More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AnaeK_1873 on replicon NC_011145
Organism: Anaeromyxobacter sp. K



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_1958  glycine cleavage H-protein  99.58 
 
 
240 aa  475  1e-133  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.445359  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1873  glycine cleavage H-protein  100 
 
 
240 aa  475  1e-133  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2005  glycine cleavage H-protein  96.25 
 
 
236 aa  429  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1802  glycine cleavage H-protein  72.54 
 
 
243 aa  331  7.000000000000001e-90  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.484929  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1564  glycine cleavage H-protein  68.8 
 
 
248 aa  329  2e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2307  glycine cleavage H-protein  68.8 
 
 
248 aa  326  2.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0893702  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1642  glycine cleavage H-protein  68.4 
 
 
248 aa  325  5e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0767  glycine cleavage H-protein  37.62 
 
 
223 aa  132  5e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.64299  normal  0.56936 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2945  glycine cleavage H-protein  33.86 
 
 
220 aa  102  6e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.529092  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2805  glycine cleavage H-protein  34.54 
 
 
300 aa  97.8  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.409  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4119  glycine cleavage H-protein  39.64 
 
 
229 aa  84  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.439092  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4273  glycine cleavage H-protein  39.05 
 
 
233 aa  82.8  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4250  glycine cleavage H-protein  39.05 
 
 
233 aa  82.8  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.171545  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4278  glycine cleavage H-protein  35.33 
 
 
231 aa  78.2  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1850  glycine cleavage system H protein  35.9 
 
 
129 aa  73.6  0.000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01656  glycine cleavage system protein H  36.22 
 
 
131 aa  72.8  0.000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.671039  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3072  glycine cleavage system protein H  34.65 
 
 
131 aa  72  0.000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.132267 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3231  glycine cleavage system protein H  34.65 
 
 
129 aa  71.6  0.000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.816191  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0798  glycine cleavage system protein H  33.87 
 
 
126 aa  71.6  0.000000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00579569  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0805  glycine cleavage system protein H  33.87 
 
 
126 aa  71.6  0.000000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000312809  normal  0.950872 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02736  glycine cleavage system protein H  34.65 
 
 
129 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0429973  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0788  glycine cleavage system H protein  34.65 
 
 
129 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471951  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2035  glycine cleavage H-protein  36.29 
 
 
148 aa  71.2  0.00000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3212  glycine cleavage system protein H  34.65 
 
 
129 aa  71.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0254293  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3224  glycine cleavage system protein H  34.65 
 
 
129 aa  71.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226187  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02699  hypothetical protein  34.65 
 
 
129 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0553776  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3289  glycine cleavage system protein H  34.65 
 
 
129 aa  71.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3325  glycine cleavage system protein H  34.65 
 
 
129 aa  71.2  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3063  glycine cleavage system protein H  34.65 
 
 
129 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3286  glycine cleavage system protein H  34.65 
 
 
129 aa  71.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4195  glycine cleavage system protein H  34.65 
 
 
129 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3391  glycine cleavage system protein H  34.65 
 
 
129 aa  71.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.317969  normal  0.844228 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3036  glycine cleavage system protein H  34.65 
 
 
129 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.197625  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0805  glycine cleavage system protein H  34.65 
 
 
129 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0782061  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0247  glycine cleavage system protein H  36.21 
 
 
128 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1497  glycine cleavage system H protein  37.07 
 
 
126 aa  69.3  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0438  glycine cleavage system H protein  32.03 
 
 
138 aa  68.9  0.00000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0605  glycine cleavage system H protein  41.12 
 
 
132 aa  68.9  0.00000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0332  glycine cleavage system protein H  36.21 
 
 
129 aa  68.9  0.00000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5959  glycine cleavage system protein H  37.93 
 
 
142 aa  68.6  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.723705  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0339  glycine cleavage system protein H  39.8 
 
 
130 aa  68.6  0.00000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000111817  normal  0.10942 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13340  glycine cleavage system H protein  36.11 
 
 
127 aa  68.6  0.00000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68860  glycine cleavage system protein H  37.93 
 
 
129 aa  68.6  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0811  glycine cleavage system protein H  34.62 
 
 
130 aa  68.2  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.061834  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0317  glycine cleavage system H protein  37.07 
 
 
128 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47270  Glycine cleavage system H protein  37.07 
 
 
129 aa  67  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.666574  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0252  glycine cleavage system H protein  34.51 
 
 
129 aa  66.6  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.801737  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5018  glycine cleavage system protein H  37.93 
 
 
127 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0323678  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3183  glycine cleavage system protein H  35.43 
 
 
126 aa  66.2  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.0000000182392  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3323  glycine cleavage system protein H  33.07 
 
 
129 aa  65.9  0.0000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5253  glycine cleavage system protein H  37.93 
 
 
127 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3127  glycine cleavage system H protein  36.52 
 
 
126 aa  65.9  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3294  glycine cleavage system protein H  34.19 
 
 
127 aa  65.5  0.0000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3363  glycine cleavage system H protein  36.54 
 
 
127 aa  65.1  0.0000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.722606 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2720  glycine cleavage system protein H  33.62 
 
 
129 aa  65.1  0.0000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0615009  normal  0.778842 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2758  glycine cleavage system protein H  37.5 
 
 
130 aa  64.7  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2352  glycine cleavage system H protein  37.17 
 
 
126 aa  64.7  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0122881  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1076  glycine cleavage system protein H  30.77 
 
 
158 aa  65.1  0.000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000510975  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5427  glycine cleavage system protein H  38.4 
 
 
127 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.801429  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0135  glycine cleavage system protein H  31.58 
 
 
131 aa  65.1  0.000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1124  glycine cleavage system H protein  34.13 
 
 
129 aa  65.1  0.000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3591  glycine cleavage system protein H  36.19 
 
 
129 aa  64.3  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.961592  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00862  glycine cleavage system protein H  36.7 
 
 
129 aa  64.7  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1723  glycine cleavage system protein H  34.19 
 
 
126 aa  64.7  0.000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000363297  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0142  glycine cleavage system protein H  33.98 
 
 
126 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.207968  normal  0.345489 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0051  glycine cleavage system H protein  38.14 
 
 
127 aa  63.5  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1275  glycine cleavage system H protein  29.92 
 
 
129 aa  63.2  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.421201  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0158  glycine cleavage system protein H  32.54 
 
 
126 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1804  glycine cleavage H-protein  31.94 
 
 
233 aa  63.5  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.219372  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0213  glycine cleavage system protein H  31.78 
 
 
129 aa  63.5  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0363  glycine cleavage system H protein  36.21 
 
 
133 aa  63.2  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3097  glycine cleavage system H protein  35.34 
 
 
127 aa  63.2  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.215874  normal  0.0104752 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1901  glycine cleavage system H protein  31.73 
 
 
137 aa  62.4  0.000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.119893  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2910  glycine cleavage system protein H  38.46 
 
 
126 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0145  glycine cleavage system protein H  38.46 
 
 
126 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0154  glycine cleavage system protein H  29.82 
 
 
131 aa  62.8  0.000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.326161  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3324  glycine cleavage H-protein  31.21 
 
 
155 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3150  glycine cleavage system protein H  36.27 
 
 
129 aa  62.4  0.000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000198497  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3302  glycine cleavage system protein H  35.78 
 
 
129 aa  62.4  0.000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.13973  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3927  glycine cleavage system H protein  36.79 
 
 
126 aa  62  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0419405  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3998  glycine cleavage system H protein  36.79 
 
 
126 aa  62  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2994  glycine cleavage system H protein  36.79 
 
 
126 aa  62  0.000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0128  glycine cleavage system H protein  36.79 
 
 
126 aa  62  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3060  glycine cleavage system H protein  36.79 
 
 
126 aa  62  0.000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1543  glycine cleavage system H protein  36.79 
 
 
126 aa  62  0.000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.532725  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3310  glycine cleavage system H protein  36.79 
 
 
126 aa  62  0.000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3063  glycine cleavage system protein H  33.03 
 
 
129 aa  61.2  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.210618  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3254  glycine cleavage system H protein  36.79 
 
 
126 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2577  glycine cleavage system protein H  30.17 
 
 
130 aa  61.6  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0304435  normal  0.0181641 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0132  glycine cleavage system H protein  33.01 
 
 
153 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0144  glycine cleavage system protein H  34.62 
 
 
126 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.87599 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5193  glycine cleavage system protein H  35.34 
 
 
127 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.458089  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0780  glycine cleavage system protein H  34.95 
 
 
129 aa  60.8  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3084  glycine cleavage system protein H  34.75 
 
 
127 aa  60.8  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3210  glycine cleavage system protein H  34.95 
 
 
129 aa  60.8  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0184338  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0834  glycine cleavage system protein H  34.31 
 
 
129 aa  60.8  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3330  glycine cleavage system protein H  34.95 
 
 
129 aa  60.8  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.277505  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0623  glycine cleavage system protein H  34.95 
 
 
129 aa  60.5  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0735032  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3500  glycine cleavage system protein H  34.95 
 
 
129 aa  60.8  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.497243  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2004  glycine cleavage system H protein  34.43 
 
 
127 aa  60.5  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.829681  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>