More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1055 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1055  glycine cleavage system H protein  100 
 
 		 131 aa  263  7e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.206037  normal  0.46199 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0144  glycine cleavage system protein H  50.4 
 
 		 126 aa  142  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.87599 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5100  glycine cleavage system protein H  51.97 
 
 		 127 aa  142  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.831636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5253  glycine cleavage system protein H  51.97 
 
 		 127 aa  141  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0132  glycine cleavage system H protein  50.4 
 
 		 153 aa  141  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1719  glycine cleavage system H protein  52.31 
 
 		 130 aa  141  4e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.891721 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2758  glycine cleavage system protein H  54.26 
 
 		 130 aa  139  9e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0142  glycine cleavage system protein H  48.8 
 
 		 126 aa  138  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.207968  normal  0.345489 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1191  glycine cleavage system protein H  54.26 
 
 		 130 aa  137  6e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5193  glycine cleavage system protein H  50.39 
 
 		 127 aa  137  6e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.458089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0158  glycine cleavage system protein H  48.8 
 
 		 126 aa  135  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2910  glycine cleavage system protein H  50.4 
 
 		 126 aa  135  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68860  glycine cleavage system protein H  50.41 
 
 		 129 aa  136  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0145  glycine cleavage system protein H  50.4 
 
 		 126 aa  135  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2994  glycine cleavage system H protein  48.8 
 
 		 126 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0128  glycine cleavage system H protein  48.8 
 
 		 126 aa  135  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3927  glycine cleavage system H protein  48.8 
 
 		 126 aa  135  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0419405  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3060  glycine cleavage system H protein  48.8 
 
 		 126 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3254  glycine cleavage system H protein  48.8 
 
 		 126 aa  135  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3310  glycine cleavage system H protein  48.8 
 
 		 126 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1543  glycine cleavage system H protein  48.8 
 
 		 126 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.532725  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2577  glycine cleavage system protein H  51.16 
 
 		 130 aa  135  2e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0304435  normal  0.0181641 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5018  glycine cleavage system protein H  50.39 
 
 		 127 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0323678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5427  glycine cleavage system protein H  49.61 
 
 		 127 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.801429  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3324  glycine cleavage H-protein  48.8 
 
 		 155 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3998  glycine cleavage system H protein  48.8 
 
 		 126 aa  134  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5959  glycine cleavage system protein H  50.43 
 
 		 142 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.723705  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3294  glycine cleavage system protein H  49.59 
 
 		 127 aa  133  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47270  Glycine cleavage system H protein  52.14 
 
 		 129 aa  132  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.666574  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0332  glycine cleavage system protein H  51.72 
 
 		 129 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0177  glycine cleavage system protein H  49.22 
 
 		 129 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3004  glycine cleavage system protein H  48 
 
 		 126 aa  131  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.655553 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3591  glycine cleavage system protein H  51.94 
 
 		 129 aa  131  3e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.961592  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3150  glycine cleavage system protein H  49.61 
 
 		 129 aa  131  3e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000198497  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2720  glycine cleavage system protein H  49.61 
 
 		 129 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0615009  normal  0.778842 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0055  glycine cleavage system protein H  47.15 
 
 		 126 aa  130  5e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2621  glycine cleavage system protein H  50.79 
 
 		 128 aa  130  6e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.233728  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2715  glycine cleavage system protein H  50.79 
 
 		 128 aa  130  6e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0834  glycine cleavage system protein H  50.78 
 
 		 129 aa  130  9e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3330  glycine cleavage system protein H  50.42 
 
 		 126 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.348405  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3881  glycine cleavage system protein H  47.15 
 
 		 126 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0247  glycine cleavage system protein H  48.44 
 
 		 128 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1244  glycine cleavage system protein H  50.79 
 
 		 128 aa  129  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3481  glycine cleavage system protein H  49.58 
 
 		 126 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3183  glycine cleavage system protein H  56.59 
 
 		 126 aa  128  2.0000000000000002e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.0000000182392  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4859  glycine cleavage system protein H  49.61 
 
 		 127 aa  127  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000908449  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4700  glycine cleavage system protein H  49.61 
 
 		 127 aa  127  4.0000000000000003e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000213752  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4716  glycine cleavage system protein H  49.61 
 
 		 127 aa  127  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000916909  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5228  glycine cleavage system protein H  49.61 
 
 		 127 aa  127  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000143615  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5097  glycine cleavage system protein H  49.61 
 
 		 127 aa  127  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0051  glycine cleavage system H protein  48.82 
 
 		 127 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0907  glycine cleavage H-protein  47.29 
 
 		 130 aa  127  5.0000000000000004e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2523  glycine cleavage system protein H  50.79 
 
 		 127 aa  127  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.85836  normal  0.122501 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5130  glycine cleavage system protein H  49.61 
 
 		 127 aa  127  6e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365083  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5133  glycine cleavage system protein H  49.61 
 
 		 127 aa  127  6e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000135708  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1812  glycine cleavage system protein H  48.84 
 
 		 131 aa  127  6e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3674  glycine cleavage system protein H  46.51 
 
 		 129 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3488  glycine cleavage system protein H  47.93 
 
 		 126 aa  126  8.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3063  glycine cleavage system protein H  49.61 
 
 		 129 aa  126  9.000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.210618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0105  glycine cleavage system protein H  49.61 
 
 		 127 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000835004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3968  glycine cleavage system protein H  47.29 
 
 		 129 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0721397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4814  glycine cleavage system protein H  49.61 
 
 		 127 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00016491  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2004  glycine cleavage system H protein  54.17 
 
 		 127 aa  125  1.0000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.829681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3323  glycine cleavage system protein H  47.29 
 
 		 129 aa  125  1.0000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2933  glycine cleavage system protein H  50.79 
 
 		 127 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00141908  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3586  glycine cleavage system protein H  49.61 
 
 		 127 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000166607  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5135  glycine cleavage system protein H  49.61 
 
 		 127 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00103553  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00862  glycine cleavage system protein H  50.39 
 
 		 129 aa  126  1.0000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0780  glycine cleavage system protein H  48.06 
 
 		 129 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3161  glycine cleavage system protein H  47.11 
 
 		 126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.876766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3330  glycine cleavage system protein H  48.06 
 
 		 129 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.277505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0623  glycine cleavage system protein H  48.06 
 
 		 129 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0735032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3500  glycine cleavage system protein H  48.06 
 
 		 129 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.497243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2869  glycine cleavage system protein H  51.52 
 
 		 129 aa  125  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3210  glycine cleavage system protein H  48.06 
 
 		 129 aa  125  3e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0184338  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1577  glycine cleavage system H protein  50 
 
 		 125 aa  124  4.0000000000000003e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.731987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0618  glycine cleavage system protein H  48.06 
 
 		 129 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.475927  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1650  glycine cleavage system protein H  50.39 
 
 		 127 aa  124  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0275395  normal  0.35687 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3084  glycine cleavage system protein H  50.79 
 
 		 127 aa  124  5e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0436  glycine cleavage system H protein  49.21 
 
 		 126 aa  124  5e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0623  glycine cleavage system protein H  50.39 
 
 		 130 aa  124  6e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3302  glycine cleavage system protein H  46.51 
 
 		 129 aa  123  7e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.13973  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1732  glycine cleavage H-protein  48 
 
 		 125 aa  123  8.000000000000001e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0213  glycine cleavage system protein H  46.03 
 
 		 129 aa  123  9e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0317  glycine cleavage system H protein  48.36 
 
 		 128 aa  122  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1693  glycine cleavage system protein H  51.94 
 
 		 127 aa  122  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.418268  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3618  glycine cleavage system protein H  47.29 
 
 		 129 aa  123  1e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3800  glycine cleavage system protein H  47.29 
 
 		 129 aa  123  1e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3676  glycine cleavage system protein H  47.29 
 
 		 129 aa  123  1e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.134478  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0839  glycine cleavage system protein H  48.84 
 
 		 130 aa  122  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0290  glycine cleavage system protein H  46.15 
 
 		 130 aa  122  2e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.148153  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2464  glycine cleavage system H protein  47.01 
 
 		 128 aa  122  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.239557  normal  0.657503 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1903  glycine cleavage system protein H  46.15 
 
 		 130 aa  122  2e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0811  glycine cleavage system protein H  47.46 
 
 		 130 aa  122  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.061834  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1497  glycine cleavage system H protein  48.41 
 
 		 126 aa  121  3e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5357  glycine cleavage system H protein  49.6 
 
 		 126 aa  121  4e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13340  glycine cleavage system H protein  50.79 
 
 		 127 aa  121  4e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3072  glycine cleavage system protein H  46.51 
 
 		 131 aa  120  4e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.132267 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1612  glycine cleavage system protein H  55.46 
 
 		 127 aa  120  5e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.645617  normal  0.608002 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0798  glycine cleavage system protein H  46.72 
 
 		 126 aa  120  8e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00579569  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>