More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSp0478 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0027  ISMca5, transposase  81.22 
 
 		 411 aa  684    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0677305  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1219  ISMca5, transposase  81.22 
 
 		 411 aa  684    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0428861  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0252  ISRSO7-transposase protein  100 
 
 		 416 aa  850    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.123171  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0478  ISRSO7-transposase protein  100 
 
 		 416 aa  850    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0720  transposase mutator type  95.91 
 
 		 416 aa  793    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.216231  normal  0.208766 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3172  transposase mutator type  95.91 
 
 		 416 aa  793    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5785  transposase mutator type  92.07 
 
 		 416 aa  787    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.544377  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1272  transposase mutator type  95.91 
 
 		 416 aa  793    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.437771 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1812  transposase mutator type  92.07 
 
 		 416 aa  787    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.39638 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3752  transposase, mutator type  91.83 
 
 		 416 aa  775    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.223248 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0007  transposase mutator type  95.91 
 
 		 416 aa  795    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3315  transposase mutator type  78.35 
 
 		 415 aa  681    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4451  transposase mutator type  92.79 
 
 		 416 aa  793    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0158  transposase  75.54 
 
 		 419 aa  667    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.590957  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0568  transposase  75.54 
 
 		 419 aa  667    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0638  transposase  75.54 
 
 		 419 aa  667    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2200  transposase  75.54 
 
 		 419 aa  667    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1179  transposase, mutator type  91.83 
 
 		 416 aa  775    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0255  transposase mutator type  95.91 
 
 		 416 aa  793    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.531318 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3142  transposase mutator type  95.91 
 
 		 416 aa  793    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.394881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4528  transposase mutator family protein  87.02 
 
 		 416 aa  733    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.407435  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0089  transposase mutator type  95.91 
 
 		 416 aa  793    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0480  transposase, mutator type  90.14 
 
 		 416 aa  759    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.690571  normal  0.698094 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1262  transposase, mutator type  90.14 
 
 		 416 aa  759    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.050865  normal  0.0250992 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1503  transposase, mutator type  90.14 
 
 		 416 aa  759    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00430758  normal  0.0104636 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2268  transposase, mutator type  90.14 
 
 		 416 aa  759    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.1465  normal  0.242714 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0700  transposase, mutator type  91.83 
 
 		 416 aa  775    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.531735  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4611  transposase, mutator type  91.83 
 
 		 416 aa  775    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3187  transposase mutator type  69.9 
 
 		 426 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6124  transposase mutator type  69.9 
 
 		 426 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6788  transposase mutator type  69.9 
 
 		 426 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.1599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0149  transposase InsF  75.79 
 
 		 411 aa  607  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2914  transposase mutator type  68.97 
 
 		 415 aa  587  1e-166  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1574  transposase mutator type  67.25 
 
 		 425 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0782  transposase mutator type  67.25 
 
 		 425 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622618  normal  0.382155 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3417  transposase mutator type  67.33 
 
 		 425 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257312  normal  0.128425 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2305  transposase mutator type  66.75 
 
 		 425 aa  578  1e-164  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.524508  normal  0.505688 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2859  transposase mutator type  67.25 
 
 		 425 aa  581  1e-164  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3772  transposase mutator type  65.3 
 
 		 419 aa  555  1e-157  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0597281 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5562  transposase, mutator type  65.3 
 
 		 419 aa  555  1e-157  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1683  transposase, mutator type  65.3 
 
 		 419 aa  555  1e-157  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0398  transposase, mutator type  65.3 
 
 		 419 aa  555  1e-157  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1201  transposase, mutator type  65.3 
 
 		 419 aa  555  1e-157  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1204  transposase, mutator type  65.3 
 
 		 419 aa  555  1e-157  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5297  transposase, mutator type  65.3 
 
 		 419 aa  555  1e-157  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4726  transposase mutator type  65.06 
 
 		 419 aa  552  1e-156  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.685507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0356  transposase mutator type  65.06 
 
 		 419 aa  553  1e-156  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2936  transposase mutator type  65.06 
 
 		 419 aa  553  1e-156  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1793  transposase mutator type  65.06 
 
 		 419 aa  551  1e-156  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.217248 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0358  transposase mutator family protein  65.06 
 
 		 419 aa  554  1e-156  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0431  transposase mutator family protein  65.06 
 
 		 419 aa  554  1e-156  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.72525  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0926  transposase mutator family protein  65.06 
 
 		 419 aa  554  1e-156  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1103  transposase mutator family protein  65.06 
 
 		 419 aa  554  1e-156  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.109528  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2748  transposase mutator family protein  65.06 
 
 		 419 aa  554  1e-156  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.505573  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3131  transposase mutator family protein  65.06 
 
 		 419 aa  554  1e-156  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1787  transposase mutator type  65.3 
 
 		 419 aa  553  1e-156  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.452427 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4789  transposase mutator type  64.58 
 
 		 419 aa  549  1e-155  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4807  transposase mutator type  64.59 
 
 		 419 aa  550  1e-155  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.370083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5742  transposase mutator type  64.58 
 
 		 419 aa  549  1e-155  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.807876 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0909  transposase mutator type  64.34 
 
 		 419 aa  547  1e-154  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.042433 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1082  transposase mutator family protein  58.96 
 
 		 422 aa  486  1e-136  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0319318  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3244  transposase mutator family protein  58.71 
 
 		 422 aa  484  1e-136  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.625679  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5112  transposase, mutator type  56.58 
 
 		 407 aa  481  1e-135  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.540626  normal  0.120028 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0271  transposase mutator family protein  58.71 
 
 		 422 aa  484  1e-135  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2348  transposase mutator family protein  58.46 
 
 		 422 aa  482  1e-135  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2892  transposase mutator family protein  58.71 
 
 		 422 aa  483  1e-135  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3138  transposase mutator family protein  58.71 
 
 		 422 aa  483  1e-135  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.66274  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1528  transposase mutator family protein  58.46 
 
 		 422 aa  479  1e-134  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.163505  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8282  transposase for insertion sequence element isrm3  57.36 
 
 		 406 aa  476  1e-133  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0110  transposase, mutator type  56.08 
 
 		 407 aa  471  1e-132  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.335509  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3015  transposase, mutator type  56.08 
 
 		 407 aa  471  1e-132  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0505  transposase  63.22 
 
 		 639 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.804069  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6034  transposase mutator type  56 
 
 		 400 aa  465  9.999999999999999e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0363265  normal  0.408755 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3247  transposase, mutator type  56.82 
 
 		 407 aa  464  1e-129  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.203349  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3615  transposase, mutator type  56.82 
 
 		 407 aa  463  1e-129  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0805  transposase, mutator type  56.82 
 
 		 407 aa  463  1e-129  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0287  transposase, mutator type  56.82 
 
 		 407 aa  461  9.999999999999999e-129  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.286188  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0776  transposase, mutator type  56.82 
 
 		 407 aa  461  9.999999999999999e-129  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3212  transposase, mutator type  57.07 
 
 		 407 aa  460  9.999999999999999e-129  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.49013  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3387  transposase, mutator type  56.33 
 
 		 407 aa  454  1e-127  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6594  transposase mutator type  72.26 
 
 		 295 aa  454  1e-127  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.771123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3613  transposase, mutator type  57.6 
 
 		 375 aa  452  1.0000000000000001e-126  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.230884  normal  0.701856 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5439  transposase mutator type  55.45 
 
 		 406 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2433  transposase mutator type  55.67 
 
 		 408 aa  442  1e-123  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.226553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3099  transposase, mutator type  53.97 
 
 		 404 aa  437  1e-121  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0244  transposase, mutator type  53.44 
 
 		 404 aa  436  1e-121  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3336  transposase mutator type  53.25 
 
 		 408 aa  435  1e-121  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3703  transposase, mutator type  53.97 
 
 		 404 aa  437  1e-121  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2884  transposase, mutator type  53.44 
 
 		 404 aa  436  1e-121  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3917  transposase, mutator type  53.97 
 
 		 404 aa  437  1e-121  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3704  transposase, mutator type  53.44 
 
 		 404 aa  436  1e-121  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4081  transposase, mutator type  53.97 
 
 		 404 aa  437  1e-121  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2663  transposase, mutator type  53.25 
 
 		 408 aa  435  1e-121  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.279268 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1107  transposase, mutator type  53.25 
 
 		 408 aa  435  1e-121  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.931145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3782  transposase, mutator type  53.25 
 
 		 408 aa  435  1e-121  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2158  transposase, mutator type  53.97 
 
 		 404 aa  437  1e-121  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.560206  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0108  transposase, mutator type  53.97 
 
 		 404 aa  437  1e-121  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3665  transposase, mutator type  53.97 
 
 		 404 aa  437  1e-121  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2555  transposase, mutator type  53.97 
 
 		 404 aa  437  1e-121  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.176663  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3165  transposase mutator type  53.25 
 
 		 408 aa  435  1e-121  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>