More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_1804 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_1804  glycine cleavage H-protein  100 
 
 
233 aa  444  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.219372  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2003  glycine cleavage H-protein  64.22 
 
 
234 aa  281  6.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1960  glycine cleavage H-protein  65.52 
 
 
234 aa  271  5.000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1875  glycine cleavage H-protein  65.09 
 
 
234 aa  270  2e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4278  glycine cleavage H-protein  51.52 
 
 
231 aa  224  7e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4250  glycine cleavage H-protein  46.12 
 
 
233 aa  195  6e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.171545  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4273  glycine cleavage H-protein  46.12 
 
 
233 aa  195  6e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4119  glycine cleavage H-protein  46.49 
 
 
229 aa  189  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.439092  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0767  glycine cleavage H-protein  29.63 
 
 
223 aa  100  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.64299  normal  0.56936 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2805  glycine cleavage H-protein  32.02 
 
 
300 aa  92.8  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.409  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5518  hypothetical protein  33.9 
 
 
155 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63370  hypothetical protein  33.05 
 
 
155 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.117247  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2720  glycine cleavage system protein H  34.62 
 
 
129 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0615009  normal  0.778842 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0618  glycine cleavage system protein H  34.62 
 
 
129 aa  68.9  0.00000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.475927  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3063  glycine cleavage system protein H  35.29 
 
 
129 aa  68.9  0.00000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.210618  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3800  glycine cleavage system protein H  34.62 
 
 
129 aa  68.9  0.00000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3618  glycine cleavage system protein H  34.62 
 
 
129 aa  68.9  0.00000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3676  glycine cleavage system protein H  34.62 
 
 
129 aa  68.9  0.00000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.134478  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0780  glycine cleavage system protein H  33.65 
 
 
129 aa  68.6  0.00000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3330  glycine cleavage system protein H  33.65 
 
 
129 aa  68.6  0.00000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.277505  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3500  glycine cleavage system protein H  33.65 
 
 
129 aa  68.6  0.00000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.497243  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0438  glycine cleavage system H protein  31.58 
 
 
138 aa  67.8  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1497  glycine cleavage system H protein  33.33 
 
 
126 aa  67.8  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0623  glycine cleavage system protein H  33.65 
 
 
129 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0735032  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3150  glycine cleavage system protein H  32.38 
 
 
129 aa  67  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000198497  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3210  glycine cleavage system protein H  32.69 
 
 
129 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0184338  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3294  glycine cleavage system protein H  34.62 
 
 
127 aa  66.6  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0798  glycine cleavage system protein H  33 
 
 
126 aa  66.6  0.0000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00579569  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3302  glycine cleavage system protein H  33.33 
 
 
129 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.13973  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0805  glycine cleavage system protein H  33 
 
 
126 aa  66.6  0.0000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000312809  normal  0.950872 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3231  glycine cleavage system protein H  32.58 
 
 
129 aa  66.2  0.0000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.816191  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0834  glycine cleavage system protein H  32.69 
 
 
129 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2021  glycine cleavage system H protein  33.02 
 
 
128 aa  66.2  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.132774  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02736  glycine cleavage system protein H  32.58 
 
 
129 aa  65.9  0.0000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0429973  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0788  glycine cleavage system H protein  32.58 
 
 
129 aa  65.9  0.0000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471951  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3063  glycine cleavage system protein H  32.58 
 
 
129 aa  65.9  0.0000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3289  glycine cleavage system protein H  32.58 
 
 
129 aa  65.9  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3968  glycine cleavage system protein H  32.35 
 
 
129 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0721397  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3212  glycine cleavage system protein H  32.58 
 
 
129 aa  65.9  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0254293  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4195  glycine cleavage system protein H  32.58 
 
 
129 aa  65.9  0.0000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3325  glycine cleavage system protein H  32.58 
 
 
129 aa  65.9  0.0000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3224  glycine cleavage system protein H  32.58 
 
 
129 aa  65.9  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226187  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3036  glycine cleavage system protein H  32.58 
 
 
129 aa  65.9  0.0000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.197625  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3391  glycine cleavage system protein H  32.58 
 
 
129 aa  65.9  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.317969  normal  0.844228 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3286  glycine cleavage system protein H  32.58 
 
 
129 aa  65.9  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02699  hypothetical protein  32.58 
 
 
129 aa  65.9  0.0000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0553776  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0805  glycine cleavage system protein H  32.58 
 
 
129 aa  65.9  0.0000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0782061  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1124  glycine cleavage system H protein  36.19 
 
 
129 aa  65.5  0.0000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2005  glycine cleavage H-protein  31.94 
 
 
236 aa  65.5  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1417  glycine cleavage system H protein  30.1 
 
 
126 aa  65.1  0.0000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3323  glycine cleavage system protein H  35.29 
 
 
129 aa  64.7  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2945  glycine cleavage H-protein  24.32 
 
 
220 aa  64.7  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.529092  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3674  glycine cleavage system protein H  30.39 
 
 
129 aa  64.7  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0131  glycine cleavage system protein H  32.35 
 
 
125 aa  64.3  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0116  glycine cleavage system protein H  32.35 
 
 
125 aa  64.3  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13860  glycine cleavage system H protein  35.58 
 
 
128 aa  64.3  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0290  glycine cleavage system protein H  29.25 
 
 
130 aa  63.9  0.000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.148153  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2340  glycine cleavage system H protein  32.41 
 
 
134 aa  64.3  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.391703  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1719  glycine cleavage system H protein  30.48 
 
 
130 aa  63.9  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.891721 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1903  glycine cleavage system protein H  29.25 
 
 
130 aa  63.9  0.000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1906  glycine cleavage system protein H  40.21 
 
 
120 aa  63.9  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0411351 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2758  glycine cleavage system protein H  34.31 
 
 
130 aa  64.3  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1893  glycine cleavage system protein H  34.31 
 
 
127 aa  63.9  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.262641 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0766  glycine cleavage system H protein  31.63 
 
 
127 aa  64.3  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1353  glycine cleavage system H protein  29.91 
 
 
125 aa  63.9  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0897  glycine cleavage system H protein  31.37 
 
 
135 aa  63.2  0.000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00473644  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3591  glycine cleavage system protein H  36.27 
 
 
129 aa  63.2  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.961592  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1958  glycine cleavage H-protein  32 
 
 
240 aa  63.5  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.445359  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1599  glycine cleavage system H protein  33.02 
 
 
129 aa  63.5  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0335982  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18781  glycine cleavage system protein H  31.45 
 
 
129 aa  63.2  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1873  glycine cleavage H-protein  32 
 
 
240 aa  63.5  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1612  glycine cleavage system protein H  34.65 
 
 
127 aa  62.8  0.000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.645617  normal  0.608002 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3830  glycine cleavage system H protein  28.83 
 
 
126 aa  62.8  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.741858 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0142  glycine cleavage system protein H  32.04 
 
 
126 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.207968  normal  0.345489 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18591  glycine cleavage system protein H  32.69 
 
 
129 aa  62.8  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1191  glycine cleavage system protein H  33.65 
 
 
130 aa  62.8  0.000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18591  glycine cleavage system protein H  31.45 
 
 
129 aa  62.4  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0676  glycine cleavage system H protein  34.86 
 
 
127 aa  62.4  0.000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2208  glycine cleavage H-protein  30.43 
 
 
145 aa  62  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0665722  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00862  glycine cleavage system protein H  34.31 
 
 
129 aa  61.6  0.000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3845  glycine cleavage system H protein  29.17 
 
 
128 aa  61.2  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0231  glycine cleavage system protein H  29.17 
 
 
126 aa  61.2  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23430  glycine cleavage system H protein  32.5 
 
 
128 aa  61.2  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000556712  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5357  glycine cleavage system H protein  30.39 
 
 
126 aa  61.2  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1944  glycine cleavage system H protein  30.56 
 
 
130 aa  61.6  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000190356 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1020  glycine cleavage system protein H  35.29 
 
 
120 aa  61.2  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000891205  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1216  glycine cleavage system H protein  32.79 
 
 
125 aa  61.2  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00705649 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1619  glycine cleavage system protein H  32.69 
 
 
121 aa  61.6  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.209831  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0447  glycine cleavage system H protein  35 
 
 
126 aa  61.6  0.00000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.197212  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3136  glycine cleavage system protein H  33.67 
 
 
131 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.323825  normal  0.0420611 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0864  glycine cleavage system protein H  33.65 
 
 
128 aa  60.5  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.786548  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2715  glycine cleavage system protein H  31.07 
 
 
128 aa  60.5  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1577  glycine cleavage system H protein  34.62 
 
 
125 aa  60.5  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.731987  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2523  glycine cleavage system protein H  29.25 
 
 
127 aa  60.5  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.85836  normal  0.122501 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1802  glycine cleavage H-protein  37 
 
 
243 aa  60.5  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.484929  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0339  glycine cleavage system protein H  31.13 
 
 
130 aa  60.8  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000111817  normal  0.10942 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0868  glycine cleavage system protein H  33.65 
 
 
128 aa  60.5  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2695  glycine cleavage system protein H  35 
 
 
123 aa  60.5  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1540  glycine cleavage system H protein  30.1 
 
 
133 aa  60.8  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.186555  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3831  glycine cleavage system protein H  33.65 
 
 
128 aa  60.5  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.396771  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>