More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2805 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2805  glycine cleavage H-protein  100 
 
 		 300 aa  629  1e-179  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0767  glycine cleavage H-protein  34.43 
 
 		 223 aa  120  3.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.64299  normal  0.56936 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1564  glycine cleavage H-protein  37.7 
 
 		 248 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2307  glycine cleavage H-protein  36.65 
 
 		 248 aa  103  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0893702  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1642  glycine cleavage H-protein  36.13 
 
 		 248 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2005  glycine cleavage H-protein  35.03 
 
 		 236 aa  99.4  7e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4278  glycine cleavage H-protein  33.33 
 
 		 231 aa  97.8  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1873  glycine cleavage H-protein  34.46 
 
 		 240 aa  95.9  7e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1958  glycine cleavage H-protein  34.46 
 
 		 240 aa  95.9  7e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.445359  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1804  glycine cleavage H-protein  32.02 
 
 		 233 aa  92.4  8e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.219372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2945  glycine cleavage H-protein  28.34 
 
 		 220 aa  91.3  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.529092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1802  glycine cleavage H-protein  34.08 
 
 		 243 aa  90.1  4e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.484929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4250  glycine cleavage H-protein  32.95 
 
 		 233 aa  85.9  7e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.171545  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4273  glycine cleavage H-protein  32.95 
 
 		 233 aa  85.9  7e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4119  glycine cleavage H-protein  32.95 
 
 		 229 aa  84.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.439092  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2003  glycine cleavage H-protein  30.17 
 
 		 234 aa  78.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0438  glycine cleavage system H protein  36.19 
 
 		 138 aa  77.8  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5357  glycine cleavage system H protein  36.17 
 
 		 126 aa  74.7  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0339  glycine cleavage system protein H  31.71 
 
 		 130 aa  73.6  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000111817  normal  0.10942 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01656  glycine cleavage system protein H  36.79 
 
 		 131 aa  73.6  0.000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.671039  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1960  glycine cleavage H-protein  31.28 
 
 		 234 aa  73.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1124  glycine cleavage system H protein  32 
 
 		 129 aa  73.6  0.000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1875  glycine cleavage H-protein  31.28 
 
 		 234 aa  73.6  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0154  glycine cleavage system protein H  36.46 
 
 		 131 aa  73.2  0.000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.326161  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0135  glycine cleavage system protein H  35.42 
 
 		 131 aa  72.8  0.000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2727  glycine cleavage system H protein  33.6 
 
 		 134 aa  72.8  0.000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.361268  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0605  glycine cleavage system H protein  29.46 
 
 		 132 aa  72.4  0.000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1417  glycine cleavage system H protein  37.5 
 
 		 126 aa  71.6  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3127  glycine cleavage system H protein  34.34 
 
 		 126 aa  71.6  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6623  glycine cleavage system H protein  34.69 
 
 		 127 aa  70.9  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197199 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4998  glycine cleavage system protein H  37.5 
 
 		 126 aa  71.2  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3298  glycine cleavage system H protein  34.04 
 
 		 129 aa  70.9  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.123967  normal  0.480249 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2523  glycine cleavage system protein H  34.69 
 
 		 127 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.85836  normal  0.122501 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12390  glycine cleavage system H protein  31 
 
 		 123 aa  71.2  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00556536  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2776  glycine cleavage system H protein  35.05 
 
 		 134 aa  71.2  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0264905  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3072  glycine cleavage system protein H  36.56 
 
 		 131 aa  71.2  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.132267 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2621  glycine cleavage system protein H  33.67 
 
 		 128 aa  70.5  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.233728  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3608  glycine cleavage system H protein  33.06 
 
 		 140 aa  70.5  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.039586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0811  glycine cleavage system protein H  32.35 
 
 		 130 aa  70.5  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.061834  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2933  glycine cleavage system protein H  33.67 
 
 		 127 aa  70.5  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00141908  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2715  glycine cleavage system protein H  33.67 
 
 		 128 aa  70.5  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1497  glycine cleavage system H protein  36.36 
 
 		 126 aa  70.1  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0051  glycine cleavage system H protein  35.58 
 
 		 127 aa  70.1  0.00000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1244  glycine cleavage system protein H  33.67 
 
 		 128 aa  70.5  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1599  glycine cleavage system H protein  34.55 
 
 		 129 aa  69.7  0.00000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0335982  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3097  glycine cleavage system H protein  34.34 
 
 		 127 aa  69.7  0.00000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.215874  normal  0.0104752 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1612  glycine cleavage system protein H  33.64 
 
 		 127 aa  69.3  0.00000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.645617  normal  0.608002 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1467  glycine cleavage system protein H  33.33 
 
 		 126 aa  69.3  0.00000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0733861 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1901  glycine cleavage system H protein  30.48 
 
 		 137 aa  68.9  0.00000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.119893  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0897  glycine cleavage system H protein  27.13 
 
 		 135 aa  68.9  0.00000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00473644  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28911  glycine cleavage system protein H  31.78 
 
 		 129 aa  68.9  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3050  glycine cleavage system protein H  32 
 
 		 126 aa  68.6  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.110388  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3363  glycine cleavage system H protein  34.04 
 
 		 127 aa  68.9  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.722606 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0231  glycine cleavage system protein H  30.4 
 
 		 126 aa  68.6  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0766  glycine cleavage system H protein  30.17 
 
 		 127 aa  68.6  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18591  glycine cleavage system protein H  27.27 
 
 		 129 aa  68.9  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2758  glycine cleavage system protein H  34.69 
 
 		 130 aa  67.8  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0363  glycine cleavage system H protein  30.69 
 
 		 133 aa  68.2  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1577  glycine cleavage system H protein  30.58 
 
 		 125 aa  67.8  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.731987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0798  glycine cleavage system protein H  31 
 
 		 126 aa  67.4  0.0000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00579569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1563  glycine cleavage system H protein  34.02 
 
 		 129 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000855574  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2876  glycine cleavage system protein H  32.63 
 
 		 131 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1827  glycine cleavage system H protein  35.05 
 
 		 128 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000163584  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0805  glycine cleavage system protein H  31 
 
 		 126 aa  67.4  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000312809  normal  0.950872 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2845  glycine cleavage system protein H  32.63 
 
 		 131 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3183  glycine cleavage system protein H  37.5 
 
 		 126 aa  67.8  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.0000000182392  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2653  glycine cleavage system H protein  34.02 
 
 		 129 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000387916 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3084  glycine cleavage system protein H  32.32 
 
 		 127 aa  68.2  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2889  glycine cleavage system protein H  32.63 
 
 		 131 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.486572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18781  glycine cleavage system protein H  30.3 
 
 		 129 aa  68.2  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2189  glycine cleavage system protein H  28.7 
 
 		 129 aa  67.4  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4011  glycine cleavage system H protein  30.77 
 
 		 134 aa  67  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.109498  normal  0.181592 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1227  glycine cleavage system H protein  35.35 
 
 		 130 aa  67.4  0.0000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2714  glycine cleavage system H protein  34.96 
 
 		 128 aa  67.4  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0651249  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3136  glycine cleavage system protein H  29.6 
 
 		 131 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.323825  normal  0.0420611 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0717  glycine cleavage system H protein  32.08 
 
 		 128 aa  67  0.0000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2539  glycine cleavage system protein H  30.84 
 
 		 129 aa  66.6  0.0000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1850  glycine cleavage system H protein  30.19 
 
 		 129 aa  66.6  0.0000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1761  glycine cleavage system protein H  30.3 
 
 		 129 aa  66.6  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0225  glycine cleavage system protein H  30.71 
 
 		 127 aa  67  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0929838 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18591  glycine cleavage system protein H  29.29 
 
 		 129 aa  66.6  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11856  glycine cleavage system protein H  29.77 
 
 		 134 aa  66.2  0.0000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.795989 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1268  glycine cleavage system protein H  28.57 
 
 		 128 aa  66.2  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1541  glycine cleavage system H protein  32.99 
 
 		 128 aa  66.2  0.0000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001692 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21391  glycine cleavage system protein H  28.44 
 
 		 128 aa  66.2  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0676  glycine cleavage system H protein  33.68 
 
 		 127 aa  66.2  0.0000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1662  glycine cleavage system protein H  29.69 
 
 		 135 aa  66.2  0.0000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.293907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1870  glycine cleavage system protein H  33.68 
 
 		 123 aa  66.2  0.0000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.510899  normal  0.111412 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1540  glycine cleavage system H protein  34.02 
 
 		 133 aa  66.2  0.0000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.186555  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2352  glycine cleavage system H protein  35.05 
 
 		 126 aa  65.9  0.0000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0122881  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14980  glycine cleavage system H protein  31.18 
 
 		 129 aa  65.9  0.0000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0575486  normal  0.572027 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0290  glycine cleavage system protein H  31.13 
 
 		 130 aa  65.5  0.0000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.148153  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4391  glycine cleavage system protein H  33.67 
 
 		 127 aa  65.5  0.0000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.175178 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1903  glycine cleavage system protein H  31.13 
 
 		 130 aa  65.5  0.0000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3403  glycine cleavage system protein H  32.98 
 
 		 131 aa  65.9  0.0000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0792246  normal  0.940944 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4038  glycine cleavage system H protein  36.08 
 
 		 128 aa  65.5  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0664903  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3968  glycine cleavage system protein H  31.63 
 
 		 129 aa  65.1  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0721397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0736  glycine cleavage system protein H  34.41 
 
 		 122 aa  65.1  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0640  glycine cleavage H-protein  31 
 
 		 145 aa  65.1  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0818031 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3674  glycine cleavage system protein H  32.65 
 
 		 129 aa  65.1  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>