17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3985 on replicon NC_009430
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009430  Rsph17025_3985  nitrate reductase cytochrome c-type subunit-like protein  100 
 
 		 313 aa  626  1e-178  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0488517  normal  0.409632 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1404  hypothetical protein  75.16 
 
 		 322 aa  478  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2745  hypothetical protein  74.52 
 
 		 322 aa  474  1e-133  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.357764  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0988  hypothetical protein  33.87 
 
 		 332 aa  206  5e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0393055  hitchhiker  0.0000000156201 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0381  hypothetical protein  34.16 
 
 		 343 aa  197  2.0000000000000003e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1761  hypothetical protein  34.04 
 
 		 324 aa  155  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3861  hypothetical protein  30.36 
 
 		 350 aa  136  6.0000000000000005e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00579635 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5672  UDP-N-acetylglucosamine--lysosomal-enzyme N-acetylglucosamine phosphotransferase  30.62 
 
 		 593 aa  129  7.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0990491 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5673  UDP-N-acetylglucosamine--lysosomal-enzyme N-acetylglucosamine phosphotransferase  30.89 
 
 		 549 aa  128  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0913502 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0639  hypothetical protein  32.04 
 
 		 519 aa  119  7.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.27661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0904  glycosyl transferase, group 1  32.71 
 
 		 890 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.145803  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10821  UDP-glucose-4-epimerase cpsY  28.12 
 
 		 532 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.489174  normal  0.189517 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0699  putative UDP-glucose-4-epimerase  26.1 
 
 		 545 aa  95.9  8e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12340  hypothetical protein  37.24 
 
 		 337 aa  88.2  2e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0562  putative UDP-glucose-4-epimerase  25.16 
 
 		 491 aa  85.5  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1500  glycosyltransferase  23.58 
 
 		 337 aa  80.1  0.00000000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0216  glycosyltransferase  25 
 
 		 330 aa  65.5  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>