More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2210 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2210  glycine cleavage H-protein  100 
 
 		 148 aa  310  4.999999999999999e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00775002  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0638  glycine cleavage H-protein  85.14 
 
 		 148 aa  273  6e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0575537 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2549  glycine cleavage system protein H, putative  68.92 
 
 		 148 aa  213  8e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2177  glycine cleavage H-protein  68.92 
 
 		 148 aa  213  8e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000031691 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1746  glycine cleavage H-protein  51.75 
 
 		 150 aa  131  3e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.342973  normal  0.262336 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1076  glycine cleavage system protein H  42.47 
 
 		 158 aa  129  2.0000000000000002e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000510975  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3134  glycine cleavage H-protein  50.7 
 
 		 150 aa  127  4.0000000000000003e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2490  glycine cleavage H-protein  43.36 
 
 		 148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2869  glycine cleavage system H protein, putative  43.36 
 
 		 148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1481  glycine cleavage system protein H  39.31 
 
 		 148 aa  102  2e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.14622  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0973  glycine cleavage H-protein  38.46 
 
 		 144 aa  100  6e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.714694  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2175  glycine cleavage H-protein  36.76 
 
 		 145 aa  99.8  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000381106 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2547  glycine cleavage system H protein, putative  36.76 
 
 		 145 aa  99.8  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1073  glycine cleavage system protein H  34.93 
 
 		 148 aa  97.4  6e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000237871  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2035  glycine cleavage H-protein  35.17 
 
 		 148 aa  94  6e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1570  glycine cleavage H-protein  34.06 
 
 		 137 aa  90.5  6e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0137365 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2078  glycine cleavage H-protein  32.61 
 
 		 140 aa  90.5  7e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0640  glycine cleavage H-protein  34.56 
 
 		 145 aa  88.6  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0818031 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0438  glycine cleavage system H protein  35.88 
 
 		 138 aa  84  7e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2208  glycine cleavage H-protein  33.09 
 
 		 145 aa  82  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0665722  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3004  glycine cleavage system protein H  41.12 
 
 		 126 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.655553 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0055  glycine cleavage system protein H  38.71 
 
 		 126 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0142  glycine cleavage system protein H  35.04 
 
 		 126 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.207968  normal  0.345489 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3254  glycine cleavage system H protein  37.14 
 
 		 126 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63370  hypothetical protein  29.17 
 
 		 155 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.117247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0974  glycine cleavage H-protein  32.17 
 
 		 158 aa  73.6  0.0000000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.357877  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0144  glycine cleavage system protein H  38.1 
 
 		 126 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.87599 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2994  glycine cleavage system H protein  35.4 
 
 		 126 aa  72  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0128  glycine cleavage system H protein  35.4 
 
 		 126 aa  72  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3060  glycine cleavage system H protein  35.4 
 
 		 126 aa  72  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3927  glycine cleavage system H protein  35.4 
 
 		 126 aa  72  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0419405  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3310  glycine cleavage system H protein  35.4 
 
 		 126 aa  72  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1543  glycine cleavage system H protein  35.4 
 
 		 126 aa  72  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.532725  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3324  glycine cleavage H-protein  35.85 
 
 		 155 aa  72  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0132  glycine cleavage system H protein  38.1 
 
 		 153 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3998  glycine cleavage system H protein  37 
 
 		 126 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3294  glycine cleavage system protein H  32.54 
 
 		 127 aa  70.9  0.000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3881  glycine cleavage system protein H  40 
 
 		 126 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5518  hypothetical protein  27.78 
 
 		 155 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6623  glycine cleavage system H protein  33.64 
 
 		 127 aa  67.4  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197199 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0764  glycine cleavage system protein H  36.11 
 
 		 126 aa  67  0.00000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0231  glycine cleavage system protein H  30.25 
 
 		 126 aa  66.2  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2577  glycine cleavage system protein H  37.11 
 
 		 130 aa  65.9  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0304435  normal  0.0181641 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3323  glycine cleavage system protein H  36.45 
 
 		 129 aa  65.5  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3206  glycine cleavage system protein H  35.96 
 
 		 128 aa  64.3  0.0000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000136098  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0213  glycine cleavage system protein H  35.42 
 
 		 129 aa  64.3  0.0000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1055  glycine cleavage system H protein  33.98 
 
 		 131 aa  64.3  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.206037  normal  0.46199 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2910  glycine cleavage system protein H  33.33 
 
 		 126 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0145  glycine cleavage system protein H  33.33 
 
 		 126 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0158  glycine cleavage system protein H  34.29 
 
 		 126 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0247  glycine cleavage system protein H  34.29 
 
 		 128 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5018  glycine cleavage system protein H  34.58 
 
 		 127 aa  63.9  0.0000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0323678  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02736  glycine cleavage system protein H  35.09 
 
 		 129 aa  63.5  0.0000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0429973  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0788  glycine cleavage system H protein  35.09 
 
 		 129 aa  63.5  0.0000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471951  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3391  glycine cleavage system protein H  35.09 
 
 		 129 aa  63.5  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.317969  normal  0.844228 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1903  glycine cleavage system protein H  31.97 
 
 		 130 aa  63.5  0.0000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0805  glycine cleavage system protein H  35.09 
 
 		 129 aa  63.5  0.0000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0782061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3063  glycine cleavage system protein H  35.09 
 
 		 129 aa  63.5  0.0000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3224  glycine cleavage system protein H  35.09 
 
 		 129 aa  63.5  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3286  glycine cleavage system protein H  35.09 
 
 		 129 aa  63.5  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3212  glycine cleavage system protein H  35.09 
 
 		 129 aa  63.5  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0254293  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3036  glycine cleavage system protein H  35.09 
 
 		 129 aa  63.5  0.0000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.197625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3289  glycine cleavage system protein H  35.09 
 
 		 129 aa  63.5  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02699  hypothetical protein  35.09 
 
 		 129 aa  63.5  0.0000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0553776  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0290  glycine cleavage system protein H  31.97 
 
 		 130 aa  63.5  0.0000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.148153  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3325  glycine cleavage system protein H  35.09 
 
 		 129 aa  63.5  0.0000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3231  glycine cleavage system protein H  35.09 
 
 		 129 aa  63.5  0.0000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.816191  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4195  glycine cleavage system protein H  35.09 
 
 		 129 aa  63.5  0.0000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5253  glycine cleavage system protein H  34.95 
 
 		 127 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5427  glycine cleavage system protein H  33.63 
 
 		 127 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.801429  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0897  glycine cleavage system H protein  30.65 
 
 		 135 aa  62  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00473644  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2004  glycine cleavage system H protein  35.59 
 
 		 127 aa  62.4  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.829681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1539  glycine cleavage system protein H  33.64 
 
 		 127 aa  62.4  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.463905  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2758  glycine cleavage system protein H  34.04 
 
 		 130 aa  62.8  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2720  glycine cleavage system protein H  36.54 
 
 		 129 aa  62.4  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0615009  normal  0.778842 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1719  glycine cleavage system H protein  31.25 
 
 		 130 aa  62  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.891721 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2284  glycine cleavage system protein H  33.96 
 
 		 127 aa  61.6  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.31012  normal  0.75932 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1732  glycine cleavage H-protein  32.29 
 
 		 125 aa  61.2  0.000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1870  glycine cleavage system protein H  32.79 
 
 		 123 aa  61.2  0.000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.510899  normal  0.111412 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11856  glycine cleavage system protein H  32.8 
 
 		 134 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.795989 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0317  glycine cleavage system H protein  34.86 
 
 		 128 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0798  glycine cleavage system protein H  33.33 
 
 		 126 aa  60.8  0.000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00579569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5100  glycine cleavage system protein H  32 
 
 		 127 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.831636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0805  glycine cleavage system protein H  33.33 
 
 		 126 aa  60.8  0.000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000312809  normal  0.950872 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5193  glycine cleavage system protein H  31.86 
 
 		 127 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.458089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1191  glycine cleavage system protein H  32.99 
 
 		 130 aa  60.5  0.000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0950  glycine cleavage system protein H  34.58 
 
 		 126 aa  60.5  0.000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.131104 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3591  glycine cleavage system protein H  36.17 
 
 		 129 aa  60.5  0.000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.961592  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0332  glycine cleavage system protein H  30.21 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0960  glycine cleavage system H protein  33.63 
 
 		 130 aa  60.1  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0834  glycine cleavage system protein H  36.17 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00862  glycine cleavage system protein H  32.99 
 
 		 129 aa  58.9  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0339  glycine cleavage system protein H  32.11 
 
 		 130 aa  58.9  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000111817  normal  0.10942 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47270  Glycine cleavage system H protein  32.29 
 
 		 129 aa  58.9  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.666574  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1755  glycine cleavage system protein H  35.4 
 
 		 129 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.311333  normal  0.186325 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3136  glycine cleavage system protein H  27.69 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.323825  normal  0.0420611 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2876  glycine cleavage system protein H  30.08 
 
 		 131 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0225  glycine cleavage system H protein  30.69 
 
 		 123 aa  58.5  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000351635  normal  0.835809 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0953  glycine cleavage system protein H  31.91 
 
 		 126 aa  58.5  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2889  glycine cleavage system protein H  30.08 
 
 		 131 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.486572  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>