More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_4119 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_4119  glycine cleavage H-protein  100 
 
 		 229 aa  441  1e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.439092  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4273  glycine cleavage H-protein  96.51 
 
 		 233 aa  430  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4250  glycine cleavage H-protein  96.51 
 
 		 233 aa  430  1e-120  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.171545  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4278  glycine cleavage H-protein  58.52 
 
 		 231 aa  255  4e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2003  glycine cleavage H-protein  44.35 
 
 		 234 aa  171  9e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1804  glycine cleavage H-protein  52.33 
 
 		 233 aa  171  1e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.219372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1960  glycine cleavage H-protein  43.48 
 
 		 234 aa  159  4e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1875  glycine cleavage H-protein  43.04 
 
 		 234 aa  157  1e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0767  glycine cleavage H-protein  33.94 
 
 		 223 aa  89.7  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.64299  normal  0.56936 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2005  glycine cleavage H-protein  39.29 
 
 		 236 aa  85.9  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2805  glycine cleavage H-protein  32.95 
 
 		 300 aa  84.7  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1958  glycine cleavage H-protein  39.64 
 
 		 240 aa  84.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.445359  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1873  glycine cleavage H-protein  39.64 
 
 		 240 aa  84.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1564  glycine cleavage H-protein  39.88 
 
 		 248 aa  83.2  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1642  glycine cleavage H-protein  38.55 
 
 		 248 aa  79.3  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0290  glycine cleavage system protein H  32.41 
 
 		 130 aa  78.6  0.00000000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.148153  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1353  glycine cleavage system H protein  33.64 
 
 		 125 aa  78.6  0.00000000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1903  glycine cleavage system protein H  32.41 
 
 		 130 aa  78.6  0.00000000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1017  glycine cleavage system protein H  36.7 
 
 		 122 aa  77  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00862  glycine cleavage system protein H  37.74 
 
 		 129 aa  76.3  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1851  glycine cleavage system protein H  38.68 
 
 		 123 aa  76.3  0.0000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0324659  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2307  glycine cleavage H-protein  37.95 
 
 		 248 aa  75.9  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0893702  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2695  glycine cleavage system protein H  37.38 
 
 		 123 aa  75.1  0.0000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02736  glycine cleavage system protein H  33.02 
 
 		 129 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0429973  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0788  glycine cleavage system H protein  33.02 
 
 		 129 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471951  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3286  glycine cleavage system protein H  33.02 
 
 		 129 aa  74.7  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3063  glycine cleavage system protein H  33.02 
 
 		 129 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0805  glycine cleavage system protein H  33.02 
 
 		 129 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0782061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3231  glycine cleavage system protein H  33.02 
 
 		 129 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.816191  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3325  glycine cleavage system protein H  33.02 
 
 		 129 aa  74.7  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3289  glycine cleavage system protein H  33.02 
 
 		 129 aa  74.7  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3212  glycine cleavage system protein H  33.02 
 
 		 129 aa  74.7  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0254293  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02699  hypothetical protein  33.02 
 
 		 129 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0553776  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3391  glycine cleavage system protein H  33.02 
 
 		 129 aa  74.7  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.317969  normal  0.844228 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3036  glycine cleavage system protein H  33.02 
 
 		 129 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.197625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3224  glycine cleavage system protein H  33.02 
 
 		 129 aa  74.7  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4195  glycine cleavage system protein H  33.02 
 
 		 129 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0726  glycine cleavage system protein H  38.1 
 
 		 122 aa  73.9  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3063  glycine cleavage system protein H  36.63 
 
 		 129 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.210618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0680  glycine cleavage system protein H  38.1 
 
 		 122 aa  73.9  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13860  glycine cleavage system H protein  34.78 
 
 		 128 aa  73.6  0.000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0438  glycine cleavage system H protein  30.6 
 
 		 138 aa  73.2  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3591  glycine cleavage system protein H  37.25 
 
 		 129 aa  73.2  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.961592  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0780  glycine cleavage system protein H  33.98 
 
 		 129 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0447  glycine cleavage system H protein  31.3 
 
 		 126 aa  72.8  0.000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.197212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3330  glycine cleavage system protein H  33.98 
 
 		 129 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.277505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3500  glycine cleavage system protein H  33.98 
 
 		 129 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.497243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3210  glycine cleavage system protein H  34.65 
 
 		 129 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0184338  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1850  glycine cleavage system H protein  33.96 
 
 		 129 aa  72.4  0.000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1802  glycine cleavage H-protein  36.2 
 
 		 243 aa  72  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.484929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0231  glycine cleavage system protein H  28.89 
 
 		 126 aa  70.5  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3863  glycine cleavage system protein H  35.85 
 
 		 122 aa  70.5  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.394687  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0834  glycine cleavage system protein H  33.04 
 
 		 129 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0623  glycine cleavage system protein H  33.01 
 
 		 129 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0735032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3323  glycine cleavage system protein H  33.02 
 
 		 129 aa  70.5  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2720  glycine cleavage system protein H  31.25 
 
 		 129 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0615009  normal  0.778842 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3618  glycine cleavage system protein H  33.01 
 
 		 129 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0618  glycine cleavage system protein H  33.01 
 
 		 129 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.475927  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3800  glycine cleavage system protein H  33.01 
 
 		 129 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3676  glycine cleavage system protein H  33.01 
 
 		 129 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.134478  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1906  glycine cleavage system protein H  37.62 
 
 		 120 aa  70.1  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0411351 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0798  glycine cleavage system protein H  33.98 
 
 		 126 aa  69.7  0.00000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00579569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0805  glycine cleavage system protein H  33.98 
 
 		 126 aa  69.7  0.00000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000312809  normal  0.950872 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3302  glycine cleavage system protein H  32.14 
 
 		 129 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.13973  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3968  glycine cleavage system protein H  31.25 
 
 		 129 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0721397  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2004  glycine cleavage system H protein  34.95 
 
 		 127 aa  69.3  0.00000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.829681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3674  glycine cleavage system protein H  29.46 
 
 		 129 aa  68.6  0.00000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0131  glycine cleavage system protein H  33.61 
 
 		 125 aa  68.2  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0116  glycine cleavage system protein H  33.61 
 
 		 125 aa  68.2  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0907  glycine cleavage H-protein  30.1 
 
 		 130 aa  68.2  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1569  glycine cleavage system protein H  34.31 
 
 		 121 aa  67.8  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108538 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3150  glycine cleavage system protein H  31.07 
 
 		 129 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000198497  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2714  glycine cleavage system H protein  34.62 
 
 		 128 aa  68.2  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0651249  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1216  glycine cleavage system H protein  33.33 
 
 		 125 aa  67  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00705649 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2758  glycine cleavage system protein H  37.25 
 
 		 130 aa  67.4  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1711  glycine cleavage system H protein  34.62 
 
 		 126 aa  67.4  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.147296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0712  glycine cleavage system protein H  26.45 
 
 		 122 aa  66.6  0.0000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1563  glycine cleavage system H protein  32.41 
 
 		 129 aa  65.9  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000855574  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2653  glycine cleavage system H protein  32.41 
 
 		 129 aa  65.9  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000387916 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1124  glycine cleavage system H protein  37.25 
 
 		 129 aa  66.2  0.0000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1095  glycine cleavage system protein H  30.43 
 
 		 122 aa  66.2  0.0000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.171201  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6623  glycine cleavage system H protein  27.18 
 
 		 127 aa  66.2  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197199 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3621  glycine cleavage system protein H  32.74 
 
 		 120 aa  65.9  0.0000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.666557  normal  0.082734 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0960  glycine cleavage system H protein  32.99 
 
 		 130 aa  65.9  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2621  glycine cleavage system protein H  32.46 
 
 		 128 aa  65.9  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.233728  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2715  glycine cleavage system protein H  32.46 
 
 		 128 aa  65.9  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0953  glycine cleavage system protein H  29.46 
 
 		 126 aa  65.5  0.0000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5018  glycine cleavage system protein H  37.82 
 
 		 127 aa  65.5  0.0000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0323678  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3436  glycine cleavage system protein H  30.25 
 
 		 135 aa  65.5  0.0000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0736  glycine cleavage system protein H  25.62 
 
 		 122 aa  65.5  0.0000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0766  glycine cleavage system H protein  32.32 
 
 		 127 aa  65.9  0.0000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3097  glycine cleavage system H protein  34.51 
 
 		 127 aa  65.5  0.0000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.215874  normal  0.0104752 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3608  glycine cleavage system H protein  30.77 
 
 		 140 aa  65.1  0.0000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.039586  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2092  glycine cleavage system protein H  33.98 
 
 		 120 aa  65.1  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.206967  normal  0.370959 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3743  glycine cleavage system H protein  30.1 
 
 		 125 aa  65.1  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.155158 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0868  glycine cleavage system protein H  31.67 
 
 		 128 aa  64.7  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1599  glycine cleavage system H protein  32.71 
 
 		 129 aa  64.3  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0335982  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0897  glycine cleavage system H protein  26.47 
 
 		 135 aa  65.1  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00473644  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1244  glycine cleavage system protein H  32.35 
 
 		 128 aa  64.3  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3831  glycine cleavage system protein H  31.67 
 
 		 128 aa  64.7  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.396771  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>