278 genes were found for organism Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Rsph17025_3972  CDS  NC_009430  145  510  -  366  hypothetical protein  YP_001170131  normal  0.251751  normal  0.514819  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_3973  CDS  NC_009430  581  1243  -  663  hypothetical protein  YP_001170132  normal  0.208047  normal  0.570068  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_3974  CDS  NC_009430  1259  1573  -  315  hypothetical protein  YP_001170133  normal  0.200853  normal  0.650334  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_3975  CDS  NC_009430  1649  3241  -  1593  hypothetical protein  YP_001170134  normal  0.0525251  normal  0.854818  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_3976  CDS  NC_009430  3238  3975  -  738  short chain dehydrogenase  YP_001170135  decreased coverage  0.00930617  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_3977  CDS  NC_009430  3972  5300  -  1329  hypothetical protein  YP_001170136  normal  0.217761  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_3978  CDS  NC_009430  5285  6448  -  1164  hypothetical protein  YP_001170137  normal  0.0578608  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_3979  CDS  NC_009430  6426  6833  -  408  hypothetical protein  YP_001170138  normal  0.0267676  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_3980  CDS  NC_009430  6830  8326  -  1497  hypothetical protein  YP_001170139  normal  0.0272963  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_3981  CDS  NC_009430  8571  8969  -  399  hypothetical protein  YP_001170140  normal  0.110322  normal  0.895994  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_3982  CDS  NC_009430  9119  9520  -  402  hypothetical protein  YP_001170141  normal  0.140704  normal  0.700987  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_3983  CDS  NC_009430  9704  10324  -  621  hypothetical protein  YP_001170142  normal  0.117251  normal  0.595141  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_3984  CDS  NC_009430  10448  11251  -  804  hypothetical protein  YP_001170143  normal  0.0166337  normal  0.483742  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_3985  CDS  NC_009430  11544  12485  +  942  nitrate reductase cytochrome c-type subunit-like protein  YP_001170144  normal  0.0488517  normal  0.409632  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_3986  CDS  NC_009430  12803  13036  +  234  hypothetical protein  YP_001170145  normal  0.11803  normal  0.337868  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_3987  CDS  NC_009430  13045  13227  +  183  hypothetical protein  YP_001170146  normal  0.0679301  normal  0.255025  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_3988  CDS  NC_009430  13235  13717  +  483  hypothetical protein  YP_001170147  normal  0.0935811  normal  0.360541  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_3989  CDS  NC_009430  13710  13976  +  267  hypothetical protein  YP_001170148  normal  0.0900917  normal  0.575525  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_3990  CDS  NC_009430  13973  16468  +  2496  nitrate reductase catalytic subunit  YP_001170149  normal  0.214468  normal  0.774592  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_3991  CDS  NC_009430  16534  16950  +  417  hypothetical protein  YP_001170150  normal  0.0187706  normal  0.3713  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_3992  CDS  NC_009430  16952  17620  +  669  hypothetical protein  YP_001170151  normal  0.0212723  normal  0.240868  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_3993  CDS  NC_009430  17704  18774  +  1071  hypothetical protein  YP_001170152  normal  0.0182739  normal  0.26526  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_3994  CDS  NC_009430  18779  21157  -  2379  hypothetical protein  YP_001170153  normal  0.535307  normal  0.386715  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_3995  CDS  NC_009430  21661  22200  -  540  hypothetical protein  YP_001170154  normal  0.67953  normal  0.524106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_3996  CDS  NC_009430  22339  23136  -  798  hypothetical protein  YP_001170155  normal  0.106596  normal  0.688861  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_3997  CDS  NC_009430  23232  24710  +  1479  hypothetical protein  YP_001170156  normal  0.740683  normal  0.827295  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_3998  CDS  NC_009430  24925  25425  -  501  hypothetical protein  YP_001170157  normal  0.406673  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_3999  CDS  NC_009430  25763  26947  +  1185  nitroreductase  YP_001170158  normal  0.483362  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4000  CDS  NC_009430  27188  28339  +  1152  hypothetical protein  YP_001170159  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4001  CDS  NC_009430  28341  29303  +  963  hypothetical protein  YP_001170160  normal  0.891502  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4002  CDS  NC_009430  29574  32177  +  2604  hypothetical protein  YP_001170161  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4003  CDS  NC_009430  32265  34172  +  1908  hypothetical protein  YP_001170162  normal  0.738232  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4004  CDS  NC_009430  34091  35302  -  1212  hypothetical protein  YP_001170163  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4005  CDS  NC_009430  35312  36583  -  1272  hypothetical protein  YP_001170164  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4006    NC_009430  36800  37830  -  1031      normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4007  CDS  NC_009430  37868  38353  -  486  hypothetical protein  YP_001170165  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4008  CDS  NC_009430  38382  39035  -  654  hypothetical protein  YP_001170166  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4009  CDS  NC_009430  39141  40190  +  1050  hypothetical protein  YP_001170167  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4010  CDS  NC_009430  40354  40935  -  582  hypothetical protein  YP_001170168  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4011  CDS  NC_009430  41337  41558  +  222  transketolase  YP_001170169  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4012  CDS  NC_009430  41591  42328  -  738  hypothetical protein  YP_001170170  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4013  CDS  NC_009430  42347  42628  +  282  hypothetical protein  YP_001170171  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4014  CDS  NC_009430  42680  43963  -  1284  hypothetical protein  YP_001170172  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4015  CDS  NC_009430  44477  45472  +  996  hypothetical protein  YP_001170173  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4016  CDS  NC_009430  45475  46353  +  879  hypothetical protein  YP_001170174  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4017  CDS  NC_009430  46414  48387  +  1974  transketolase  YP_001170175  normal  0.212996  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4018  CDS  NC_009430  48398  49399  +  1002  hypothetical protein  YP_001170176  normal  0.416304  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4019  CDS  NC_009430  49480  50544  +  1065  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  YP_001170177  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4020  CDS  NC_009430  50571  51956  +  1386  ribulose bisphosphate carboxylase  YP_001170178  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4021  CDS  NC_009430  52059  53411  +  1353  hypothetical protein  YP_001170179  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4022  CDS  NC_009430  53421  53774  +  354  hypothetical protein  YP_001170180  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4023  CDS  NC_009430  59883  60947  -  1065  hypothetical protein  YP_001170181  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4024  CDS  NC_009430  60910  61233  -  324  hypothetical protein  YP_001170182  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4025  CDS  NC_009430  61327  62739  -  1413  hypothetical protein  YP_001170183  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4026  CDS  NC_009430  62824  63063  -  240  hypothetical protein  YP_001170184  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4027    NC_009430  63123  63532  -  410      normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4028  CDS  NC_009430  63542  63937  -  396  hypothetical protein  YP_001170185  normal  1  normal  1  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4029  CDS  NC_009430  63977  64285  +  309  hypothetical protein  YP_001170186  normal  1  normal  0.64412  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4030  CDS  NC_009430  64350  65135  -  786  beta strand repeat-containing protein  YP_001170187  normal  1  normal  0.56373  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4031  CDS  NC_009430  65168  65554  -  387  hypothetical protein  YP_001170188  normal  1  normal  0.4001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4032  CDS  NC_009430  65574  66776  -  1203  beta strand repeat-containing protein  YP_001170189  normal  1  normal  0.488717  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4033  CDS  NC_009430  66810  67190  -  381  hypothetical protein  YP_001170190  normal  1  normal  0.394395  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4034  CDS  NC_009430  67304  68716  +  1413  hypothetical protein  YP_001170191  normal  1  normal  0.287551  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4035  CDS  NC_009430  68719  71703  -  2985  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase Dut  YP_001170192  normal  1  normal  0.565458  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4036  CDS  NC_009430  71928  72497  +  570  hypothetical protein  YP_001170193  normal  1  normal  0.416185  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4037  CDS  NC_009430  72514  74163  +  1650  hypothetical protein  YP_001170194  normal  1  normal  0.677701  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4038  CDS  NC_009430  74237  74704  -  468  hypothetical protein  YP_001170195  normal  1  normal  0.863887  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4039  CDS  NC_009430  74885  76231  -  1347  hypothetical protein  YP_001170196  normal  1  normal  0.415702  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4040  CDS  NC_009430  76316  76594  +  279  hypothetical protein  YP_001170197  normal  0.370829  normal  0.417216  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4041  CDS  NC_009430  76694  78469  +  1776  hypothetical protein  YP_001170198  normal  0.116876  normal  0.77295  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4042  CDS  NC_009430  78525  79478  +  954  hypothetical protein  YP_001170199  normal  1  normal  0.663296  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4043  CDS  NC_009430  79475  80329  +  855  hypothetical protein  YP_001170200  normal  0.587749  normal  0.406435  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4044  CDS  NC_009430  80326  81348  +  1023  hypothetical protein  YP_001170201  normal  0.229288  normal  0.25378  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4045  CDS  NC_009430  81345  82514  +  1170  hypothetical protein  YP_001170202  normal  0.0317207  normal  0.284083  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4046  CDS  NC_009430  82514  82978  +  465  hypothetical protein  YP_001170203  normal  0.0836532  normal  0.23815  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4047  CDS  NC_009430  82992  85511  +  2520  hypothetical protein  YP_001170204  normal  0.166199  normal  0.175884  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4048  CDS  NC_009430  85759  87198  +  1440  hypothetical protein  YP_001170205  normal  0.422059  normal  0.0578992  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4049  CDS  NC_009430  87413  88114  +  702  hypothetical protein  YP_001170206  normal  0.502434  normal  0.0734559  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4050  CDS  NC_009430  88116  90005  +  1890  hypothetical protein  YP_001170207  normal  0.35522  normal  0.114627  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4051  CDS  NC_009430  90015  91271  +  1257  hypothetical protein  YP_001170208  normal  0.749152  normal  0.1289  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4052  CDS  NC_009430  91268  94330  +  3063  hypothetical protein  YP_001170209  normal  0.0348037  normal  0.215609  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4053  CDS  NC_009430  94344  97016  +  2673  hypothetical protein  YP_001170210  normal  0.0957492  normal  0.154927  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4054  CDS  NC_009430  97013  98074  +  1062  hypothetical protein  YP_001170211  normal  0.0539477  normal  0.260447  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4055  CDS  NC_009430  98071  99975  +  1905  hypothetical protein  YP_001170212  normal  0.0161077  normal  0.249127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4056  CDS  NC_009430  99980  100714  +  735  hypothetical protein  YP_001170213  normal  0.0200759  normal  0.24116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4057  CDS  NC_009430  100711  101910  +  1200  hypothetical protein  YP_001170214  normal  0.058101  normal  0.267304  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4058  CDS  NC_009430  101907  103544  +  1638  hypothetical protein  YP_001170215  hitchhiker  0.00410401  normal  0.150946  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4059  CDS  NC_009430  103765  104238  +  474  hypothetical protein  YP_001170216  hitchhiker  0.00189855  normal  0.257294  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4060  CDS  NC_009430  104275  105210  -  936  hypothetical protein  YP_001170217  normal  0.0282036  normal  0.215669  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4061  CDS  NC_009430  105301  106263  +  963  hypothetical protein  YP_001170218  normal  0.0773794  normal  0.300283  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4062  CDS  NC_009430  106242  107150  -  909  hypothetical protein  YP_001170219  normal  0.228225  normal  0.120917  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4063  CDS  NC_009430  107250  108671  +  1422  ribulose bisophosphate carboxylase  YP_001170220  normal  1  normal  0.134131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4064  CDS  NC_009430  108689  109042  +  354  hypothetical protein  YP_001170221  normal  1  normal  0.273797  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4065  CDS  NC_009430  109096  109911  +  816  hypothetical protein  YP_001170222  normal  1  normal  0.312415  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4066  CDS  NC_009430  109908  112139  +  2232  hypothetical protein  YP_001170223  normal  1  normal  0.247761  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4067  CDS  NC_009430  112482  116810  +  4329  hypothetical protein  YP_001170224  normal  0.715218  normal  0.232276  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4068  CDS  NC_009430  117002  118813  +  1812  hypothetical protein  YP_001170225  normal  0.035977  normal  0.145106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4069  CDS  NC_009430  118838  119929  +  1092  hypothetical protein  YP_001170226  normal  0.487038  normal  0.116036  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4070  CDS  NC_009430  119937  121010  +  1074  hypothetical protein  YP_001170227  normal  0.141328  normal  0.0763536  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Rsph17025_4071  CDS  NC_009430  120988  122313  -  1326  hypothetical protein  YP_001170228  normal  0.266813  normal  0.0727287  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>