34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3989 on replicon NC_009430
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009430  Rsph17025_3989  hypothetical protein  100 
 
 		 88 aa  172  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0900917  normal  0.575525 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4115  NapD  77.27 
 
 		 88 aa  130  5e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.898096  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4720  NapD family protein  40.28 
 
 		 112 aa  56.2  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0174846  normal  0.0205455 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5179  NapD family protein  37.8 
 
 		 95 aa  54.7  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.60419  normal  0.85901 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1863  putative periplasmic nitrate reductase NapD  35.06 
 
 		 106 aa  54.3  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2939  NapD family protein  37.8 
 
 		 85 aa  52  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0951  NapD  36.84 
 
 		 105 aa  50.4  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3147  NapD family protein  34.57 
 
 		 89 aa  49.3  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2437  NapD family protein  29.89 
 
 		 114 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2843  NapD family protein  29.89 
 
 		 114 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3205  NapD family protein  29.63 
 
 		 89 aa  47  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3317  NapD family protein  32.89 
 
 		 94 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0849  napD protein  32.89 
 
 		 94 aa  45.4  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3429  NapD family protein  32.1 
 
 		 89 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0705  NapD family protein  32.89 
 
 		 94 aa  44.7  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2681  NapD family protein  30.67 
 
 		 85 aa  44.7  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.999637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4762  NapD  34.94 
 
 		 112 aa  44.3  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1942  NapD family protein  32 
 
 		 85 aa  43.5  0.0009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1909  NapD family protein  32 
 
 		 85 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2384  NapD family protein  32 
 
 		 85 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.497858  normal  0.195982 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1841  NapD family protein  30.99 
 
 		 85 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00301872 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2136  NapD family protein  30.99 
 
 		 85 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000204856 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2428  NapD family protein  29.33 
 
 		 85 aa  43.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.148469  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1935  NapD family protein  32 
 
 		 85 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.129658  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1899  NapD family protein  30.99 
 
 		 85 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000452932 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2554  NapD family protein  29.33 
 
 		 85 aa  42.7  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2175  nitrate reductase accessory periplasmic protein NapD  29.76 
 
 		 86 aa  42.4  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.791582  normal  0.971887 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1769  NapD family protein  28 
 
 		 87 aa  42  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0366  putative periplasmic nitrate reductase NapD  33.33 
 
 		 111 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.99839  hitchhiker  0.000161286 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1902  NapD family protein  30.67 
 
 		 85 aa  41.6  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2980  NapD family protein  35.53 
 
 		 86 aa  41.2  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.060812 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05378  NapD protein, subunit of nitrate reductase  29.33 
 
 		 102 aa  40.8  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1155  NapD  25.84 
 
 		 111 aa  40.8  0.006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.23731  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4064  putative periplasmic nitrate reductase  32.53 
 
 		 109 aa  40.8  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0373791  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>