39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_4045 on replicon NC_009430
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009430  Rsph17025_4045  hypothetical protein  100 
 
 		 389 aa  796    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0317207  normal  0.284083 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0450  FAD dependent oxidoreductase  35.07 
 
 		 378 aa  262  6e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00414514  hitchhiker  0.00267481 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3403  FAD dependent oxidoreductase  37.26 
 
 		 376 aa  258  2e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0307453  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4312  FAD dependent oxidoreductase  40.9 
 
 		 375 aa  218  1e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.366661  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1472  FAD dependent oxidoreductase  31.34 
 
 		 373 aa  193  5e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000096183  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2451  FAD dependent oxidoreductase  23.51 
 
 		 367 aa  63.5  0.000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2496  FAD dependent oxidoreductase  25.9 
 
 		 369 aa  53.5  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3093  FAD dependent oxidoreductase  25.26 
 
 		 369 aa  52.4  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3043  FAD dependent oxidoreductase  27.14 
 
 		 369 aa  51.2  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2959  FAD dependent oxidoreductase  24.91 
 
 		 369 aa  50.4  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.4255 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2434  FAD dependent oxidoreductase  26.62 
 
 		 369 aa  50.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3048  FAD dependent oxidoreductase  26.62 
 
 		 369 aa  50.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3067  FAD dependent oxidoreductase  26.62 
 
 		 369 aa  50.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.41507 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3777  FAD dependent oxidoreductase  25.42 
 
 		 371 aa  50.1  0.00007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.986155 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3382  oxidoreductase, FAD-binding family protein  27.14 
 
 		 373 aa  49.7  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2964  oxidoreductase, FAD-binding family protein  27.14 
 
 		 373 aa  49.7  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2124  oxidoreductase, FAD-binding family protein  27.14 
 
 		 373 aa  49.7  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.646813  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3297  oxidoreductase, FAD-binding family protein  27.14 
 
 		 373 aa  49.7  0.00009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0239  FAD-dependent oxidoreductase  27.14 
 
 		 373 aa  49.3  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.202342  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0251  FAD-dependent oxidoreductase  27.14 
 
 		 373 aa  49.3  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.627616  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0434  oxidoreductase, FAD-binding family protein  27.14 
 
 		 373 aa  49.3  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0953783  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6395  FAD dependent oxidoreductase  26.43 
 
 		 366 aa  49.3  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0217  oxidoreductase, FAD-binding family protein  27.14 
 
 		 373 aa  48.9  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.655071  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2758  FAD dependent oxidoreductase  24.92 
 
 		 370 aa  48.1  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1081  FAD dependent oxidoreductase  21.28 
 
 		 367 aa  48.1  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0868948  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1955  hypothetical protein  36.59 
 
 		 460 aa  47.4  0.0005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0243  FAD dependent oxidoreductase  36.59 
 
 		 460 aa  47  0.0006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1678  FAD dependent oxidoreductase  37.84 
 
 		 464 aa  46.6  0.0008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2910  FAD dependent oxidoreductase  25.22 
 
 		 434 aa  46.6  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.451548  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1140  FAD dependent oxidoreductase  26.57 
 
 		 368 aa  45.1  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0603157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1438  FAD dependent oxidoreductase  31.34 
 
 		 539 aa  45.4  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.198287  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1259  FAD dependent oxidoreductase  24.26 
 
 		 368 aa  44.3  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1916  FAD dependent oxidoreductase  23.19 
 
 		 371 aa  44.7  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0872909 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0387  FAD dependent oxidoreductase  23.91 
 
 		 368 aa  44.3  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1640  FAD dependent oxidoreductase  24.35 
 
 		 366 aa  43.9  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4956  FAD dependent oxidoreductase  25.32 
 
 		 439 aa  44.3  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.579279  normal  0.246978 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1187  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  27.38 
 
 		 390 aa  43.1  0.009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.837023  normal  0.120282 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2649  FAD dependent oxidoreductase  44 
 
 		 465 aa  43.1  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1037  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 433 aa  42.7  0.01  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>