More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_2078 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_2078  glycine cleavage H-protein  100 
 
 		 140 aa  281  2.0000000000000002e-75  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1570  glycine cleavage H-protein  59.29 
 
 		 137 aa  181  3e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0137365 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0640  glycine cleavage H-protein  35.11 
 
 		 145 aa  98.6  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0818031 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2547  glycine cleavage system H protein, putative  35.11 
 
 		 145 aa  95.1  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2208  glycine cleavage H-protein  33.59 
 
 		 145 aa  95.1  3e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0665722  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2175  glycine cleavage H-protein  35.11 
 
 		 145 aa  95.1  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000381106 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0438  glycine cleavage system H protein  38.6 
 
 		 138 aa  91.3  4e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2210  glycine cleavage H-protein  32.61 
 
 		 148 aa  90.5  6e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00775002  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0973  glycine cleavage H-protein  36.94 
 
 		 144 aa  89.7  1e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.714694  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0638  glycine cleavage H-protein  35.4 
 
 		 148 aa  87.8  4e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0575537 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1599  glycine cleavage system H protein  40.18 
 
 		 129 aa  85.9  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0335982  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1073  glycine cleavage system protein H  32.31 
 
 		 148 aa  84.3  5e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000237871  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1481  glycine cleavage system protein H  36.8 
 
 		 148 aa  84  7e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.14622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1076  glycine cleavage system protein H  39.25 
 
 		 158 aa  83.6  8e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000510975  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2035  glycine cleavage H-protein  40.17 
 
 		 148 aa  82.8  0.000000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2869  glycine cleavage system H protein, putative  35.45 
 
 		 148 aa  81.6  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2490  glycine cleavage H-protein  35.45 
 
 		 148 aa  81.6  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4450  glycine cleavage system H protein  35.34 
 
 		 126 aa  79.7  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2177  glycine cleavage H-protein  32.73 
 
 		 148 aa  79.7  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000031691 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2549  glycine cleavage system protein H, putative  32.73 
 
 		 148 aa  79.7  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1746  glycine cleavage H-protein  34.55 
 
 		 150 aa  79  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.342973  normal  0.262336 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3134  glycine cleavage H-protein  33.93 
 
 		 150 aa  78.6  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1525  glycine cleavage system H protein  38.53 
 
 		 129 aa  78.2  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260803 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0897  glycine cleavage system H protein  36.19 
 
 		 135 aa  77.8  0.00000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00473644  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2021  glycine cleavage system H protein  37.5 
 
 		 128 aa  77.4  0.00000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.132774  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5518  hypothetical protein  29.41 
 
 		 155 aa  76.6  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3004  glycine cleavage system protein H  34.26 
 
 		 126 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.655553 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13340  glycine cleavage system H protein  35.71 
 
 		 127 aa  75.9  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1719  glycine cleavage system H protein  36.79 
 
 		 130 aa  75.9  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.891721 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0187  glycine cleavage system H protein  32.28 
 
 		 126 aa  75.1  0.0000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.717665  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1055  glycine cleavage system H protein  33.64 
 
 		 131 aa  75.1  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.206037  normal  0.46199 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0055  glycine cleavage system protein H  33.33 
 
 		 126 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2577  glycine cleavage system protein H  31.9 
 
 		 130 aa  74.7  0.0000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0304435  normal  0.0181641 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6623  glycine cleavage system H protein  30.91 
 
 		 127 aa  74.3  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197199 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3481  glycine cleavage system protein H  33.64 
 
 		 126 aa  73.9  0.0000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63370  hypothetical protein  27.94 
 
 		 155 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.117247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5357  glycine cleavage system H protein  34.86 
 
 		 126 aa  73.6  0.0000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0985  glycine cleavage system H protein  34.75 
 
 		 132 aa  73.6  0.0000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00310181  hitchhiker  0.00751565 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5130  glycine cleavage system protein H  33.33 
 
 		 127 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365083  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2653  glycine cleavage system H protein  38.32 
 
 		 129 aa  72.8  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000387916 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1809  glycine cleavage H-protein  35.24 
 
 		 147 aa  73.2  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0431801  normal  0.183881 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3330  glycine cleavage system protein H  33.64 
 
 		 126 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.348405  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5135  glycine cleavage system protein H  33.33 
 
 		 127 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00103553  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5133  glycine cleavage system protein H  33.33 
 
 		 127 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000135708  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0832  glycine cleavage system protein H  35.78 
 
 		 126 aa  73.2  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00486711  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1563  glycine cleavage system H protein  38.32 
 
 		 129 aa  72.8  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000855574  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5100  glycine cleavage system protein H  34.62 
 
 		 127 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.831636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0231  glycine cleavage system protein H  31.15 
 
 		 126 aa  73.2  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4814  glycine cleavage system protein H  33.33 
 
 		 127 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00016491  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0849  glycine cleavage system protein H  35.78 
 
 		 126 aa  73.2  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000024227  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3586  glycine cleavage system protein H  33.33 
 
 		 127 aa  72  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000166607  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4859  glycine cleavage system protein H  33.33 
 
 		 127 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000908449  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4700  glycine cleavage system protein H  33.33 
 
 		 127 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000213752  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4716  glycine cleavage system protein H  33.33 
 
 		 127 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000916909  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5097  glycine cleavage system protein H  33.33 
 
 		 127 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5228  glycine cleavage system protein H  33.33 
 
 		 127 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000143615  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3881  glycine cleavage system protein H  33.33 
 
 		 126 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0811  glycine cleavage system protein H  34.58 
 
 		 130 aa  72.4  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.061834  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0105  glycine cleavage system protein H  33.33 
 
 		 127 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000835004  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0485  glycine cleavage system protein H  35.78 
 
 		 126 aa  71.6  0.000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2933  glycine cleavage system protein H  34.62 
 
 		 127 aa  71.6  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00141908  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2018  glycine cleavage system H protein  34.4 
 
 		 132 aa  71.6  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.333643  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1539  glycine cleavage system protein H  36.36 
 
 		 127 aa  70.9  0.000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.463905  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1827  glycine cleavage system H protein  31.82 
 
 		 128 aa  70.1  0.000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000163584  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0620  glycine cleavage system protein H  33.64 
 
 		 127 aa  70.1  0.000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1227  glycine cleavage system H protein  39.25 
 
 		 130 aa  70.1  0.000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1124  glycine cleavage system H protein  36.54 
 
 		 129 aa  69.7  0.00000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3294  glycine cleavage system protein H  31.19 
 
 		 127 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0697  glycine cleavage system protein H  29.77 
 
 		 127 aa  69.3  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0142  glycine cleavage system protein H  31.43 
 
 		 126 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.207968  normal  0.345489 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23430  glycine cleavage system H protein  32.11 
 
 		 128 aa  68.6  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000556712  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1662  glycine cleavage system protein H  34.13 
 
 		 135 aa  68.9  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.293907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2284  glycine cleavage system H protein  37.23 
 
 		 129 aa  69.3  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.868083  hitchhiker  0.0000750772 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0953  glycine cleavage system protein H  32.77 
 
 		 126 aa  69.3  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1711  glycine cleavage system H protein  33.04 
 
 		 126 aa  68.9  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.147296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5253  glycine cleavage system protein H  33.64 
 
 		 127 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1191  glycine cleavage system protein H  34.55 
 
 		 130 aa  68.9  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5193  glycine cleavage system protein H  34.04 
 
 		 127 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.458089  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0131  glycine cleavage system protein H  37.04 
 
 		 125 aa  68.2  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0116  glycine cleavage system protein H  37.04 
 
 		 125 aa  68.2  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5018  glycine cleavage system protein H  31.78 
 
 		 127 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0323678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0225  glycine cleavage system H protein  33.64 
 
 		 123 aa  68.2  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000351635  normal  0.835809 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2004  glycine cleavage system H protein  34.91 
 
 		 127 aa  68.2  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.829681  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0950  glycine cleavage system protein H  35.58 
 
 		 126 aa  68.2  0.00000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.131104 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0676  glycine cleavage system H protein  31.48 
 
 		 127 aa  67.8  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3324  glycine cleavage H-protein  30.1 
 
 		 155 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0717  glycine cleavage system H protein  30 
 
 		 128 aa  67.4  0.00000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0339  glycine cleavage system protein H  31.78 
 
 		 130 aa  67.4  0.00000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000111817  normal  0.10942 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3298  glycine cleavage system H protein  33.64 
 
 		 129 aa  67.4  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.123967  normal  0.480249 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0436  glycine cleavage system H protein  33.03 
 
 		 126 aa  67.4  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1497  glycine cleavage system H protein  32.81 
 
 		 126 aa  67.4  0.00000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1577  glycine cleavage system H protein  33.02 
 
 		 125 aa  67  0.00000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.731987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4466  glycine cleavage system H protein  35.51 
 
 		 126 aa  67  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.332161 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0960  glycine cleavage system H protein  33.94 
 
 		 130 aa  67  0.00000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3830  glycine cleavage system H protein  33.03 
 
 		 126 aa  67  0.00000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.741858 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1300  glycine cleavage system protein H  31.86 
 
 		 132 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4998  glycine cleavage system protein H  34.23 
 
 		 126 aa  66.2  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1467  glycine cleavage system protein H  35.19 
 
 		 126 aa  66.6  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0733861 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1269  glycine cleavage system protein H  31.86 
 
 		 132 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3084  glycine cleavage system protein H  33.9 
 
 		 127 aa  66.2  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>