More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2945 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_2945  glycine cleavage H-protein  100 
 
 		 220 aa  458  9.999999999999999e-129  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.529092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0767  glycine cleavage H-protein  38.57 
 
 		 223 aa  179  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.64299  normal  0.56936 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2005  glycine cleavage H-protein  33.91 
 
 		 236 aa  103  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1802  glycine cleavage H-protein  33.33 
 
 		 243 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.484929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1873  glycine cleavage H-protein  33.33 
 
 		 240 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1958  glycine cleavage H-protein  32.81 
 
 		 240 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.445359  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1564  glycine cleavage H-protein  32.68 
 
 		 248 aa  95.1  8e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2805  glycine cleavage H-protein  28.34 
 
 		 300 aa  91.3  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2307  glycine cleavage H-protein  32.2 
 
 		 248 aa  90.1  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0893702  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1642  glycine cleavage H-protein  32.2 
 
 		 248 aa  90.1  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4278  glycine cleavage H-protein  26.78 
 
 		 231 aa  70.5  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0897  glycine cleavage system H protein  27.56 
 
 		 135 aa  68.6  0.00000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00473644  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1269  glycine cleavage system protein H  24.79 
 
 		 132 aa  65.1  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1300  glycine cleavage system protein H  24.79 
 
 		 132 aa  65.1  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2352  glycine cleavage system H protein  32.69 
 
 		 126 aa  63.9  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0122881  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1094  glycine cleavage system H protein  30.48 
 
 		 127 aa  63.5  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.265813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00862  glycine cleavage system protein H  29.23 
 
 		 129 aa  64.3  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1804  glycine cleavage H-protein  24.32 
 
 		 233 aa  63.5  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.219372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0980  glycine cleavage system H protein  30.48 
 
 		 127 aa  63.5  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.695732  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3591  glycine cleavage system protein H  27.69 
 
 		 129 aa  63.2  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.961592  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0960  glycine cleavage system H protein  30.36 
 
 		 130 aa  63.5  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0811  glycine cleavage system protein H  30.84 
 
 		 130 aa  62.4  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.061834  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13340  glycine cleavage system H protein  30.91 
 
 		 127 aa  62.4  0.000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0131  glycine cleavage system protein H  33.94 
 
 		 125 aa  62  0.000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0116  glycine cleavage system protein H  33.94 
 
 		 125 aa  62  0.000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN00460  glycine dehydrogenase (decarboxylating), putative  30.65 
 
 		 160 aa  62  0.000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.528435  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0764  glycine cleavage system protein H  28.83 
 
 		 126 aa  62  0.000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2018  glycine cleavage system H protein  25.58 
 
 		 132 aa  61.6  0.000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.333643  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1612  glycine cleavage system protein H  29.52 
 
 		 127 aa  62  0.000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.645617  normal  0.608002 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6623  glycine cleavage system H protein  29.25 
 
 		 127 aa  61.6  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197199 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1698  glycine cleavage system H protein  30.19 
 
 		 126 aa  61.6  0.000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1906  glycine cleavage system protein H  30.69 
 
 		 120 aa  61.6  0.000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0411351 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2189  glycine cleavage system protein H  30.28 
 
 		 129 aa  61.2  0.00000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1812  glycine cleavage system protein H  25.24 
 
 		 131 aa  61.2  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1599  glycine cleavage system H protein  25 
 
 		 129 aa  61.2  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0335982  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0953  glycine cleavage system protein H  26.61 
 
 		 126 aa  60.8  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0290  glycine cleavage system protein H  28.97 
 
 		 130 aa  60.8  0.00000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.148153  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3072  glycine cleavage system protein H  28.85 
 
 		 131 aa  60.1  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.132267 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05972  glycine cleavage system protein H  29 
 
 		 126 aa  60.8  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1903  glycine cleavage system protein H  28.97 
 
 		 130 aa  60.8  0.00000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3403  glycine cleavage system protein H  27.62 
 
 		 131 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0792246  normal  0.940944 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4450  glycine cleavage system H protein  32.69 
 
 		 126 aa  60.5  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0536  glycine cleavage system H protein  30.11 
 
 		 127 aa  60.1  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3831  glycine cleavage system protein H  27.35 
 
 		 128 aa  59.7  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.396771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0864  glycine cleavage system protein H  27.35 
 
 		 128 aa  59.7  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.786548  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1654  glycine cleavage system protein H  32.04 
 
 		 126 aa  59.7  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1124  glycine cleavage system H protein  25.71 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5357  glycine cleavage system H protein  28.3 
 
 		 126 aa  60.1  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0868  glycine cleavage system protein H  27.35 
 
 		 128 aa  59.7  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3915  glycine cleavage system H protein  28.3 
 
 		 128 aa  59.7  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1901  glycine cleavage system H protein  22.31 
 
 		 137 aa  59.3  0.00000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.119893  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2036  glycine cleavage system protein H  27.78 
 
 		 129 aa  59.3  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3136  glycine cleavage system protein H  26.05 
 
 		 131 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.323825  normal  0.0420611 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0095  glycine cleavage system H protein  30.77 
 
 		 123 aa  59.3  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2933  glycine cleavage system protein H  29.82 
 
 		 127 aa  59.3  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00141908  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2003  glycine cleavage H-protein  23.29 
 
 		 234 aa  59.3  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28911  glycine cleavage system protein H  27.52 
 
 		 129 aa  59.3  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17961  putative glycine cleavage H-protein  25.69 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2758  glycine cleavage system protein H  30.48 
 
 		 130 aa  58.9  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1827  glycine cleavage system H protein  26.36 
 
 		 128 aa  58.9  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000163584  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3323  glycine cleavage system protein H  23.02 
 
 		 129 aa  58.5  0.00000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4119  glycine cleavage H-protein  25.13 
 
 		 229 aa  58.5  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.439092  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0834  glycine cleavage system protein H  32.65 
 
 		 129 aa  58.5  0.00000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2340  glycine cleavage system H protein  22.81 
 
 		 134 aa  58.2  0.00000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.391703  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4273  glycine cleavage H-protein  25.44 
 
 		 233 aa  58.2  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4250  glycine cleavage H-protein  25.44 
 
 		 233 aa  58.2  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.171545  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2523  glycine cleavage system protein H  26.17 
 
 		 127 aa  58.2  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.85836  normal  0.122501 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1268  glycine cleavage system protein H  25.83 
 
 		 128 aa  57.8  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2539  glycine cleavage system protein H  27.78 
 
 		 129 aa  57.8  0.0000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1850  glycine cleavage system H protein  27.35 
 
 		 129 aa  57.8  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3084  glycine cleavage system protein H  30.7 
 
 		 127 aa  58.2  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13860  glycine cleavage system H protein  28.04 
 
 		 128 aa  57.8  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3608  glycine cleavage system H protein  25.98 
 
 		 140 aa  57.8  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.039586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12390  glycine cleavage system H protein  26.88 
 
 		 123 aa  57.8  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00556536  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3063  glycine cleavage system protein H  27.35 
 
 		 129 aa  57.4  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.210618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18591  glycine cleavage system protein H  25.64 
 
 		 129 aa  57.4  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0135  glycine cleavage system protein H  26.32 
 
 		 131 aa  57.4  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0154  glycine cleavage system protein H  26.92 
 
 		 131 aa  57.4  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.326161  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2761  glycine cleavage system protein H  27.93 
 
 		 130 aa  57  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.982317 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2621  glycine cleavage system protein H  26.17 
 
 		 128 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.233728  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3310  glycine cleavage system protein H  27.36 
 
 		 136 aa  57  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0231  glycine cleavage system protein H  29.06 
 
 		 126 aa  57.4  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1915  glycine cleavage system H protein  28.28 
 
 		 124 aa  57.4  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014329 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2715  glycine cleavage system protein H  26.17 
 
 		 128 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3436  glycine cleavage system protein H  27.36 
 
 		 135 aa  57  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1497  glycine cleavage system H protein  28.7 
 
 		 126 aa  57.4  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0717  glycine cleavage system H protein  24.79 
 
 		 128 aa  57  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2720  glycine cleavage system protein H  26.5 
 
 		 129 aa  57.4  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0615009  normal  0.778842 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3845  glycine cleavage system H protein  23.89 
 
 		 128 aa  56.6  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000233  glycine cleavage system H protein  24.77 
 
 		 126 aa  56.6  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75530  H-protein subunit of glycine cleavage system  25.23 
 
 		 177 aa  56.6  0.0000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.508507 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1244  glycine cleavage system protein H  25.23 
 
 		 128 aa  56.2  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3183  glycine cleavage system protein H  29.73 
 
 		 126 aa  56.2  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.0000000182392  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2776  glycine cleavage system H protein  27.52 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0264905  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0907  glycine cleavage H-protein  24.58 
 
 		 130 aa  55.8  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0839  glycine cleavage system protein H  27.35 
 
 		 130 aa  55.8  0.0000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0332  glycine cleavage system protein H  28.3 
 
 		 129 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2218  glycine cleavage H-protein  24.17 
 
 		 290 aa  55.8  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000131988  hitchhiker  0.0000190613 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1719  glycine cleavage system H protein  26.17 
 
 		 130 aa  55.8  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.891721 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2889  glycine cleavage system protein H  24.37 
 
 		 131 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.486572  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>