18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0381 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0381  hypothetical protein  100 
 
 		 343 aa  707    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2745  hypothetical protein  34.58 
 
 		 322 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.357764  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1404  hypothetical protein  34.58 
 
 		 322 aa  199  5e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0988  hypothetical protein  36.14 
 
 		 332 aa  182  7e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0393055  hitchhiker  0.0000000156201 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3985  nitrate reductase cytochrome c-type subunit-like protein  34.16 
 
 		 313 aa  182  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0488517  normal  0.409632 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3861  hypothetical protein  34.84 
 
 		 350 aa  157  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00579635 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1761  hypothetical protein  31.25 
 
 		 324 aa  139  8.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0639  hypothetical protein  29.94 
 
 		 519 aa  105  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.27661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5672  UDP-N-acetylglucosamine--lysosomal-enzyme N-acetylglucosamine phosphotransferase  42.47 
 
 		 593 aa  103  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0990491 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5673  UDP-N-acetylglucosamine--lysosomal-enzyme N-acetylglucosamine phosphotransferase  38.75 
 
 		 549 aa  103  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0913502 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0904  glycosyl transferase, group 1  41.1 
 
 		 890 aa  97.4  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.145803  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1500  glycosyltransferase  32.05 
 
 		 337 aa  85.5  0.000000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10821  UDP-glucose-4-epimerase cpsY  35.71 
 
 		 532 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.489174  normal  0.189517 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12340  hypothetical protein  34.64 
 
 		 337 aa  80.5  0.00000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0699  putative UDP-glucose-4-epimerase  34.48 
 
 		 545 aa  73.2  0.000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0562  putative UDP-glucose-4-epimerase  31.37 
 
 		 491 aa  69.7  0.00000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0216  glycosyltransferase  30.26 
 
 		 330 aa  67.8  0.0000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02890  hypothetical protein  56.1 
 
 		 864 aa  42.7  0.008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.784499  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>