More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1626 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_2641  transposase mutator type  100 
 
 
462 aa  946    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3556  transposase mutator type  71 
 
 
455 aa  638    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000326438  hitchhiker  0.00200472 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2656  transposase, mutator type  76.07 
 
 
451 aa  701    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3889  transposase mutator type  71 
 
 
455 aa  638    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00321636  normal  0.0880622 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3425  transposase, mutator type  76.07 
 
 
451 aa  701    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0177952  normal  0.280372 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1626  transposase mutator type  100 
 
 
462 aa  946    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.187256  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1743  transposase mutator type  100 
 
 
462 aa  946    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.219665  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2592  transposase mutator type  99.78 
 
 
462 aa  944    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3735  transposase mutator type  71 
 
 
455 aa  638    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0636761  normal  0.116734 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1590  transposase mutator type  100 
 
 
462 aa  946    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.418194  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10430  transposase, mutator family  70.25 
 
 
447 aa  631  1e-180  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0190487  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18450  transposase, mutator family  70.23 
 
 
447 aa  632  1e-180  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.667016  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16070  transposase, mutator family  70 
 
 
447 aa  631  1e-180  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14000  transposase, mutator family  70.25 
 
 
447 aa  630  1e-179  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06470  transposase, mutator family  70.02 
 
 
447 aa  630  1e-179  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.239932  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2044  transposase mutator type  68.04 
 
 
459 aa  614  9.999999999999999e-175  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0327519  hitchhiker  0.00538259 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2050  transposase mutator type  67.81 
 
 
459 aa  612  9.999999999999999e-175  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0245972  decreased coverage  0.002439 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3629  transposase mutator type  67.5 
 
 
462 aa  610  1e-173  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00281606  decreased coverage  0.00170148 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24220  transposase  68.25 
 
 
449 aa  609  1e-173  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.23622  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1455  transposase mutator type  67.5 
 
 
462 aa  610  1e-173  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.451123  normal  0.366718 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4943  transposase mutator type  67.5 
 
 
462 aa  610  1e-173  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14440  transposase  68.25 
 
 
449 aa  609  1e-173  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.269037  normal  0.131884 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0426  transposase mutator type  67.5 
 
 
462 aa  610  1e-173  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22340  transposase  68.25 
 
 
449 aa  609  1e-173  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.17718  normal  0.556688 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18020  transposase  68.25 
 
 
449 aa  610  1e-173  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000163557  normal  0.244286 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3472  transposase mutator type  67.5 
 
 
462 aa  610  1e-173  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00565212  hitchhiker  0.00216931 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20190  transposase  68.25 
 
 
449 aa  609  1e-173  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.792875  normal  0.0322803 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5974  transposase, mutator type  52.1 
 
 
424 aa  421  1e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.713861  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6124  transposase mutator type  45.03 
 
 
426 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6788  transposase mutator type  45.03 
 
 
426 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.1599  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4451  transposase mutator type  45.56 
 
 
416 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3187  transposase mutator type  45.03 
 
 
426 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361508  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3172  transposase mutator type  46.52 
 
 
416 aa  383  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1812  transposase mutator type  45.56 
 
 
416 aa  384  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.39638 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0255  transposase mutator type  46.52 
 
 
416 aa  383  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.531318 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0007  transposase mutator type  46.76 
 
 
416 aa  385  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3142  transposase mutator type  46.52 
 
 
416 aa  383  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.394881  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0158  transposase  47.13 
 
 
419 aa  382  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.590957  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0568  transposase  47.13 
 
 
419 aa  382  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0638  transposase  47.13 
 
 
419 aa  382  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2200  transposase  47.13 
 
 
419 aa  382  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0089  transposase mutator type  46.52 
 
 
416 aa  383  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0720  transposase mutator type  46.52 
 
 
416 aa  383  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.216231  normal  0.208766 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1272  transposase mutator type  46.52 
 
 
416 aa  383  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.437771 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5785  transposase mutator type  45.56 
 
 
416 aa  384  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.544377  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0027  ISMca5, transposase  45.67 
 
 
411 aa  381  1e-104  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0677305  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1219  ISMca5, transposase  45.67 
 
 
411 aa  381  1e-104  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0428861  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0252  ISRSO7-transposase protein  46.04 
 
 
416 aa  379  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.123171  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0478  ISRSO7-transposase protein  46.04 
 
 
416 aa  379  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2905  transposase mutator type  45.58 
 
 
435 aa  379  1e-104  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.482411  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2914  transposase mutator type  47.95 
 
 
415 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1179  transposase, mutator type  45.09 
 
 
416 aa  378  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0480  transposase, mutator type  45.32 
 
 
416 aa  381  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.690571  normal  0.698094 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1262  transposase, mutator type  45.32 
 
 
416 aa  381  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.050865  normal  0.0250992 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1503  transposase, mutator type  45.32 
 
 
416 aa  381  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00430758  normal  0.0104636 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2268  transposase, mutator type  45.32 
 
 
416 aa  381  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.1465  normal  0.242714 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0700  transposase, mutator type  45.09 
 
 
416 aa  378  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.531735  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4611  transposase, mutator type  45.09 
 
 
416 aa  378  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3752  transposase, mutator type  45.09 
 
 
416 aa  378  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.223248 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1574  transposase mutator type  44.08 
 
 
425 aa  377  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3417  transposase mutator type  44.08 
 
 
425 aa  378  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257312  normal  0.128425 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4528  transposase mutator family protein  45.58 
 
 
416 aa  376  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.407435  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0106  transposase, mutator type  47.52 
 
 
393 aa  377  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0782  transposase mutator type  44.08 
 
 
425 aa  377  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622618  normal  0.382155 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3138  transposase mutator family protein  45.75 
 
 
422 aa  377  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.66274  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2859  transposase mutator type  44.08 
 
 
425 aa  376  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622618  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2305  transposase mutator type  44.08 
 
 
425 aa  375  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.524508  normal  0.505688 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0244  transposase, mutator type  43.29 
 
 
404 aa  374  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4081  transposase, mutator type  43.53 
 
 
404 aa  375  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2158  transposase, mutator type  43.53 
 
 
404 aa  375  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.560206  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3703  transposase, mutator type  43.53 
 
 
404 aa  375  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3099  transposase, mutator type  43.53 
 
 
404 aa  375  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0108  transposase, mutator type  43.53 
 
 
404 aa  375  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3917  transposase, mutator type  43.53 
 
 
404 aa  375  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3704  transposase, mutator type  43.29 
 
 
404 aa  374  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2884  transposase, mutator type  43.29 
 
 
404 aa  374  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3665  transposase, mutator type  43.53 
 
 
404 aa  375  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2555  transposase, mutator type  43.53 
 
 
404 aa  375  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.176663  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0271  transposase mutator family protein  45.52 
 
 
422 aa  374  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1082  transposase mutator family protein  45.52 
 
 
422 aa  374  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0319318  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1528  transposase mutator family protein  45.52 
 
 
422 aa  372  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.163505  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3315  transposase mutator type  45.08 
 
 
415 aa  375  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2121  transposase mutator type  46.08 
 
 
408 aa  369  1e-101  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.630372  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1787  transposase mutator type  46.54 
 
 
419 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.452427 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4726  transposase mutator type  46.54 
 
 
419 aa  370  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.685507  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5562  transposase, mutator type  46.54 
 
 
419 aa  371  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4807  transposase mutator type  46.3 
 
 
419 aa  369  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.370083  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5742  transposase mutator type  46.3 
 
 
419 aa  369  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.807876 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3772  transposase mutator type  46.54 
 
 
419 aa  371  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0597281 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4789  transposase mutator type  46.3 
 
 
419 aa  369  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0358  transposase mutator family protein  46.78 
 
 
419 aa  370  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2748  transposase mutator family protein  46.78 
 
 
419 aa  370  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.505573  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2892  transposase mutator family protein  45.29 
 
 
422 aa  371  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3131  transposase mutator family protein  46.78 
 
 
419 aa  370  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3244  transposase mutator family protein  45.29 
 
 
422 aa  371  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.625679  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1683  transposase, mutator type  46.54 
 
 
419 aa  371  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0398  transposase, mutator type  46.54 
 
 
419 aa  371  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1201  transposase, mutator type  46.54 
 
 
419 aa  371  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1204  transposase, mutator type  46.54 
 
 
419 aa  371  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5297  transposase, mutator type  46.54 
 
 
419 aa  371  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>