More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_4019 on replicon NC_009430
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_4003  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  97.74 
 
 
354 aa  719    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.260153  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4019  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  100 
 
 
354 aa  734    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3270  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  97.46 
 
 
354 aa  717    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1053  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  82.95 
 
 
361 aa  619  1e-176  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.540808  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5123  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  82.67 
 
 
361 aa  616  1e-175  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2896  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  82.39 
 
 
361 aa  614  1e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.399813  normal  0.179502 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2713  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  81.77 
 
 
359 aa  607  1e-173  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0950  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  81.53 
 
 
361 aa  610  1e-173  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2942  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  79.66 
 
 
359 aa  594  1e-169  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1283  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  79.66 
 
 
359 aa  593  1e-168  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4048  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  80.11 
 
 
361 aa  593  1e-168  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.729421  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3752  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  80.11 
 
 
361 aa  593  1e-168  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6398  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  78.98 
 
 
360 aa  588  1e-167  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.698426  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2692  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  79.55 
 
 
361 aa  588  1e-167  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.108693  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1194  fructose-bisphosphate aldolase, class II, Calvin cycle subtype  80.97 
 
 
361 aa  589  1e-167  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0390619 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1698  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  79.49 
 
 
359 aa  585  1e-166  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.0076037  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7283  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  76.35 
 
 
362 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0373571  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3923  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  76.7 
 
 
359 aa  566  1e-160  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2646  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  75 
 
 
355 aa  565  1e-160  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.292128  normal  0.550526 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6004  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  75.21 
 
 
362 aa  566  1e-160  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.086132  decreased coverage  0.00313463 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0156  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  75 
 
 
356 aa  565  1e-160  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.191735 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2369  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  75 
 
 
355 aa  565  1e-160  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.545417 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2325  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  75 
 
 
355 aa  565  1e-160  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.320028  normal  0.350202 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0871  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  76.14 
 
 
354 aa  557  1e-158  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2904  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  75.57 
 
 
354 aa  554  1e-157  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0818  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  75.85 
 
 
354 aa  555  1e-157  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.942349  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0450  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  72.6 
 
 
366 aa  552  1e-156  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.310283  normal  0.0618632 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5315  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  75.21 
 
 
354 aa  550  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6928  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  74.08 
 
 
355 aa  548  1e-155  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.826361  normal  0.18115 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0823  fructose-bisphosphate aldolase, class II  74.36 
 
 
359 aa  546  1e-154  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0765  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  72.49 
 
 
363 aa  536  1e-151  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.290883  normal  0.236212 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0596  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  70.94 
 
 
354 aa  535  1e-151  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2029  fructose-bisphosphate aldolase, class II, Calvin cycle subtype  64.87 
 
 
359 aa  491  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.394674  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1443  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  65.72 
 
 
357 aa  492  9.999999999999999e-139  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.66755  normal  0.139145 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0384  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  67.34 
 
 
354 aa  490  1e-137  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4602  fructose-bisphosphate aldolase  65.25 
 
 
357 aa  489  1e-137  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.200924  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0166  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  64.57 
 
 
359 aa  484  1e-136  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0304491 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2386  fructose-bisphosphate aldolase, class II, Calvin cycle subtype  66.86 
 
 
354 aa  486  1e-136  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.109398 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1039  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  65.25 
 
 
354 aa  486  1e-136  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2492  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  65.04 
 
 
359 aa  486  1e-136  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.180719 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4099  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  64.02 
 
 
359 aa  487  1e-136  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.109682  normal  0.324334 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2844  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  66.1 
 
 
354 aa  486  1e-136  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1912  fructose-bisphosphate aldolase, class II  66.29 
 
 
354 aa  484  1e-136  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.326014  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3037  fructose-bisphosphate aldolase, class II  66.57 
 
 
354 aa  484  1e-136  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0370  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  66.29 
 
 
354 aa  482  1e-135  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0967  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  64.87 
 
 
359 aa  484  1e-135  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0994  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  64.87 
 
 
359 aa  484  1e-135  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.135805  normal  0.788402 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2889  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  66.29 
 
 
354 aa  478  1e-134  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1974  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  65.62 
 
 
363 aa  477  1e-133  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0229  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  65.62 
 
 
363 aa  477  1e-133  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.58536  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3218  fructose-bisphosphate aldolase  64.31 
 
 
354 aa  474  1e-133  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.338247  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1489  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  63.43 
 
 
354 aa  471  1e-132  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.156888  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4787  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  65.16 
 
 
354 aa  472  1e-132  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.111053 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0557  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  64 
 
 
354 aa  471  1e-132  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.368512  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0163  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  64.41 
 
 
355 aa  474  1e-132  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0408428 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2793  fructose-bisphosphate aldolase  67.25 
 
 
345 aa  472  1e-132  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.918989  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0493  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  64 
 
 
354 aa  471  1e-132  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.85021  normal  0.786226 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0480  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  64 
 
 
354 aa  472  1e-132  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.669489  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0390  fructose-bisphosphate aldolase, class II  64.77 
 
 
354 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1815  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  64 
 
 
354 aa  468  1.0000000000000001e-131  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.267172  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05600  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  64.02 
 
 
354 aa  469  1.0000000000000001e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.933141  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4960  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  63.74 
 
 
354 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0573  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  63.71 
 
 
354 aa  466  9.999999999999999e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4833  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  63.74 
 
 
354 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2243  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  64.45 
 
 
349 aa  464  9.999999999999999e-131  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0152373 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1530  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  63.32 
 
 
354 aa  465  9.999999999999999e-131  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3022  fructose-bisphosphate aldolase, class II, Calvin cycle subtype  68.77 
 
 
338 aa  467  9.999999999999999e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625607  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0462  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  63.74 
 
 
354 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07230  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  63.74 
 
 
354 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0506  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  63.74 
 
 
354 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3041  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  63.53 
 
 
354 aa  463  1e-129  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0163377  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3047  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  63.53 
 
 
354 aa  463  1e-129  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.589963  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0875  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  63.07 
 
 
355 aa  462  1e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0933  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  63.07 
 
 
355 aa  461  1e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3624  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  64.53 
 
 
345 aa  462  1e-129  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.113592  normal  0.210537 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2804  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  63.17 
 
 
354 aa  463  1e-129  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0797  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  63.56 
 
 
357 aa  463  1e-129  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.162751  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0658  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  63.46 
 
 
354 aa  464  1e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.76632  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5009  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  63.46 
 
 
354 aa  463  1e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.694536 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0503  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  63.43 
 
 
354 aa  463  1e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.262664  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09801  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  64.41 
 
 
357 aa  461  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.137925  normal  0.129701 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0776  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  63.07 
 
 
355 aa  462  1e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0266968  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3247  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  63.07 
 
 
355 aa  462  1e-129  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0347517  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0405  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  62.46 
 
 
354 aa  461  1e-129  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.841441  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3350  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  63.07 
 
 
355 aa  462  1e-129  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000198413  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3537  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  62.78 
 
 
355 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08421  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  63.92 
 
 
357 aa  458  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.201369  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3596  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  63.61 
 
 
354 aa  459  9.999999999999999e-129  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000879946 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2849  fructose-bisphosphate aldolase, class II, Calvin cycle subtype  63.74 
 
 
356 aa  459  9.999999999999999e-129  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0980884  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5262  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  63.17 
 
 
354 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5957  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  63.14 
 
 
354 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.67865  normal  0.160231 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1857  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  63.84 
 
 
357 aa  458  9.999999999999999e-129  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.114084  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0789  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  63.92 
 
 
357 aa  458  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3656  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  62.78 
 
 
355 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0830  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  62.78 
 
 
355 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.254898  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0672  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  63.14 
 
 
354 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181894  normal  0.967694 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1086  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  62.5 
 
 
355 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000814215  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08441  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  64.2 
 
 
357 aa  459  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3462  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  62.78 
 
 
355 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3248  fructose-bisphosphate aldolase, class II  63.74 
 
 
356 aa  459  9.999999999999999e-129  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>