19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5672 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_5672  UDP-N-acetylglucosamine--lysosomal-enzyme N-acetylglucosamine phosphotransferase  100 
 
 
593 aa  1206    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0990491 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0639  hypothetical protein  44.27 
 
 
519 aa  376  1e-103  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.27661  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5673  UDP-N-acetylglucosamine--lysosomal-enzyme N-acetylglucosamine phosphotransferase  40.36 
 
 
549 aa  359  6e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0913502 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0562  putative UDP-glucose-4-epimerase  34.65 
 
 
491 aa  263  4.999999999999999e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0699  putative UDP-glucose-4-epimerase  34.86 
 
 
545 aa  258  2e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0904  glycosyl transferase, group 1  37.97 
 
 
890 aa  248  3e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.145803  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10821  UDP-glucose-4-epimerase cpsY  34.68 
 
 
532 aa  244  3e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.489174  normal  0.189517 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1404  hypothetical protein  31.91 
 
 
322 aa  133  9e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2745  hypothetical protein  31.91 
 
 
322 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.357764  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3985  nitrate reductase cytochrome c-type subunit-like protein  29.87 
 
 
313 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0488517  normal  0.409632 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0216  glycosyltransferase  42.96 
 
 
330 aa  122  1.9999999999999998e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1500  glycosyltransferase  28.66 
 
 
337 aa  115  2.0000000000000002e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3861  hypothetical protein  42.36 
 
 
350 aa  111  3e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00579635 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12340  hypothetical protein  30.59 
 
 
337 aa  108  2e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0988  hypothetical protein  25.45 
 
 
332 aa  107  7e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0393055  hitchhiker  0.0000000156201 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0381  hypothetical protein  42.47 
 
 
343 aa  103  7e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1761  hypothetical protein  38.46 
 
 
324 aa  89  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01370  expressed protein  30.83 
 
 
830 aa  55.5  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.106598  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02890  hypothetical protein  25 
 
 
864 aa  49.7  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.784499  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>