19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10821 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_10821  UDP-glucose-4-epimerase cpsY  100 
 
 
532 aa  1092    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.489174  normal  0.189517 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0699  putative UDP-glucose-4-epimerase  61.21 
 
 
545 aa  625  1e-178  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0562  putative UDP-glucose-4-epimerase  61.3 
 
 
491 aa  621  1e-177  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0639  hypothetical protein  36.64 
 
 
519 aa  277  3e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.27661  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5673  UDP-N-acetylglucosamine--lysosomal-enzyme N-acetylglucosamine phosphotransferase  40.29 
 
 
549 aa  276  8e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0913502 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0904  glycosyl transferase, group 1  41.88 
 
 
890 aa  251  2e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.145803  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5672  UDP-N-acetylglucosamine--lysosomal-enzyme N-acetylglucosamine phosphotransferase  34.68 
 
 
593 aa  244  3e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0990491 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12340  hypothetical protein  37.43 
 
 
337 aa  112  2.0000000000000002e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1500  glycosyltransferase  30.97 
 
 
337 aa  110  6e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3985  nitrate reductase cytochrome c-type subunit-like protein  28.12 
 
 
313 aa  104  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0488517  normal  0.409632 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0216  glycosyltransferase  26.92 
 
 
330 aa  104  4e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2745  hypothetical protein  27.44 
 
 
322 aa  98.6  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.357764  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1404  hypothetical protein  27.64 
 
 
322 aa  96.3  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0988  hypothetical protein  27.75 
 
 
332 aa  92  2e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0393055  hitchhiker  0.0000000156201 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3861  hypothetical protein  27.27 
 
 
350 aa  87.8  5e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00579635 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0381  hypothetical protein  35.71 
 
 
343 aa  82.4  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1761  hypothetical protein  43.43 
 
 
324 aa  73.6  0.000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02890  hypothetical protein  30.83 
 
 
864 aa  51.6  0.00003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.784499  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01370  expressed protein  45.28 
 
 
830 aa  49.3  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.106598  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>