More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_2003 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_2003  glycine cleavage H-protein  100 
 
 		 234 aa  454  1e-127  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1960  glycine cleavage H-protein  96.15 
 
 		 234 aa  402  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1875  glycine cleavage H-protein  95.73 
 
 		 234 aa  400  1e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1804  glycine cleavage H-protein  64.22 
 
 		 233 aa  264  1e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.219372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4278  glycine cleavage H-protein  48.28 
 
 		 231 aa  212  3.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4250  glycine cleavage H-protein  43.83 
 
 		 233 aa  183  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.171545  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4273  glycine cleavage H-protein  43.83 
 
 		 233 aa  183  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4119  glycine cleavage H-protein  44.35 
 
 		 229 aa  179  4e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.439092  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2805  glycine cleavage H-protein  30.17 
 
 		 300 aa  79  0.00000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0767  glycine cleavage H-protein  26.55 
 
 		 223 aa  74.7  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.64299  normal  0.56936 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1599  glycine cleavage system H protein  34.86 
 
 		 129 aa  67  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0335982  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1497  glycine cleavage system H protein  35.85 
 
 		 126 aa  67.4  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1563  glycine cleavage system H protein  29.85 
 
 		 129 aa  65.9  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000855574  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2653  glycine cleavage system H protein  29.85 
 
 		 129 aa  65.9  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000387916 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3063  glycine cleavage system protein H  34.62 
 
 		 129 aa  65.5  0.0000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.210618  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0780  glycine cleavage system protein H  32.08 
 
 		 129 aa  65.1  0.0000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3330  glycine cleavage system protein H  32.08 
 
 		 129 aa  65.1  0.0000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.277505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3500  glycine cleavage system protein H  32.08 
 
 		 129 aa  65.1  0.0000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.497243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2720  glycine cleavage system protein H  32.08 
 
 		 129 aa  65.1  0.0000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0615009  normal  0.778842 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0676  glycine cleavage system H protein  29.27 
 
 		 127 aa  64.7  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3210  glycine cleavage system protein H  32.38 
 
 		 129 aa  64.7  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0184338  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3150  glycine cleavage system protein H  32.08 
 
 		 129 aa  64.3  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000198497  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5518  hypothetical protein  33.61 
 
 		 155 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0973  glycine cleavage H-protein  37.62 
 
 		 144 aa  63.9  0.000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.714694  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0834  glycine cleavage system protein H  33.02 
 
 		 129 aa  63.5  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1903  glycine cleavage system protein H  28.7 
 
 		 130 aa  63.5  0.000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0290  glycine cleavage system protein H  28.7 
 
 		 130 aa  63.5  0.000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.148153  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0960  glycine cleavage system H protein  31.96 
 
 		 130 aa  63.2  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3323  glycine cleavage system protein H  34.91 
 
 		 129 aa  63.2  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3231  glycine cleavage system protein H  32.26 
 
 		 129 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.816191  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1481  glycine cleavage system protein H  36.19 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.14622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0623  glycine cleavage system protein H  31.13 
 
 		 129 aa  63.5  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0735032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1755  glycine cleavage system protein H  34.02 
 
 		 129 aa  63.2  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.311333  normal  0.186325 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02736  glycine cleavage system protein H  32.26 
 
 		 129 aa  63.2  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0429973  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0788  glycine cleavage system H protein  32.26 
 
 		 129 aa  63.2  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471951  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3391  glycine cleavage system protein H  32.26 
 
 		 129 aa  63.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.317969  normal  0.844228 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02699  hypothetical protein  32.26 
 
 		 129 aa  63.2  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0553776  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4195  glycine cleavage system protein H  32.26 
 
 		 129 aa  63.2  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0805  glycine cleavage system protein H  32.26 
 
 		 129 aa  63.2  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0782061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3212  glycine cleavage system protein H  32.26 
 
 		 129 aa  63.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0254293  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3325  glycine cleavage system protein H  32.26 
 
 		 129 aa  63.2  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3286  glycine cleavage system protein H  32.26 
 
 		 129 aa  63.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3224  glycine cleavage system protein H  32.26 
 
 		 129 aa  63.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3036  glycine cleavage system protein H  32.26 
 
 		 129 aa  63.2  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.197625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3063  glycine cleavage system protein H  32.26 
 
 		 129 aa  63.2  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0766  glycine cleavage system H protein  32.67 
 
 		 127 aa  62.8  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3289  glycine cleavage system protein H  32.26 
 
 		 129 aa  63.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3676  glycine cleavage system protein H  31.13 
 
 		 129 aa  62.4  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.134478  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3618  glycine cleavage system protein H  31.13 
 
 		 129 aa  62.4  0.000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0618  glycine cleavage system protein H  31.13 
 
 		 129 aa  62.8  0.000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.475927  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3134  glycine cleavage H-protein  37.27 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4011  glycine cleavage system H protein  33.04 
 
 		 134 aa  62.8  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.109498  normal  0.181592 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1095  glycine cleavage system protein H  31.25 
 
 		 122 aa  62.8  0.000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.171201  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3800  glycine cleavage system protein H  31.13 
 
 		 129 aa  62.4  0.000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18781  glycine cleavage system protein H  28 
 
 		 129 aa  62.4  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2018  glycine cleavage system H protein  31.19 
 
 		 132 aa  62  0.000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.333643  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1577  glycine cleavage system H protein  33.67 
 
 		 125 aa  61.6  0.000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.731987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1107  glycine cleavage system H protein  35.05 
 
 		 126 aa  61.6  0.000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18591  glycine cleavage system protein H  28 
 
 		 129 aa  61.2  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0726  glycine cleavage system protein H  31.9 
 
 		 122 aa  61.2  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0131  glycine cleavage system protein H  33.01 
 
 		 125 aa  61.2  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0116  glycine cleavage system protein H  33.01 
 
 		 125 aa  61.2  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0680  glycine cleavage system protein H  31.9 
 
 		 122 aa  61.2  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1850  glycine cleavage system H protein  33.98 
 
 		 129 aa  61.2  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6623  glycine cleavage system H protein  28.04 
 
 		 127 aa  61.2  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197199 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63370  hypothetical protein  33.05 
 
 		 155 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.117247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6247  glycine cleavage system H protein  34.65 
 
 		 127 aa  60.8  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.150459  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0533  glycine cleavage system H protein  33.65 
 
 		 121 aa  60.5  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.412806 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3830  glycine cleavage system H protein  27.68 
 
 		 126 aa  60.8  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.741858 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2348  glycine cleavage system H protein  29.57 
 
 		 134 aa  60.8  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2175  glycine cleavage H-protein  30.97 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000381106 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2547  glycine cleavage system H protein, putative  30.97 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1761  glycine cleavage system protein H  27.2 
 
 		 129 aa  60.1  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1906  glycine cleavage system protein H  35.51 
 
 		 120 aa  60.1  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0411351 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0638  glycine cleavage H-protein  28.68 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0575537 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2021  glycine cleavage system H protein  30.77 
 
 		 128 aa  60.1  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.132774  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0897  glycine cleavage system H protein  25.96 
 
 		 135 aa  60.1  0.00000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00473644  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1746  glycine cleavage H-protein  33.63 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.342973  normal  0.262336 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2945  glycine cleavage H-protein  23.29 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.529092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5357  glycine cleavage system H protein  30.08 
 
 		 126 aa  59.3  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1353  glycine cleavage system H protein  28.97 
 
 		 125 aa  59.3  0.00000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3831  glycine cleavage system protein H  33.02 
 
 		 128 aa  59.3  0.00000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.396771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0864  glycine cleavage system protein H  33.02 
 
 		 128 aa  59.3  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.786548  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0868  glycine cleavage system protein H  33.02 
 
 		 128 aa  59.3  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1662  glycine cleavage system protein H  28.16 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.293907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75530  H-protein subunit of glycine cleavage system  32.67 
 
 		 177 aa  58.9  0.00000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.508507 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0798  glycine cleavage system protein H  29.41 
 
 		 126 aa  58.5  0.00000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00579569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1020  glycine cleavage system protein H  32.67 
 
 		 120 aa  58.5  0.00000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000891205  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0839  glycine cleavage system protein H  34.58 
 
 		 130 aa  58.5  0.00000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0805  glycine cleavage system protein H  29.41 
 
 		 126 aa  58.5  0.00000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000312809  normal  0.950872 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3591  glycine cleavage system protein H  34.62 
 
 		 129 aa  58.5  0.00000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.961592  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1328  glycine cleavage system H protein  31 
 
 		 126 aa  58.5  0.00000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2523  glycine cleavage system protein H  30.84 
 
 		 127 aa  58.5  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.85836  normal  0.122501 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2714  glycine cleavage system H protein  33.33 
 
 		 128 aa  58.5  0.00000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0651249  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2776  glycine cleavage system H protein  35.19 
 
 		 134 aa  57.8  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0264905  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0438  glycine cleavage system H protein  31.25 
 
 		 138 aa  58.2  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2340  glycine cleavage system H protein  32.11 
 
 		 134 aa  58.2  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.391703  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1076  glycine cleavage system protein H  29.91 
 
 		 158 aa  57.4  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000510975  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0447  glycine cleavage system H protein  31 
 
 		 126 aa  57  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.197212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2758  glycine cleavage system protein H  32.54 
 
 		 130 aa  57  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>