19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0639 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0639  hypothetical protein  100 
 
 
519 aa  1050    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.27661  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5673  UDP-N-acetylglucosamine--lysosomal-enzyme N-acetylglucosamine phosphotransferase  46.02 
 
 
549 aa  420  1e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0913502 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5672  UDP-N-acetylglucosamine--lysosomal-enzyme N-acetylglucosamine phosphotransferase  44.27 
 
 
593 aa  390  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0990491 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0699  putative UDP-glucose-4-epimerase  36.05 
 
 
545 aa  309  6.999999999999999e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0562  putative UDP-glucose-4-epimerase  36 
 
 
491 aa  300  3e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10821  UDP-glucose-4-epimerase cpsY  36.64 
 
 
532 aa  286  7e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.489174  normal  0.189517 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0904  glycosyl transferase, group 1  43.43 
 
 
890 aa  278  1e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.145803  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3985  nitrate reductase cytochrome c-type subunit-like protein  31.82 
 
 
313 aa  125  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0488517  normal  0.409632 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1404  hypothetical protein  30.94 
 
 
322 aa  121  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2745  hypothetical protein  34.66 
 
 
322 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.357764  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0216  glycosyltransferase  38.89 
 
 
330 aa  115  3e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3861  hypothetical protein  33.76 
 
 
350 aa  112  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00579635 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0381  hypothetical protein  29.94 
 
 
343 aa  112  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0988  hypothetical protein  26.54 
 
 
332 aa  110  5e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0393055  hitchhiker  0.0000000156201 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12340  hypothetical protein  28.08 
 
 
337 aa  108  3e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1500  glycosyltransferase  36.05 
 
 
337 aa  103  6e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1761  hypothetical protein  33.33 
 
 
324 aa  75.5  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02890  hypothetical protein  27.53 
 
 
864 aa  54.3  0.000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.784499  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01370  expressed protein  28.79 
 
 
830 aa  49.7  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.106598  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>