More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1481 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1481  glycine cleavage system protein H  100 
 
 		 148 aa  296  8e-80  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.14622  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2035  glycine cleavage H-protein  79.05 
 
 		 148 aa  235  2e-61  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1073  glycine cleavage system protein H  46.94 
 
 		 148 aa  142  2e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000237871  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1076  glycine cleavage system protein H  45.95 
 
 		 158 aa  136  1e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000510975  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2869  glycine cleavage system H protein, putative  44.37 
 
 		 148 aa  131  3e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2490  glycine cleavage H-protein  44.37 
 
 		 148 aa  131  3e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3134  glycine cleavage H-protein  45.77 
 
 		 150 aa  130  5e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1746  glycine cleavage H-protein  44.44 
 
 		 150 aa  128  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.342973  normal  0.262336 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0638  glycine cleavage H-protein  42.07 
 
 		 148 aa  124  5e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0575537 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0973  glycine cleavage H-protein  41.13 
 
 		 144 aa  122  2e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.714694  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2210  glycine cleavage H-protein  39.31 
 
 		 148 aa  117  7e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00775002  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2208  glycine cleavage H-protein  43.88 
 
 		 145 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0665722  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2175  glycine cleavage H-protein  39.57 
 
 		 145 aa  113  8.999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000381106 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2547  glycine cleavage system H protein, putative  39.57 
 
 		 145 aa  113  8.999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0640  glycine cleavage H-protein  40.58 
 
 		 145 aa  111  3e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0818031 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0438  glycine cleavage system H protein  43.09 
 
 		 138 aa  106  8.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2549  glycine cleavage system protein H, putative  40 
 
 		 148 aa  106  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2177  glycine cleavage H-protein  40 
 
 		 148 aa  106  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000031691 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0974  glycine cleavage H-protein  33.33 
 
 		 158 aa  101  4e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.357877  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1903  glycine cleavage system protein H  41.53 
 
 		 130 aa  100  8e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0290  glycine cleavage system protein H  41.53 
 
 		 130 aa  100  8e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.148153  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1662  glycine cleavage system protein H  41.94 
 
 		 135 aa  95.9  2e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.293907  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2078  glycine cleavage H-protein  36.72 
 
 		 140 aa  93.6  9e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3183  glycine cleavage system protein H  40 
 
 		 126 aa  92.4  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.0000000182392  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0605  glycine cleavage system H protein  38.71 
 
 		 132 aa  91.3  4e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23430  glycine cleavage system H protein  37.98 
 
 		 128 aa  90.9  5e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000556712  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2577  glycine cleavage system protein H  35.29 
 
 		 130 aa  90.9  5e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0304435  normal  0.0181641 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0447  glycine cleavage system H protein  40.98 
 
 		 126 aa  90.5  7e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.197212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3591  glycine cleavage system protein H  42.24 
 
 		 129 aa  90.5  7e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.961592  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4450  glycine cleavage system H protein  39.83 
 
 		 126 aa  89.7  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000233  glycine cleavage system H protein  37.17 
 
 		 126 aa  89.4  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1719  glycine cleavage system H protein  39.83 
 
 		 130 aa  89.7  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.891721 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0697  glycine cleavage system protein H  41.88 
 
 		 127 aa  89.4  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0620  glycine cleavage system protein H  41.88 
 
 		 127 aa  89.4  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2776  glycine cleavage system H protein  38.94 
 
 		 134 aa  89  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0264905  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1711  glycine cleavage system H protein  43.64 
 
 		 126 aa  88.6  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.147296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2720  glycine cleavage system protein H  40.8 
 
 		 129 aa  89  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0615009  normal  0.778842 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1732  glycine cleavage H-protein  42.19 
 
 		 125 aa  88.2  3e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3323  glycine cleavage system protein H  39.37 
 
 		 129 aa  88.2  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1577  glycine cleavage system H protein  40.48 
 
 		 125 aa  88.2  3e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.731987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1570  glycine cleavage H-protein  41.28 
 
 		 137 aa  87.4  7e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0137365 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0811  glycine cleavage system protein H  38.14 
 
 		 130 aa  87  7e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.061834  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2340  glycine cleavage system H protein  37.61 
 
 		 134 aa  87  8e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.391703  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0950  glycine cleavage system protein H  35 
 
 		 126 aa  86.3  1e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.131104 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0798  glycine cleavage system protein H  39.64 
 
 		 126 aa  86.3  1e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00579569  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0623  glycine cleavage system protein H  38.94 
 
 		 130 aa  86.7  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05972  glycine cleavage system protein H  35.4 
 
 		 126 aa  86.7  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11856  glycine cleavage system protein H  38.05 
 
 		 134 aa  86.3  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.795989 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2758  glycine cleavage system protein H  44.44 
 
 		 130 aa  86.3  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0363  glycine cleavage system H protein  34.92 
 
 		 133 aa  86.3  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1812  glycine cleavage system protein H  36.03 
 
 		 131 aa  86.3  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0805  glycine cleavage system protein H  39.64 
 
 		 126 aa  86.3  1e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000312809  normal  0.950872 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1541  glycine cleavage system H protein  37.8 
 
 		 128 aa  86.3  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001692 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1497  glycine cleavage system H protein  35.94 
 
 		 126 aa  86.3  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02736  glycine cleavage system protein H  40 
 
 		 129 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0429973  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0788  glycine cleavage system H protein  40 
 
 		 129 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471951  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02699  hypothetical protein  40 
 
 		 129 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0553776  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3212  glycine cleavage system protein H  40 
 
 		 129 aa  85.9  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0254293  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0131  glycine cleavage system protein H  40 
 
 		 125 aa  85.9  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0116  glycine cleavage system protein H  40 
 
 		 125 aa  85.9  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0953  glycine cleavage system protein H  33.63 
 
 		 126 aa  85.9  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2876  glycine cleavage system protein H  43.12 
 
 		 131 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0839  glycine cleavage system protein H  38.94 
 
 		 130 aa  85.5  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3325  glycine cleavage system protein H  40 
 
 		 129 aa  85.9  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3286  glycine cleavage system protein H  40 
 
 		 129 aa  85.9  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3289  glycine cleavage system protein H  40 
 
 		 129 aa  85.9  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3231  glycine cleavage system protein H  40 
 
 		 129 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.816191  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00862  glycine cleavage system protein H  39.66 
 
 		 129 aa  85.5  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4195  glycine cleavage system protein H  40 
 
 		 129 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0805  glycine cleavage system protein H  40 
 
 		 129 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0782061  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2004  glycine cleavage system H protein  40.87 
 
 		 127 aa  85.9  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.829681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2845  glycine cleavage system protein H  43.12 
 
 		 131 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3063  glycine cleavage system protein H  40 
 
 		 129 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3036  glycine cleavage system protein H  40 
 
 		 129 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.197625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3391  glycine cleavage system protein H  40 
 
 		 129 aa  85.9  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.317969  normal  0.844228 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2889  glycine cleavage system protein H  43.12 
 
 		 131 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.486572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0689  glycine cleavage system protein H  42.55 
 
 		 125 aa  85.5  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.904294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3224  glycine cleavage system protein H  40 
 
 		 129 aa  85.9  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2200  glycine cleavage system protein H  47.87 
 
 		 125 aa  85.9  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.330883 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0764  glycine cleavage system protein H  37.17 
 
 		 126 aa  85.1  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3831  glycine cleavage system protein H  37.5 
 
 		 128 aa  85.1  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.396771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0864  glycine cleavage system protein H  37.5 
 
 		 128 aa  85.1  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.786548  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1124  glycine cleavage system H protein  39.81 
 
 		 129 aa  85.5  3e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1353  glycine cleavage system H protein  39.62 
 
 		 125 aa  84.7  3e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0897  glycine cleavage system H protein  33.33 
 
 		 135 aa  85.1  3e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00473644  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0717  glycine cleavage system H protein  34.68 
 
 		 128 aa  85.1  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3127  glycine cleavage system H protein  37.39 
 
 		 126 aa  85.1  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0712  glycine cleavage system protein H  46 
 
 		 122 aa  85.1  3e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0868  glycine cleavage system protein H  37.5 
 
 		 128 aa  85.1  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2018  glycine cleavage system H protein  33.06 
 
 		 132 aa  84.7  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.333643  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0985  glycine cleavage system H protein  33.33 
 
 		 132 aa  84.7  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00310181  hitchhiker  0.00751565 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3136  glycine cleavage system protein H  39.81 
 
 		 131 aa  84.3  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.323825  normal  0.0420611 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2715  glycine cleavage system protein H  36.44 
 
 		 128 aa  84  7e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2621  glycine cleavage system protein H  36.44 
 
 		 128 aa  84  7e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.233728  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3915  glycine cleavage system H protein  38.28 
 
 		 128 aa  84  7e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1244  glycine cleavage system protein H  36.44 
 
 		 128 aa  83.6  8e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3436  glycine cleavage system protein H  41.82 
 
 		 135 aa  83.6  9e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3063  glycine cleavage system protein H  40 
 
 		 129 aa  83.6  9e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.210618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3363  glycine cleavage system H protein  37.5 
 
 		 127 aa  83.6  9e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.722606 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0834  glycine cleavage system protein H  37.93 
 
 		 129 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>