More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_4028 on replicon NC_009430
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009430  Rsph17025_4028  hypothetical protein  100 
 
 
131 aa  261  3e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4297  transposase, mutator type  78.46 
 
 
376 aa  212  9.999999999999999e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.799563  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1122  transposase mutator type  72.31 
 
 
422 aa  195  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.370591  normal  0.143118 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6425  transposase mutator type  72.09 
 
 
422 aa  195  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0049  transposase mutator type  72.31 
 
 
422 aa  195  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2616  transposase mutator type  70.54 
 
 
422 aa  190  6e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.938771  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2156  transposase, mutator type  53.85 
 
 
417 aa  140  4e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0191719  normal  0.0398782 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3955  transposase, mutator type  50.77 
 
 
417 aa  133  7.000000000000001e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2799  transposase, mutator type  50.77 
 
 
417 aa  133  7.000000000000001e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.855527  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1721  transposase, mutator type  50 
 
 
417 aa  130  3.9999999999999996e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3976  transposase, mutator type  52.42 
 
 
222 aa  129  9e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.571911  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0135  transposase mutator type  47.69 
 
 
424 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1330  ISAfe2, transposase  47.69 
 
 
420 aa  129  1.0000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.423267  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3096  transposase mutator type  47.69 
 
 
424 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.312231  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0005  transposase mutator type  47.69 
 
 
424 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0186  transposase mutator type  47.69 
 
 
424 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.183961 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0038  transposase mutator type  47.69 
 
 
424 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1631  transposase, mutator type  49.23 
 
 
415 aa  129  1.0000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2146  transposase, mutator type  49.23 
 
 
415 aa  129  1.0000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3201  transposase, mutator type  49.23 
 
 
415 aa  129  1.0000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0375462  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2717  transposase mutator type  47.69 
 
 
424 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.875305  hitchhiker  0.000051751 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4322  mutator family transposase  47.69 
 
 
421 aa  124  5e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.70031  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0295  transposase  47.69 
 
 
421 aa  124  5e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1810  transposase mutator type  46.92 
 
 
424 aa  121  3e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.214084  hitchhiker  0.00000000849882 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1437  transposase mutator type  46.92 
 
 
424 aa  121  3e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0407  transposase mutator type  46.92 
 
 
424 aa  121  3e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.994637  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1388  transposase mutator type  46.92 
 
 
424 aa  121  3e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0882  transposase mutator type  46.92 
 
 
424 aa  121  3e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.031699  normal  0.346969 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0981  transposase mutator type  46.92 
 
 
424 aa  121  3e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1277  transposase mutator type  46.92 
 
 
424 aa  121  3e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1130  transposase mutator type  46.92 
 
 
424 aa  121  3e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00513551 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0604  transposase, mutator type  48.85 
 
 
439 aa  120  4e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.574476  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2066  transposase, mutator type  48.85 
 
 
439 aa  120  4e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0791542 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4741  transposase, mutator type  48.85 
 
 
439 aa  120  4e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.934265 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0294  transposase mutator type  47.69 
 
 
436 aa  117  3.9999999999999996e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4286  transposase mutator type  47.69 
 
 
436 aa  117  3.9999999999999996e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4276  transposase mutator type  47.69 
 
 
436 aa  117  3.9999999999999996e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4304  transposase mutator type  47.69 
 
 
436 aa  117  3.9999999999999996e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.26589  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0840  transposase, mutator type  46.56 
 
 
439 aa  117  7e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0937  transposase, mutator type  46.56 
 
 
439 aa  117  7e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.336688  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1475  transposase, mutator type  46.56 
 
 
439 aa  117  7e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5433  transposase, mutator type  46.56 
 
 
439 aa  117  7e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.0965425 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5459  transposase, mutator type  46.56 
 
 
439 aa  117  7e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5830  transposase, mutator type  46.56 
 
 
439 aa  117  7e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5856  transposase, mutator type  46.56 
 
 
439 aa  117  7e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.128333  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5450  transposase, mutator type  46.56 
 
 
439 aa  117  7e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.790531  normal  0.0527916 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5584  transposase, mutator type  46.56 
 
 
464 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.334824  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00660  transposase  44.27 
 
 
426 aa  113  8.999999999999998e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06390  transposase  44.27 
 
 
426 aa  113  8.999999999999998e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5387  transposase, mutator type  45.8 
 
 
438 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.294964  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1439  transposase, mutator type  45.04 
 
 
434 aa  104  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.648976 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5521  transposase, mutator type  45.04 
 
 
469 aa  104  5e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.380612 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5923  transposase, mutator type  45.04 
 
 
469 aa  104  5e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.383294  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2302  transposase mutator type  42.64 
 
 
420 aa  96.7  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.301831  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0873  transposase mutator type  42.64 
 
 
420 aa  96.7  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.709604 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0010  transposase mutator type  42.64 
 
 
420 aa  96.7  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.113874  normal  0.0774421 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1718  transposase mutator type  42.64 
 
 
420 aa  96.7  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1303  transposase mutator type  42.64 
 
 
420 aa  96.7  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.457317 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2013  transposase mutator type  42.64 
 
 
420 aa  96.7  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1890  transposase mutator type  42.64 
 
 
420 aa  96.7  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.475409 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1733  transposase mutator type  42.64 
 
 
420 aa  96.7  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0304536  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1250  transposase mutator type  42.64 
 
 
420 aa  96.7  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.804004  normal  0.148761 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1469  transposase mutator type  42.64 
 
 
420 aa  96.7  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000324779 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1261  transposase mutator type  42.64 
 
 
420 aa  96.7  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.657807 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2572  transposase mutator type  42.64 
 
 
420 aa  96.7  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0525687  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1694  transposase mutator type  42.64 
 
 
421 aa  96.3  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000397883  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3061  transposase mutator type  42.64 
 
 
420 aa  96.7  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.359832  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3105  transposase mutator type  42.64 
 
 
420 aa  96.7  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.295612  normal  0.0910349 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3331  hypothetical protein  42.64 
 
 
420 aa  96.7  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.354049  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0119  transposase mutator type  51.9 
 
 
386 aa  91.3  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0187  hypothetical protein  77.55 
 
 
96 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0438  putative transposase  51.61 
 
 
98 aa  65.5  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.506207 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0418  transposase mutator type  31.36 
 
 
398 aa  61.6  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.434631  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2675  transposase mutator type  31.36 
 
 
398 aa  61.6  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1542  transposase mutator type  31.36 
 
 
398 aa  61.6  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0586  transposase, mutator type  32.81 
 
 
478 aa  58.2  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1550  transposase mutator type  32.56 
 
 
407 aa  57.8  0.00000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0508  transposase mutator type  32.31 
 
 
369 aa  57.8  0.00000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3704  transposase, mutator type  31.5 
 
 
404 aa  57  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2884  transposase, mutator type  31.5 
 
 
404 aa  57  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0244  transposase, mutator type  31.5 
 
 
404 aa  57  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2158  transposase, mutator type  31.5 
 
 
404 aa  56.6  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.560206  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0106  transposase, mutator type  31.5 
 
 
393 aa  56.6  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4081  transposase, mutator type  31.5 
 
 
404 aa  56.6  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0108  transposase, mutator type  31.5 
 
 
404 aa  56.6  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2555  transposase, mutator type  31.5 
 
 
404 aa  56.6  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.176663  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3099  transposase, mutator type  31.5 
 
 
404 aa  56.6  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3665  transposase, mutator type  31.5 
 
 
404 aa  56.6  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3703  transposase, mutator type  31.5 
 
 
404 aa  56.6  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3917  transposase, mutator type  31.5 
 
 
404 aa  56.6  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0155  hypothetical protein  29.7 
 
 
408 aa  55.1  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02800  transposase  27.87 
 
 
419 aa  55.1  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02550  transposase  27.87 
 
 
419 aa  55.1  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.184855 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1590  transposase mutator type  27.56 
 
 
462 aa  54.7  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.418194  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0292  putative transposase, mutator type  29.6 
 
 
418 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1626  transposase mutator type  27.56 
 
 
462 aa  54.7  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.187256  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2641  transposase mutator type  27.56 
 
 
462 aa  54.7  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1743  transposase mutator type  27.56 
 
 
462 aa  54.7  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.219665  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2592  transposase mutator type  27.56 
 
 
462 aa  54.7  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2044  transposase mutator type  31.5 
 
 
459 aa  54.3  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0327519  hitchhiker  0.00538259 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>