More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_00500 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_00500  glycine cleavage system H protein  100 
 
 		 123 aa  240  3.9999999999999997e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.745408  normal  0.125042 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0095  glycine cleavage system H protein  69.49 
 
 		 123 aa  165  1e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0046  glycine cleavage system H protein  65.55 
 
 		 122 aa  159  9e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.517546  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0536  glycine cleavage system H protein  60.48 
 
 		 127 aa  150  5e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0766  glycine cleavage system H protein  54.03 
 
 		 127 aa  136  1e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13340  glycine cleavage system H protein  54.92 
 
 		 127 aa  134  3.0000000000000003e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1541  glycine cleavage system H protein  53.91 
 
 		 128 aa  134  6.0000000000000005e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001692 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1915  glycine cleavage system H protein  60.19 
 
 		 124 aa  133  9e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014329 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1540  glycine cleavage system H protein  54.69 
 
 		 133 aa  133  9e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.186555  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11856  glycine cleavage system protein H  57.27 
 
 		 134 aa  132  9.999999999999999e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.795989 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6247  glycine cleavage system H protein  53.17 
 
 		 127 aa  129  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.150459  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3136  glycine cleavage system protein H  51.94 
 
 		 131 aa  127  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.323825  normal  0.0420611 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1755  glycine cleavage system protein H  54.47 
 
 		 129 aa  127  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.311333  normal  0.186325 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3097  glycine cleavage system H protein  54.33 
 
 		 127 aa  127  6e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.215874  normal  0.0104752 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0960  glycine cleavage system H protein  52.42 
 
 		 130 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2521  glycine cleavage system H protein  57.27 
 
 		 126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.344987  hitchhiker  0.00701703 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2869  glycine cleavage system protein H  51.61 
 
 		 129 aa  125  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1467  glycine cleavage system protein H  53.72 
 
 		 126 aa  125  3e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0733861 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3183  glycine cleavage system protein H  50.82 
 
 		 126 aa  125  3e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.0000000182392  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0144  glycine cleavage system protein H  51.59 
 
 		 126 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.87599 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0721  glycine cleavage system H protein  48.78 
 
 		 126 aa  124  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2776  glycine cleavage system H protein  57.55 
 
 		 134 aa  123  6e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0264905  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2352  glycine cleavage system H protein  56.41 
 
 		 126 aa  123  7e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0122881  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1525  glycine cleavage system H protein  51.26 
 
 		 129 aa  123  7e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260803 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3324  glycine cleavage H-protein  49.61 
 
 		 155 aa  122  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2383  glycine cleavage system H protein  54.62 
 
 		 126 aa  122  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13860  glycine cleavage system H protein  52.38 
 
 		 128 aa  122  2e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3403  glycine cleavage system protein H  55.96 
 
 		 131 aa  122  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0792246  normal  0.940944 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4011  glycine cleavage system H protein  49.62 
 
 		 134 aa  121  3e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.109498  normal  0.181592 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0142  glycine cleavage system protein H  51.59 
 
 		 126 aa  120  5e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.207968  normal  0.345489 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0676  glycine cleavage system H protein  50.79 
 
 		 127 aa  120  5e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0132  glycine cleavage system H protein  51.59 
 
 		 153 aa  120  5e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1227  glycine cleavage system H protein  56.86 
 
 		 130 aa  120  6e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2994  glycine cleavage system H protein  50.39 
 
 		 126 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3060  glycine cleavage system H protein  50.39 
 
 		 126 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0128  glycine cleavage system H protein  50.39 
 
 		 126 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0436  glycine cleavage system H protein  51.22 
 
 		 126 aa  119  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2876  glycine cleavage system protein H  50.39 
 
 		 131 aa  119  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3254  glycine cleavage system H protein  50.39 
 
 		 126 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3927  glycine cleavage system H protein  50.39 
 
 		 126 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0419405  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1543  glycine cleavage system H protein  50.39 
 
 		 126 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.532725  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2845  glycine cleavage system protein H  50.39 
 
 		 131 aa  119  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3998  glycine cleavage system H protein  50.39 
 
 		 126 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2714  glycine cleavage system H protein  57.28 
 
 		 128 aa  119  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0651249  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2889  glycine cleavage system protein H  50.39 
 
 		 131 aa  119  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.486572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3310  glycine cleavage system H protein  50.39 
 
 		 126 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1497  glycine cleavage system H protein  47.54 
 
 		 126 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2910  glycine cleavage system protein H  51.59 
 
 		 126 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0145  glycine cleavage system protein H  51.59 
 
 		 126 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2284  glycine cleavage system H protein  50 
 
 		 129 aa  119  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.868083  hitchhiker  0.0000750772 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4466  glycine cleavage system H protein  46.4 
 
 		 126 aa  118  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.332161 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1124  glycine cleavage system H protein  54.21 
 
 		 129 aa  117  3.9999999999999996e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4859  glycine cleavage system protein H  52.1 
 
 		 127 aa  116  7.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000908449  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4700  glycine cleavage system protein H  52.1 
 
 		 127 aa  116  7.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000213752  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4716  glycine cleavage system protein H  52.1 
 
 		 127 aa  116  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000916909  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5228  glycine cleavage system protein H  52.1 
 
 		 127 aa  116  7.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000143615  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5097  glycine cleavage system protein H  52.1 
 
 		 127 aa  116  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4998  glycine cleavage system protein H  58.82 
 
 		 126 aa  116  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5130  glycine cleavage system protein H  51.67 
 
 		 127 aa  115  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365083  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1516  glycine cleavage system H protein  44.26 
 
 		 125 aa  116  9.999999999999999e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0307602  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0832  glycine cleavage system protein H  47.97 
 
 		 126 aa  116  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00486711  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0332  glycine cleavage system protein H  53.77 
 
 		 129 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0849  glycine cleavage system protein H  47.97 
 
 		 126 aa  116  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000024227  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3830  glycine cleavage system H protein  47.2 
 
 		 126 aa  116  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.741858 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5133  glycine cleavage system protein H  51.67 
 
 		 127 aa  115  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000135708  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5135  glycine cleavage system protein H  52.1 
 
 		 127 aa  115  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00103553  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0158  glycine cleavage system protein H  49.21 
 
 		 126 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0798  glycine cleavage system protein H  46.83 
 
 		 126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00579569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2523  glycine cleavage system protein H  54.37 
 
 		 127 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.85836  normal  0.122501 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4814  glycine cleavage system protein H  52.5 
 
 		 127 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00016491  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0105  glycine cleavage system protein H  51.67 
 
 		 127 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000835004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3323  glycine cleavage system protein H  48.39 
 
 		 129 aa  115  1.9999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0805  glycine cleavage system protein H  46.83 
 
 		 126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000312809  normal  0.950872 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2758  glycine cleavage system protein H  46.83 
 
 		 130 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1693  glycine cleavage system protein H  48.78 
 
 		 127 aa  115  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.418268  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3586  glycine cleavage system protein H  50.83 
 
 		 127 aa  114  3e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000166607  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14980  glycine cleavage system H protein  49.22 
 
 		 129 aa  114  3.9999999999999997e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0575486  normal  0.572027 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0485  glycine cleavage system protein H  43.09 
 
 		 126 aa  114  5e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1698  glycine cleavage system H protein  49.59 
 
 		 126 aa  114  5e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3743  glycine cleavage system H protein  50.43 
 
 		 125 aa  113  6.9999999999999995e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.155158 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3127  glycine cleavage system H protein  56.31 
 
 		 126 aa  112  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3363  glycine cleavage system H protein  49.54 
 
 		 127 aa  112  1.0000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.722606 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1244  glycine cleavage system protein H  54.37 
 
 		 128 aa  113  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1893  glycine cleavage system protein H  44.72 
 
 		 127 aa  113  1.0000000000000001e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.262641 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02736  glycine cleavage system protein H  48.15 
 
 		 129 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0429973  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0788  glycine cleavage system H protein  48.15 
 
 		 129 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471951  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47270  Glycine cleavage system H protein  50.45 
 
 		 129 aa  112  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.666574  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1156  glycine cleavage system protein H  46.72 
 
 		 131 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3224  glycine cleavage system protein H  48.15 
 
 		 129 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3391  glycine cleavage system protein H  48.15 
 
 		 129 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.317969  normal  0.844228 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3289  glycine cleavage system protein H  48.15 
 
 		 129 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2621  glycine cleavage system protein H  54.9 
 
 		 128 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.233728  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3286  glycine cleavage system protein H  48.15 
 
 		 129 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1612  glycine cleavage system protein H  47.54 
 
 		 127 aa  112  2.0000000000000002e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.645617  normal  0.608002 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3325  glycine cleavage system protein H  48.15 
 
 		 129 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02699  hypothetical protein  48.15 
 
 		 129 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0553776  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3212  glycine cleavage system protein H  48.15 
 
 		 129 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0254293  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0805  glycine cleavage system protein H  48.15 
 
 		 129 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0782061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3036  glycine cleavage system protein H  48.15 
 
 		 129 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.197625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4195  glycine cleavage system protein H  48.15 
 
 		 129 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>