More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0638 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_0638  glycine cleavage H-protein  100 
 
 		 148 aa  307  2.9999999999999997e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0575537 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2210  glycine cleavage H-protein  85.14 
 
 		 148 aa  273  6e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00775002  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2549  glycine cleavage system protein H, putative  67.57 
 
 		 148 aa  207  3e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2177  glycine cleavage H-protein  67.57 
 
 		 148 aa  207  3e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000031691 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1076  glycine cleavage system protein H  41.78 
 
 		 158 aa  123  7e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000510975  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3134  glycine cleavage H-protein  46.48 
 
 		 150 aa  117  4.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1746  glycine cleavage H-protein  45.45 
 
 		 150 aa  116  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.342973  normal  0.262336 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2869  glycine cleavage system H protein, putative  41.96 
 
 		 148 aa  110  5e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2490  glycine cleavage H-protein  41.96 
 
 		 148 aa  110  5e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1481  glycine cleavage system protein H  42.07 
 
 		 148 aa  109  1.0000000000000001e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.14622  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2035  glycine cleavage H-protein  37.24 
 
 		 148 aa  100  5e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1073  glycine cleavage system protein H  36.99 
 
 		 148 aa  100  7e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000237871  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0973  glycine cleavage H-protein  37.41 
 
 		 144 aa  99  2e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.714694  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2175  glycine cleavage H-protein  40 
 
 		 145 aa  96.3  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000381106 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2547  glycine cleavage system H protein, putative  40 
 
 		 145 aa  96.3  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1570  glycine cleavage H-protein  40.37 
 
 		 137 aa  90.5  7e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0137365 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2078  glycine cleavage H-protein  35.4 
 
 		 140 aa  87.8  4e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0438  glycine cleavage system H protein  36.97 
 
 		 138 aa  84.7  4e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0640  glycine cleavage H-protein  34.4 
 
 		 145 aa  84.7  4e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0818031 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2208  glycine cleavage H-protein  33.64 
 
 		 145 aa  80.9  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0665722  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0974  glycine cleavage H-protein  34.27 
 
 		 158 aa  80.5  0.000000000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.357877  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0055  glycine cleavage system protein H  38.68 
 
 		 126 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0144  glycine cleavage system protein H  34.48 
 
 		 126 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.87599 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0142  glycine cleavage system protein H  35.58 
 
 		 126 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.207968  normal  0.345489 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3004  glycine cleavage system protein H  39.36 
 
 		 126 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.655553 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3254  glycine cleavage system H protein  33.88 
 
 		 126 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3060  glycine cleavage system H protein  34.71 
 
 		 126 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2994  glycine cleavage system H protein  34.71 
 
 		 126 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3927  glycine cleavage system H protein  34.71 
 
 		 126 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0419405  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0128  glycine cleavage system H protein  34.71 
 
 		 126 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0132  glycine cleavage system H protein  36.54 
 
 		 153 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3998  glycine cleavage system H protein  34.71 
 
 		 126 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3310  glycine cleavage system H protein  34.71 
 
 		 126 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1543  glycine cleavage system H protein  34.71 
 
 		 126 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.532725  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5518  hypothetical protein  27.59 
 
 		 155 aa  68.2  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3324  glycine cleavage H-protein  32.76 
 
 		 155 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63370  hypothetical protein  27.59 
 
 		 155 aa  68.2  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.117247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11856  glycine cleavage system protein H  34.96 
 
 		 134 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.795989 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3881  glycine cleavage system protein H  38.89 
 
 		 126 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1903  glycine cleavage system protein H  33.03 
 
 		 130 aa  67  0.00000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0290  glycine cleavage system protein H  33.03 
 
 		 130 aa  67  0.00000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.148153  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0231  glycine cleavage system protein H  29.31 
 
 		 126 aa  66.2  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2577  glycine cleavage system protein H  37.5 
 
 		 130 aa  66.2  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0304435  normal  0.0181641 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3294  glycine cleavage system protein H  30.77 
 
 		 127 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2876  glycine cleavage system protein H  32.52 
 
 		 131 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2845  glycine cleavage system protein H  32.52 
 
 		 131 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2889  glycine cleavage system protein H  32.52 
 
 		 131 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.486572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3323  glycine cleavage system protein H  37.72 
 
 		 129 aa  65.9  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0897  glycine cleavage system H protein  31.62 
 
 		 135 aa  65.1  0.0000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00473644  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02736  glycine cleavage system protein H  35.96 
 
 		 129 aa  64.3  0.0000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0429973  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0788  glycine cleavage system H protein  35.96 
 
 		 129 aa  64.3  0.0000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471951  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3325  glycine cleavage system protein H  35.96 
 
 		 129 aa  64.3  0.0000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3231  glycine cleavage system protein H  35.96 
 
 		 129 aa  64.3  0.0000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.816191  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3286  glycine cleavage system protein H  35.96 
 
 		 129 aa  64.3  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3224  glycine cleavage system protein H  35.96 
 
 		 129 aa  64.3  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3391  glycine cleavage system protein H  35.96 
 
 		 129 aa  64.3  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.317969  normal  0.844228 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02699  hypothetical protein  35.96 
 
 		 129 aa  64.3  0.0000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0553776  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3063  glycine cleavage system protein H  35.96 
 
 		 129 aa  64.3  0.0000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3212  glycine cleavage system protein H  35.96 
 
 		 129 aa  64.3  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0254293  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3289  glycine cleavage system protein H  35.96 
 
 		 129 aa  64.3  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3036  glycine cleavage system protein H  35.96 
 
 		 129 aa  64.3  0.0000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.197625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0158  glycine cleavage system protein H  32.76 
 
 		 126 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0805  glycine cleavage system protein H  35.96 
 
 		 129 aa  64.3  0.0000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0782061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4195  glycine cleavage system protein H  35.96 
 
 		 129 aa  64.3  0.0000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2758  glycine cleavage system protein H  34.04 
 
 		 130 aa  64.3  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3206  glycine cleavage system protein H  33.71 
 
 		 128 aa  63.9  0.0000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000136098  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1539  glycine cleavage system protein H  33.64 
 
 		 127 aa  63.5  0.0000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.463905  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1191  glycine cleavage system protein H  33.33 
 
 		 130 aa  63.5  0.0000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1124  glycine cleavage system H protein  33.93 
 
 		 129 aa  63.5  0.0000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3403  glycine cleavage system protein H  30.37 
 
 		 131 aa  63.5  0.0000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0792246  normal  0.940944 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0764  glycine cleavage system protein H  35.19 
 
 		 126 aa  63.2  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2910  glycine cleavage system protein H  33.65 
 
 		 126 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0145  glycine cleavage system protein H  33.65 
 
 		 126 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0317  glycine cleavage system H protein  36.67 
 
 		 128 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0798  glycine cleavage system protein H  34.55 
 
 		 126 aa  62.4  0.000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00579569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0805  glycine cleavage system protein H  34.55 
 
 		 126 aa  62.4  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000312809  normal  0.950872 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5018  glycine cleavage system protein H  33.33 
 
 		 127 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0323678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5253  glycine cleavage system protein H  33.33 
 
 		 127 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1055  glycine cleavage system H protein  33.33 
 
 		 131 aa  62  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.206037  normal  0.46199 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2720  glycine cleavage system protein H  35.11 
 
 		 129 aa  61.6  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0615009  normal  0.778842 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0247  glycine cleavage system protein H  34.41 
 
 		 128 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5427  glycine cleavage system protein H  33.33 
 
 		 127 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.801429  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1719  glycine cleavage system H protein  29.47 
 
 		 130 aa  61.2  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.891721 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6623  glycine cleavage system H protein  33.64 
 
 		 127 aa  61.2  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197199 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2933  glycine cleavage system protein H  33.88 
 
 		 127 aa  61.2  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00141908  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5193  glycine cleavage system protein H  31.25 
 
 		 127 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.458089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3591  glycine cleavage system protein H  36.17 
 
 		 129 aa  61.2  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.961592  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0213  glycine cleavage system protein H  33.33 
 
 		 129 aa  60.8  0.000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3136  glycine cleavage system protein H  28.89 
 
 		 131 aa  60.5  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.323825  normal  0.0420611 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5100  glycine cleavage system protein H  31.18 
 
 		 127 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.831636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0766  glycine cleavage system H protein  27.78 
 
 		 127 aa  60.5  0.000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2003  glycine cleavage H-protein  28.77 
 
 		 234 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0332  glycine cleavage system protein H  28.72 
 
 		 129 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0485  glycine cleavage system protein H  31.53 
 
 		 126 aa  58.9  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0030  glycine cleavage system H protein  30.17 
 
 		 137 aa  58.9  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0960  glycine cleavage system H protein  35 
 
 		 130 aa  58.9  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1870  glycine cleavage system protein H  35.29 
 
 		 123 aa  58.9  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.510899  normal  0.111412 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3586  glycine cleavage system protein H  30 
 
 		 127 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000166607  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5130  glycine cleavage system protein H  30 
 
 		 127 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365083  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5133  glycine cleavage system protein H  30 
 
 		 127 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000135708  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>