18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_12340 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_12340  hypothetical protein  100 
 
 		 337 aa  704    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1500  glycosyltransferase  34.63 
 
 		 337 aa  215  7e-55  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0216  glycosyltransferase  35.85 
 
 		 330 aa  186  6e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0904  glycosyl transferase, group 1  42.86 
 
 		 890 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.145803  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5673  UDP-N-acetylglucosamine--lysosomal-enzyme N-acetylglucosamine phosphotransferase  34.74 
 
 		 549 aa  122  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0913502 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10821  UDP-glucose-4-epimerase cpsY  37.43 
 
 		 532 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.489174  normal  0.189517 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0699  putative UDP-glucose-4-epimerase  28.02 
 
 		 545 aa  109  8.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5672  UDP-N-acetylglucosamine--lysosomal-enzyme N-acetylglucosamine phosphotransferase  30.59 
 
 		 593 aa  108  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0990491 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0562  putative UDP-glucose-4-epimerase  39.62 
 
 		 491 aa  108  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0639  hypothetical protein  27.51 
 
 		 519 aa  106  6e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.27661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2745  hypothetical protein  36.55 
 
 		 322 aa  91.3  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.357764  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1404  hypothetical protein  36.55 
 
 		 322 aa  91.3  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3985  nitrate reductase cytochrome c-type subunit-like protein  37.24 
 
 		 313 aa  87.8  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0488517  normal  0.409632 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0988  hypothetical protein  29.66 
 
 		 332 aa  82  0.00000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0393055  hitchhiker  0.0000000156201 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0381  hypothetical protein  34.64 
 
 		 343 aa  80.5  0.00000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3861  hypothetical protein  32.65 
 
 		 350 aa  71.6  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00579635 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1761  hypothetical protein  31.54 
 
 		 324 aa  58.5  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01370  expressed protein  32.35 
 
 		 830 aa  52  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.106598  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>