavage system protein H  62.71 
 
 		 118 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.731856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3621  glycine cleavage system protein H  63.87 
 
 		 120 aa  143  6e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.666557  normal  0.082734 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68860  glycine cleavage system protein H  54.24 
 
 		 129 aa  131  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0213  glycine cleavage system protein H  51.69 
 
 		 129 aa  130  6.999999999999999e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3330  glycine cleavage system protein H  55.46 
 
 		 126 aa  129  9e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.348405  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3481  glycine cleavage system protein H  54.62 
 
 		 126 aa  127  5.0000000000000004e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3739  glycine cleavage system protein H  57.89 
 
 		 121 aa  126  9.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0626114  normal  0.594072 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2210  glycine cleavage system H protein  57.39 
 
 		 121 aa  126  9.000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.194358  normal  0.155334 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0734  glycine cleavage system protein H  55.17 
 
 		 124 aa  126  1.0000000000000001e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.5619  normal  0.0299013 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0131  glycine cleavage system protein H  53.04 
 
 		 125 aa  125  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0116  glycine cleavage system protein H  53.04 
 
 		 125 aa  125  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1732  glycine cleavage system protein H  56.14 
 
 		 121 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32985  glycine cleavage system protein H  53.33 
 
 		 127 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0356565  hitchhiker  0.0000202177 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0317  glycine cleavage system H protein  51.67 
 
 		 128 aa  125  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2720  glycine cleavage system protein H  54.62 
 
 		 129 aa  125  3e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0615009  normal  0.778842 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0854  glycine cleavage system protein H  52.54 
 
 		 120 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0728621  normal  0.0870942 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1183  glycine cleavage system protein H  53.78 
 
 		 120 aa  124  4.0000000000000003e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.157974  normal  0.140639 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2804  glycine cleavage system protein H  52.5 
 
 		 127 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0629199  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3294  glycine cleavage system protein H  52.1 
 
 		 127 aa  124  5e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2684  glycine cleavage system H protein  54.62 
 
 		 123 aa  124  5e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.418167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3527  glycine cleavage system protein H  52.5 
 
 		 120 aa  124  6e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.36925 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0778  glycine cleavage system protein H  53.91 
 
 		 120 aa  124  6e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.068818 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0332  glycine cleavage system protein H  58 
 
 		 129 aa  123  7e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6034  glycine cleavage system protein H  52.5 
 
 		 120 aa  122  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0418539  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0177  glycine cleavage system protein H  51.69 
 
 		 129 aa  122  1e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2253  glycine cleavage system protein H  51.26 
 
 		 120 aa  123  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0487645  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0813  glycine cleavage system protein H  52.5 
 
 		 120 aa  122  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.388148  normal  0.22287 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1017  glycine cleavage system protein H  52.59 
 
 		 122 aa  122  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5193  glycine cleavage system protein H  52.1 
 
 		 127 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.458089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1191  glycine cleavage system protein H  52.94 
 
 		 130 aa  122  2e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3302  glycine cleavage system protein H  52.94 
 
 		 129 aa  122  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.13973  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3063  glycine cleavage system protein H  53.78 
 
 		 129 aa  122  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.210618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0247  glycine cleavage system protein H  51.67 
 
 		 128 aa  122  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1711  glycine cleavage system H protein  51.72 
 
 		 126 aa  121  3e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.147296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5959  glycine cleavage system protein H  52.73 
 
 		 142 aa  121  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.723705  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4267  glycine cleavage system H protein  52.5 
 
 		 120 aa  121  3e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.231851  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2464  glycine cleavage system H protein  54.55 
 
 		 128 aa  121  4e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.239557  normal  0.657503 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1812  glycine cleavage system protein H  53.78 
 
 		 131 aa  121  4e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0142  glycine cleavage system protein H  50.85 
 
 		 126 aa  121  4e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.207968  normal  0.345489 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2758  glycine cleavage system protein H  52.94 
 
 		 130 aa  120  5e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3050  glycine cleavage system protein H  50 
 
 		 126 aa  120  5e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.110388  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47270  Glycine cleavage system H protein  55.45 
 
 		 129 aa  120  5e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.666574  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3968  glycine cleavage system protein H  52.1 
 
 		 129 aa  120  6e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0721397  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02736  glycine cleavage system protein H  52.94 
 
 		 129 aa  120  7e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0429973  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0788  glycine cleavage system H protein  52.94 
 
 		 129 aa  120  7e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471951  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0805  glycine cleavage system protein H  52.94 
 
 		 129 aa  120  7e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0782061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3063  glycine cleavage system protein H  52.94 
 
 		 129 aa  120  7e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3391  glycine cleavage system protein H  52.94 
 
 		 129 aa  120  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.317969  normal  0.844228 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02699  hypothetical protein  52.94 
 
 		 129 aa  120  7e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0553776  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4195  glycine cleavage system protein H  52.94 
 
 		 129 aa  120  7e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3289  glycine cleavage system protein H  52.94 
 
 		 129 aa  120  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3224  glycine cleavage system protein H  52.94 
 
 		 129 aa  120  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3212  glycine cleavage system protein H  52.94 
 
 		 129 aa  120  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0254293  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3325  glycine cleavage system protein H  52.94 
 
 		 129 aa  120  7e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3036  glycine cleavage system protein H  52.94 
 
 		 129 aa  120  7e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.197625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3286  glycine cleavage system protein H  52.94 
 
 		 129 aa  120  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1619  glycine cleavage system protein H  50.88 
 
 		 121 aa  120  8e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.209831  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5018  glycine cleavage system protein H  52.1 
 
 		 127 aa  120  8e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0323678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1543  glycine cleavage system H protein  49.58 
 
 		 126 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.532725  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3060  glycine cleavage system H protein  49.58 
 
 		 126 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3310  glycine cleavage system H protein  49.58 
 
 		 126 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2994  glycine cleavage system H protein  49.58 
 
 		 126 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0128  glycine cleavage system H protein  49.58 
 
 		 126 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3674  glycine cleavage system protein H  51.26 
 
 		 129 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3254  glycine cleavage system H protein  49.58 
 
 		 126 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3927  glycine cleavage system H protein  49.58 
 
 		 126 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0419405  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3210  glycine cleavage system protein H  52.1 
 
 		 129 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0184338  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5100  glycine cleavage system protein H  50.42 
 
 		 127 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.831636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3231  glycine cleavage system protein H  52.1 
 
 		 129 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.816191  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0780  glycine cleavage system protein H  52.1 
 
 		 129 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0158  glycine cleavage system protein H  50.85 
 
 		 126 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3998  glycine cleavage system H protein  49.58 
 
 		 126 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3330  glycine cleavage system protein H  52.1 
 
 		 129 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.277505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0623  glycine cleavage system protein H  52.1 
 
 		 129 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0735032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3150  glycine cleavage system protein H  51.26 
 
 		 129 aa  118  1.9999999999999998e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000198497  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3500  glycine cleavage system protein H  52.1 
 
 		 129 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.497243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0050  glycine cleavage system H protein  58.33 
 
 		 124 aa  118  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.968123  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3618  glycine cleavage system protein H  52.1 
 
 		 129 aa  118  3e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5450  glycine cleavage system protein H  52.63 
 
 		 121 aa  118  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0749655 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2910  glycine cleavage system protein H  50.85 
 
 		 126 aa  118  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3800  glycine cleavage system protein H  52.1 
 
 		 129 aa  118  3e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3676  glycine cleavage system protein H  52.1 
 
 		 129 aa  118  3e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.134478  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0145  glycine cleavage system protein H  50.85 
 
 		 126 aa  118  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0618  glycine cleavage system protein H  52.1 
 
 		 129 aa  118  3e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.475927  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3323  glycine cleavage system protein H  51.26 
 
 		 129 aa  117  3.9999999999999996e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1867  glycine cleavage system H protein  52.63 
 
 		 122 aa  117  3.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0347749  normal  0.181057 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0055  glycine cleavage system protein H  50.42 
 
 		 126 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3436  glycine cleavage system protein H  53.78 
 
 		 135 aa  117  3.9999999999999996e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1719  glycine cleavage system H protein  49.58 
 
 		 130 aa  117  4.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.891721 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5253  glycine cleavage system protein H  49.58 
 
 		 127 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3310  glycine cleavage system protein H  52.94 
 
 		 136 aa  117  7e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3324  glycine cleavage H-protein  48.74 
 
 		 155 aa  117  7e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3881  glycine cleavage system protein H  55.45 
 
 		 126 aa  116  7.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2284  glycine cleavage system protein H  52.94 
 
 		 127 aa  116  9e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.31012  normal  0.75932 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1569  glycine cleavage system protein H  49.12 
 
 		 121 aa  116  9e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108538 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0339  glycine cleavage system protein H  57.69 
 
 		 130 aa  115  9.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000111817  normal  0.10942 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>