More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0973 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0973  glycine cleavage H-protein  100 
 
 		 144 aa  289  1e-77  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.714694  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0640  glycine cleavage H-protein  50 
 
 		 145 aa  140  4e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0818031 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2208  glycine cleavage H-protein  48.59 
 
 		 145 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0665722  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1073  glycine cleavage system protein H  46 
 
 		 148 aa  132  1.9999999999999998e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000237871  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2175  glycine cleavage H-protein  47.18 
 
 		 145 aa  128  3e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000381106 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2547  glycine cleavage system H protein, putative  47.18 
 
 		 145 aa  128  3e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0438  glycine cleavage system H protein  48.55 
 
 		 138 aa  127  8.000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2869  glycine cleavage system H protein, putative  43.15 
 
 		 148 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2490  glycine cleavage H-protein  43.15 
 
 		 148 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1076  glycine cleavage system protein H  38.85 
 
 		 158 aa  115  1.9999999999999998e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000510975  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2035  glycine cleavage H-protein  41.84 
 
 		 148 aa  113  6.9999999999999995e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3134  glycine cleavage H-protein  41.26 
 
 		 150 aa  114  6.9999999999999995e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1481  glycine cleavage system protein H  41.13 
 
 		 148 aa  112  1.0000000000000001e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.14622  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1746  glycine cleavage H-protein  37.76 
 
 		 150 aa  103  7e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.342973  normal  0.262336 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1711  glycine cleavage system H protein  45.11 
 
 		 126 aa  101  3e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.147296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1570  glycine cleavage H-protein  41.03 
 
 		 137 aa  101  3e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0137365 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2210  glycine cleavage H-protein  38.46 
 
 		 148 aa  100  6e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00775002  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0638  glycine cleavage H-protein  37.41 
 
 		 148 aa  99  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0575537 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0974  glycine cleavage H-protein  36.17 
 
 		 158 aa  96.7  1e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.357877  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2177  glycine cleavage H-protein  38.46 
 
 		 148 aa  95.5  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000031691 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2549  glycine cleavage system protein H, putative  38.46 
 
 		 148 aa  95.5  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2715  glycine cleavage system protein H  39.85 
 
 		 128 aa  94.4  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2621  glycine cleavage system protein H  39.85 
 
 		 128 aa  94.4  5e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.233728  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0897  glycine cleavage system H protein  33.09 
 
 		 135 aa  94.4  5e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00473644  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1244  glycine cleavage system protein H  40.6 
 
 		 128 aa  93.6  8e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2523  glycine cleavage system protein H  40.6 
 
 		 127 aa  93.2  9e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.85836  normal  0.122501 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2004  glycine cleavage system H protein  43.61 
 
 		 127 aa  92  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.829681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2869  glycine cleavage system protein H  37.59 
 
 		 129 aa  92  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00862  glycine cleavage system protein H  46.3 
 
 		 129 aa  91.3  5e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2078  glycine cleavage H-protein  36.94 
 
 		 140 aa  89.7  1e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0620  glycine cleavage system protein H  45.22 
 
 		 127 aa  90.1  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1497  glycine cleavage system H protein  43.69 
 
 		 126 aa  89.7  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3183  glycine cleavage system protein H  43.81 
 
 		 126 aa  89  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.0000000182392  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3591  glycine cleavage system protein H  44.14 
 
 		 129 aa  89  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.961592  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5357  glycine cleavage system H protein  40.46 
 
 		 126 aa  88.2  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1467  glycine cleavage system protein H  45.38 
 
 		 126 aa  88.6  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0733861 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0252  glycine cleavage system H protein  43.64 
 
 		 129 aa  88.2  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.801737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2845  glycine cleavage system protein H  43.9 
 
 		 131 aa  88.6  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2889  glycine cleavage system protein H  43.9 
 
 		 131 aa  88.6  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.486572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2758  glycine cleavage system protein H  44.85 
 
 		 130 aa  88.2  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2876  glycine cleavage system protein H  43.9 
 
 		 131 aa  88.6  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4864  glycine cleavage system H protein  39.25 
 
 		 128 aa  87.4  6e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2018  glycine cleavage system H protein  37.88 
 
 		 132 aa  87  7e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.333643  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1124  glycine cleavage system H protein  42.37 
 
 		 129 aa  87  9e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11856  glycine cleavage system protein H  42.11 
 
 		 134 aa  85.9  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.795989 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1901  glycine cleavage system H protein  37.01 
 
 		 137 aa  85.9  2e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.119893  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0447  glycine cleavage system H protein  42.45 
 
 		 126 aa  85.5  2e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.197212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0985  glycine cleavage system H protein  44.55 
 
 		 132 aa  85.1  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00310181  hitchhiker  0.00751565 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0152  glycine cleavage system H protein  39.09 
 
 		 130 aa  85.1  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1893  glycine cleavage system protein H  40.57 
 
 		 127 aa  84.7  4e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.262641 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3136  glycine cleavage system protein H  42.02 
 
 		 131 aa  84  6e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.323825  normal  0.0420611 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1599  glycine cleavage system H protein  37.78 
 
 		 129 aa  84  6e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0335982  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1227  glycine cleavage system H protein  45.63 
 
 		 130 aa  84  7e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0798  glycine cleavage system protein H  39.34 
 
 		 126 aa  83.6  8e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00579569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0805  glycine cleavage system protein H  39.34 
 
 		 126 aa  83.6  8e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000312809  normal  0.950872 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2021  glycine cleavage system H protein  36.84 
 
 		 128 aa  83.6  8e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.132774  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3403  glycine cleavage system protein H  42.86 
 
 		 131 aa  83.6  9e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0792246  normal  0.940944 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01205  glycine cleavage system protein H  38.1 
 
 		 125 aa  83.2  0.000000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0862464  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13340  glycine cleavage system H protein  42.73 
 
 		 127 aa  82.8  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1577  glycine cleavage system H protein  42.86 
 
 		 125 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.731987  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1612  glycine cleavage system protein H  41.51 
 
 		 127 aa  83.2  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.645617  normal  0.608002 
 
 
-
 
NC_002950  PG0950  glycine cleavage system protein H  40.78 
 
 		 126 aa  82.4  0.000000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.131104 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1563  glycine cleavage system H protein  37.12 
 
 		 129 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000855574  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1698  glycine cleavage system H protein  45.54 
 
 		 126 aa  82.4  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3830  glycine cleavage system H protein  38.84 
 
 		 126 aa  82.4  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.741858 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1516  glycine cleavage system H protein  40.34 
 
 		 125 aa  82.4  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0307602  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2776  glycine cleavage system H protein  42.45 
 
 		 134 aa  82.8  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0264905  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2653  glycine cleavage system H protein  37.12 
 
 		 129 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000387916 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4038  glycine cleavage system H protein  39.52 
 
 		 128 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0664903  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3323  glycine cleavage system protein H  42.99 
 
 		 129 aa  82.4  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0960  glycine cleavage system H protein  41.07 
 
 		 130 aa  81.6  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1719  glycine cleavage system H protein  43.69 
 
 		 130 aa  81.6  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.891721 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0231  glycine cleavage system protein H  40.31 
 
 		 126 aa  81.6  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1017  glycine cleavage system protein H  43.3 
 
 		 122 aa  81.6  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4466  glycine cleavage system H protein  41.35 
 
 		 126 aa  82  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.332161 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4142  glycine cleavage system H protein  38.89 
 
 		 124 aa  81.6  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6623  glycine cleavage system H protein  39.34 
 
 		 127 aa  81.3  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197199 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0689  glycine cleavage system protein H  37.7 
 
 		 125 aa  81.6  0.000000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.904294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3755  glycine cleavage system H protein  43.81 
 
 		 128 aa  81.3  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.301262  normal  0.144879 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3915  glycine cleavage system H protein  41.12 
 
 		 128 aa  80.9  0.000000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1693  glycine cleavage system protein H  35.82 
 
 		 127 aa  80.9  0.000000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.418268  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1827  glycine cleavage system H protein  41.58 
 
 		 128 aa  80.9  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000163584  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1619  glycine cleavage system protein H  44.33 
 
 		 121 aa  81.3  0.000000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.209831  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4998  glycine cleavage system protein H  45.54 
 
 		 126 aa  80.9  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4450  glycine cleavage system H protein  36.45 
 
 		 126 aa  80.9  0.000000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1525  glycine cleavage system H protein  36.36 
 
 		 129 aa  80.5  0.000000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260803 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0055  glycine cleavage system protein H  40.5 
 
 		 126 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3608  glycine cleavage system H protein  35.88 
 
 		 140 aa  80.9  0.000000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.039586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0030  glycine cleavage system protein H  39.42 
 
 		 126 aa  80.5  0.000000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.166486  normal  0.0193025 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1156  glycine cleavage system protein H  38.98 
 
 		 131 aa  80.5  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1662  glycine cleavage system protein H  41.59 
 
 		 135 aa  80.5  0.000000000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.293907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2200  glycine cleavage system protein H  48.91 
 
 		 125 aa  80.5  0.000000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.330883 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1353  glycine cleavage system H protein  40.59 
 
 		 125 aa  80.5  0.000000000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2348  glycine cleavage system H protein  39.82 
 
 		 134 aa  80.1  0.000000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1417  glycine cleavage system H protein  38.05 
 
 		 126 aa  79.3  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0290  glycine cleavage system protein H  38.89 
 
 		 130 aa  79.7  0.00000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.148153  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0187  glycine cleavage system H protein  36.19 
 
 		 126 aa  79.7  0.00000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.717665  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0533  glycine cleavage system H protein  46.46 
 
 		 121 aa  79.7  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.412806 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2036  glycine cleavage system protein H  38.68 
 
 		 129 aa  80.1  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3298  glycine cleavage system H protein  38.69 
 
 		 129 aa  80.1  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.123967  normal  0.480249 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>