18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_1500 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_1500  glycosyltransferase  100 
 
 
337 aa  688    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12340  hypothetical protein  34.63 
 
 
337 aa  215  7e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0216  glycosyltransferase  34.94 
 
 
330 aa  185  9e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5673  UDP-N-acetylglucosamine--lysosomal-enzyme N-acetylglucosamine phosphotransferase  37.78 
 
 
549 aa  125  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0913502 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5672  UDP-N-acetylglucosamine--lysosomal-enzyme N-acetylglucosamine phosphotransferase  28.66 
 
 
593 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0990491 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0904  glycosyl transferase, group 1  38.13 
 
 
890 aa  113  6e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.145803  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10821  UDP-glucose-4-epimerase cpsY  30.97 
 
 
532 aa  110  3e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.489174  normal  0.189517 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0699  putative UDP-glucose-4-epimerase  40.14 
 
 
545 aa  107  3e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0562  putative UDP-glucose-4-epimerase  40.14 
 
 
491 aa  103  3e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0639  hypothetical protein  24.41 
 
 
519 aa  97.1  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.27661  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3861  hypothetical protein  34.38 
 
 
350 aa  96.7  5e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00579635 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0988  hypothetical protein  32.47 
 
 
332 aa  92.4  1e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0393055  hitchhiker  0.0000000156201 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1404  hypothetical protein  24.18 
 
 
322 aa  89  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0381  hypothetical protein  32.05 
 
 
343 aa  85.5  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2745  hypothetical protein  32.08 
 
 
322 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.357764  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1761  hypothetical protein  42.74 
 
 
324 aa  84.7  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3985  nitrate reductase cytochrome c-type subunit-like protein  28.08 
 
 
313 aa  75.9  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0488517  normal  0.409632 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01370  expressed protein  39.44 
 
 
830 aa  51.6  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.106598  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>