110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_4010 on replicon NC_009430
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009430  Rsph17025_4010  hypothetical protein  100 
 
 
193 aa  384  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0730  hypothetical protein  95.39 
 
 
166 aa  264  7e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1428  hypothetical protein  94.74 
 
 
163 aa  261  4e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3828  hypothetical protein  94.74 
 
 
163 aa  261  4e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.73032 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1534  transposase IS3/IS911 family protein  50.63 
 
 
162 aa  151  5.9999999999999996e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.200633  normal  0.785426 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2336  hypothetical protein  54.74 
 
 
163 aa  149  2e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2330  hypothetical protein  53.28 
 
 
163 aa  145  4.0000000000000006e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.508693 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4452  transposase IS3/IS911 family protein  45.33 
 
 
165 aa  137  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000855993  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2023  transposase IS3/IS911 family protein  49.39 
 
 
166 aa  132  3e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2333  hypothetical protein  58.82 
 
 
111 aa  125  5e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4442  transposase IS3/IS911 family protein  45.12 
 
 
166 aa  121  6e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.380307  normal  0.586119 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0253  transposase IS3/IS911 family protein  45.12 
 
 
166 aa  121  6e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0454  transposase IS3/IS911 family protein  45.12 
 
 
166 aa  121  6e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1096  transposase IS3/IS911 family protein  45.12 
 
 
166 aa  121  6e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1142  transposase IS3/IS911 family protein  45.12 
 
 
166 aa  121  6e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.646634  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1258  transposase IS3/IS911 family protein  45.12 
 
 
166 aa  121  6e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1264  transposase IS3/IS911 family protein  45.12 
 
 
166 aa  121  6e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1931  transposase IS3/IS911 family protein  45.12 
 
 
166 aa  121  6e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2048  transposase IS3/IS911 family protein  45.12 
 
 
166 aa  121  6e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2090  transposase IS3/IS911 family protein  45.12 
 
 
166 aa  121  6e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2333  transposase IS3/IS911 family protein  45.12 
 
 
166 aa  121  6e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2585  transposase IS3/IS911 family protein  45.12 
 
 
166 aa  121  6e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.664533  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2625  transposase IS3/IS911 family protein  45.12 
 
 
166 aa  121  6e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3062  transposase IS3/IS911 family protein  45.12 
 
 
166 aa  121  6e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3544  transposase IS3/IS911 family protein  45.12 
 
 
166 aa  121  6e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3682  transposase IS3/IS911 family protein  45.12 
 
 
166 aa  121  6e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4310  transposase IS3/IS911 family protein  45.12 
 
 
166 aa  121  6e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4319  transposase IS3/IS911 family protein  45.12 
 
 
166 aa  121  6e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2064  hypothetical protein  42.55 
 
 
148 aa  120  9.999999999999999e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000338924  decreased coverage  0.0000208115 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3415  transposase IS3/IS911 family protein  48.67 
 
 
160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3393  transposase IS3/IS911 family protein  47.65 
 
 
167 aa  118  4.9999999999999996e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01717  hypothetical protein  43.17 
 
 
145 aa  116  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02044  hypothetical protein  43.17 
 
 
145 aa  116  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02797  hypothetical protein  43.17 
 
 
145 aa  116  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02881  hypothetical protein  43.17 
 
 
145 aa  116  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04733  hypothetical protein  43.17 
 
 
145 aa  116  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04944  hypothetical protein  43.17 
 
 
145 aa  116  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05295  hypothetical protein  43.17 
 
 
145 aa  116  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05475  hypothetical protein  43.17 
 
 
145 aa  116  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05743  hypothetical protein  43.17 
 
 
145 aa  116  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05754  hypothetical protein  43.17 
 
 
145 aa  116  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06030  hypothetical protein  43.17 
 
 
145 aa  116  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06490  hypothetical protein  43.17 
 
 
145 aa  116  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06979  hypothetical protein  43.17 
 
 
145 aa  116  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07081  hypothetical protein  43.17 
 
 
145 aa  116  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01832  transposase IS3/IS911 family protein  43.38 
 
 
163 aa  115  3e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01834  transposase IS3/IS911 family protein  43.38 
 
 
163 aa  115  3e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02258  transposase IS3/IS911 family protein  43.38 
 
 
163 aa  115  3e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02619  transposase IS3/IS911 family protein  43.38 
 
 
163 aa  115  3e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1540  transposase IS3/IS911 family protein  41.51 
 
 
174 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3820  transposase IS3/IS911 family protein  41.51 
 
 
174 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00160807  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2567  transposase IS3/IS911 family protein  46.36 
 
 
160 aa  114  6.9999999999999995e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3412  transposase IS3/IS911 family protein  46.36 
 
 
160 aa  114  6.9999999999999995e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2393  ISAfe5, transposase orfA  46.71 
 
 
151 aa  114  6.9999999999999995e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2067  hypothetical protein  44.67 
 
 
166 aa  112  3e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2169  hypothetical protein  44.67 
 
 
166 aa  112  3e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1476  hypothetical protein  40.15 
 
 
166 aa  111  6e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3125  transposase IS3/IS911 family protein  37.04 
 
 
165 aa  111  6e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000279784  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1035  transposase IS3/IS911 family protein  41.73 
 
 
163 aa  110  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3129  transposase IS3/IS911 family protein  41.73 
 
 
163 aa  110  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4150  transposase IS3/IS911 family protein  41.73 
 
 
163 aa  109  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0301  transposase IS3/IS911 family protein  42.31 
 
 
147 aa  103  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.601541  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0129  hypothetical protein  40 
 
 
166 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0729  hypothetical protein  40 
 
 
166 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0817  hypothetical protein  40 
 
 
166 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1253  hypothetical protein  40 
 
 
166 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1941  hypothetical protein  40 
 
 
166 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3142  hypothetical protein  40 
 
 
166 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.457423  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4351  hypothetical protein  40 
 
 
166 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0370  transposase IS3/IS911 family protein  40.99 
 
 
157 aa  100  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.312687 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3000  transposition helper protein  39.87 
 
 
157 aa  95.1  5e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2307  transposition helper protein  40.97 
 
 
145 aa  94.4  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0695  transposition helper protein  40.13 
 
 
157 aa  92  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0719  transposition helper protein  40.13 
 
 
157 aa  92  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1074  transposition helper protein  40.13 
 
 
157 aa  92  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1104  transposition helper protein  40.13 
 
 
157 aa  92  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.185893  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1518  transposition helper protein  40.13 
 
 
157 aa  92  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0440245  normal  0.353489 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1906  transposition helper protein  40.13 
 
 
157 aa  92  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.126399  hitchhiker  0.00245638 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2136  transposition helper protein  40.13 
 
 
157 aa  92  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.737465 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2426  transposition helper protein  40.13 
 
 
157 aa  92  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2774  transposition helper protein  40.13 
 
 
157 aa  92  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.499987  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2874  transposition helper protein  40.13 
 
 
157 aa  92  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3342  transposition helper protein  40.13 
 
 
157 aa  92  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3661  transposition helper protein  40.13 
 
 
157 aa  92  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.690061  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3764  transposition helper protein  40.13 
 
 
157 aa  92  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.988067  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3793  transposition helper protein  40.13 
 
 
157 aa  92  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4358  transposition helper protein  40.13 
 
 
157 aa  92  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2149  putative transposase  31.88 
 
 
161 aa  81.6  0.000000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.150452  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0375  putative transposase  34.11 
 
 
160 aa  78.2  0.00000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000100064  normal 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2535  putative transposase  34.11 
 
 
160 aa  78.2  0.00000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000152425  normal  0.735712 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3797  transposition helper protein  42.28 
 
 
125 aa  76.6  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.754875  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0646  transposase IS3/IS911 family protein  28.99 
 
 
161 aa  72.4  0.000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000318322  normal  0.432227 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1099  transposase IS3/IS911 family protein  28.99 
 
 
161 aa  72.4  0.000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00548564  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4152  transposition helper protein  48.81 
 
 
94 aa  72  0.000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2336  transposase IS3/IS911 family protein  34.18 
 
 
161 aa  71.2  0.000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1699  transposase IS3/IS911 family protein  30.09 
 
 
161 aa  63.9  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.00000000451085  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0650  transposase IS3/IS911 family protein  29.57 
 
 
161 aa  64.3  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.124888  normal  0.267148 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2501  hypothetical protein  28.67 
 
 
171 aa  62.8  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3103  transposase IS3/IS911 family protein  36.56 
 
 
116 aa  61.2  0.000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0317  hypothetical protein  31.79 
 
 
177 aa  58.2  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>