More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1417 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1417  glycine cleavage system H protein  100 
 
 		 126 aa  261  2e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1719  glycine cleavage system H protein  46.03 
 
 		 130 aa  119  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.891721 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2758  glycine cleavage system protein H  44.44 
 
 		 130 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3618  glycine cleavage system protein H  44.44 
 
 		 129 aa  117  6e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3676  glycine cleavage system protein H  44.44 
 
 		 129 aa  117  6e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.134478  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3800  glycine cleavage system protein H  44.44 
 
 		 129 aa  117  6e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0618  glycine cleavage system protein H  44.44 
 
 		 129 aa  117  6e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.475927  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2523  glycine cleavage system protein H  46.4 
 
 		 127 aa  116  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.85836  normal  0.122501 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3323  glycine cleavage system protein H  41.13 
 
 		 129 aa  116  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0780  glycine cleavage system protein H  44.44 
 
 		 129 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3330  glycine cleavage system protein H  44.44 
 
 		 129 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.277505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0623  glycine cleavage system protein H  44.44 
 
 		 129 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0735032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3500  glycine cleavage system protein H  44.44 
 
 		 129 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.497243  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2004  glycine cleavage system H protein  44.72 
 
 		 127 aa  114  3.9999999999999997e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.829681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3210  glycine cleavage system protein H  44.44 
 
 		 129 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0184338  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1711  glycine cleavage system H protein  41.46 
 
 		 126 aa  114  6e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.147296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6623  glycine cleavage system H protein  39.53 
 
 		 127 aa  113  6.9999999999999995e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197199 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1124  glycine cleavage system H protein  43.65 
 
 		 129 aa  112  1.0000000000000001e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02736  glycine cleavage system protein H  43.81 
 
 		 129 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0429973  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0788  glycine cleavage system H protein  43.81 
 
 		 129 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471951  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3289  glycine cleavage system protein H  43.81 
 
 		 129 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3231  glycine cleavage system protein H  43.81 
 
 		 129 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.816191  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3036  glycine cleavage system protein H  43.81 
 
 		 129 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.197625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3286  glycine cleavage system protein H  43.81 
 
 		 129 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3212  glycine cleavage system protein H  43.81 
 
 		 129 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0254293  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4195  glycine cleavage system protein H  43.81 
 
 		 129 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3325  glycine cleavage system protein H  43.81 
 
 		 129 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3224  glycine cleavage system protein H  43.81 
 
 		 129 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226187  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02699  hypothetical protein  43.81 
 
 		 129 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0553776  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0805  glycine cleavage system protein H  43.81 
 
 		 129 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0782061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3391  glycine cleavage system protein H  43.81 
 
 		 129 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.317969  normal  0.844228 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3063  glycine cleavage system protein H  43.81 
 
 		 129 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0676  glycine cleavage system H protein  38.58 
 
 		 127 aa  111  3e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2284  glycine cleavage system H protein  42.86 
 
 		 129 aa  110  6e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.868083  hitchhiker  0.0000750772 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3150  glycine cleavage system protein H  41.27 
 
 		 129 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000198497  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3097  glycine cleavage system H protein  43.31 
 
 		 127 aa  110  8.000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.215874  normal  0.0104752 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3830  glycine cleavage system H protein  39.53 
 
 		 126 aa  110  8.000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.741858 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3063  glycine cleavage system protein H  40.48 
 
 		 129 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.210618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3968  glycine cleavage system protein H  40.48 
 
 		 129 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0721397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1525  glycine cleavage system H protein  42.15 
 
 		 129 aa  109  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260803 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1191  glycine cleavage system protein H  48.04 
 
 		 130 aa  109  1.0000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3302  glycine cleavage system protein H  40.48 
 
 		 129 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.13973  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3310  glycine cleavage system protein H  45.71 
 
 		 136 aa  108  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3674  glycine cleavage system protein H  39.68 
 
 		 129 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2720  glycine cleavage system protein H  39.68 
 
 		 129 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0615009  normal  0.778842 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4011  glycine cleavage system H protein  43.51 
 
 		 134 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.109498  normal  0.181592 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0834  glycine cleavage system protein H  40.48 
 
 		 129 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0436  glycine cleavage system H protein  36.8 
 
 		 126 aa  107  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14980  glycine cleavage system H protein  41.27 
 
 		 129 aa  107  5e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0575486  normal  0.572027 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4229  glycine cleavage system protein H  46.22 
 
 		 127 aa  107  6e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.012135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4466  glycine cleavage system H protein  39.37 
 
 		 126 aa  107  6e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.332161 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3831  glycine cleavage system protein H  41.94 
 
 		 128 aa  107  6e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.396771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0868  glycine cleavage system protein H  41.94 
 
 		 128 aa  107  6e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0864  glycine cleavage system protein H  41.94 
 
 		 128 aa  107  6e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.786548  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2521  glycine cleavage system H protein  42.86 
 
 		 126 aa  106  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.344987  hitchhiker  0.00701703 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0994  glycine cleavage system protein H  45.38 
 
 		 127 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0225  glycine cleavage system protein H  42.74 
 
 		 127 aa  105  1e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0929838 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2714  glycine cleavage system H protein  44.19 
 
 		 128 aa  106  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0651249  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2715  glycine cleavage system protein H  40.8 
 
 		 128 aa  105  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1244  glycine cleavage system protein H  40 
 
 		 128 aa  105  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2621  glycine cleavage system protein H  40.8 
 
 		 128 aa  105  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.233728  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3436  glycine cleavage system protein H  44.76 
 
 		 135 aa  105  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2348  glycine cleavage system H protein  42.86 
 
 		 134 aa  105  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0332  glycine cleavage system protein H  45.05 
 
 		 129 aa  104  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1577  glycine cleavage system H protein  42.37 
 
 		 125 aa  104  3e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.731987  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2340  glycine cleavage system H protein  40.16 
 
 		 134 aa  105  3e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.391703  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3915  glycine cleavage system H protein  40.32 
 
 		 128 aa  105  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1893  glycine cleavage system protein H  44.23 
 
 		 127 aa  104  4e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.262641 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1698  glycine cleavage system H protein  42.62 
 
 		 126 aa  104  4e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12390  glycine cleavage system H protein  42.61 
 
 		 123 aa  104  5e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00556536  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2055  glycine cleavage system H protein  42.45 
 
 		 127 aa  104  5e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1516  glycine cleavage system H protein  39.52 
 
 		 125 aa  103  6e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0307602  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0717  glycine cleavage system H protein  39.2 
 
 		 128 aa  103  6e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0225  glycine cleavage system H protein  43.65 
 
 		 123 aa  103  7e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000351635  normal  0.835809 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1812  glycine cleavage system protein H  38.1 
 
 		 131 aa  103  7e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23430  glycine cleavage system H protein  39.34 
 
 		 128 aa  103  7e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000556712  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3183  glycine cleavage system protein H  45.63 
 
 		 126 aa  103  8e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.0000000182392  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3127  glycine cleavage system H protein  41.94 
 
 		 126 aa  103  9e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3330  glycine cleavage system protein H  40.94 
 
 		 126 aa  102  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.348405  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0290  glycine cleavage system protein H  37.6 
 
 		 130 aa  103  1e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.148153  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1903  glycine cleavage system protein H  37.6 
 
 		 130 aa  103  1e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13340  glycine cleavage system H protein  39.02 
 
 		 127 aa  103  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1497  glycine cleavage system H protein  46.49 
 
 		 126 aa  103  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3481  glycine cleavage system protein H  40.16 
 
 		 126 aa  103  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3298  glycine cleavage system H protein  40 
 
 		 129 aa  102  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.123967  normal  0.480249 
 
 
-
 
NC_002950  PG0950  glycine cleavage system protein H  45.28 
 
 		 126 aa  102  2e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.131104 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5018  glycine cleavage system protein H  40.94 
 
 		 127 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0323678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2776  glycine cleavage system H protein  39.84 
 
 		 134 aa  102  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0264905  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0984  glycine cleavage system H protein  39.52 
 
 		 135 aa  102  2e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.052829  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0798  glycine cleavage system protein H  42.5 
 
 		 126 aa  102  2e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00579569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3050  glycine cleavage system protein H  44.07 
 
 		 126 aa  102  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.110388  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0805  glycine cleavage system protein H  42.5 
 
 		 126 aa  102  2e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000312809  normal  0.950872 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0623  glycine cleavage system protein H  43.69 
 
 		 130 aa  102  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1612  glycine cleavage system protein H  40.65 
 
 		 127 aa  102  2e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.645617  normal  0.608002 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0989  glycine cleavage system protein H  42.98 
 
 		 127 aa  101  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.236065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1944  glycine cleavage system H protein  39.68 
 
 		 130 aa  101  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000190356 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1650  glycine cleavage system protein H  41.41 
 
 		 127 aa  101  3e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0275395  normal  0.35687 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1026  glycine cleavage system protein H  42.98 
 
 		 127 aa  101  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.946369 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4391  glycine cleavage system protein H  44.63 
 
 		 127 aa  100  5e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.175178 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0591  glycine cleavage system H protein  37.3 
 
 		 126 aa  100  5e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0600985 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>