More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0586 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_0586  transposase, mutator type  100 
 
 
478 aa  974    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1651  transposase mutator type  92.03 
 
 
429 aa  712    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.511407  normal  0.0343529 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4522  transposase, mutator type  52.91 
 
 
430 aa  427  1e-118  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0698256  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3667  transposase mutator type  55.83 
 
 
427 aa  423  1e-117  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0491111  normal  0.134883 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3465  transposase mutator type  55.62 
 
 
425 aa  414  1e-114  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000204255  normal  0.0284562 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10938  transposase  53.05 
 
 
439 aa  384  1e-105  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0323  transposase mutator type  49.38 
 
 
428 aa  375  1e-103  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4268  transposase mutator type  49.38 
 
 
428 aa  375  1e-103  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2471  transposase mutator type  49.38 
 
 
428 aa  375  1e-103  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4287  transposase mutator type  49.38 
 
 
428 aa  375  1e-103  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4284  transposase mutator type  49.74 
 
 
428 aa  367  1e-100  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2044  transposase mutator type  48.74 
 
 
459 aa  343  4e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0327519  hitchhiker  0.00538259 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2050  transposase mutator type  48.46 
 
 
459 aa  342  1e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0245972  decreased coverage  0.002439 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1455  transposase mutator type  48.18 
 
 
462 aa  342  1e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.451123  normal  0.366718 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4943  transposase mutator type  48.18 
 
 
462 aa  342  1e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3472  transposase mutator type  48.18 
 
 
462 aa  342  1e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00565212  hitchhiker  0.00216931 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3629  transposase mutator type  48.18 
 
 
462 aa  342  1e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00281606  decreased coverage  0.00170148 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0426  transposase mutator type  48.18 
 
 
462 aa  342  1e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5974  transposase, mutator type  49.57 
 
 
424 aa  336  5e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.713861  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10430  transposase, mutator family  44.54 
 
 
447 aa  320  1.9999999999999998e-86  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0190487  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14000  transposase, mutator family  44.54 
 
 
447 aa  320  3e-86  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06470  transposase, mutator family  44.26 
 
 
447 aa  320  3.9999999999999996e-86  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.239932  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18450  transposase, mutator family  44.54 
 
 
447 aa  320  3.9999999999999996e-86  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.667016  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16070  transposase, mutator family  44.26 
 
 
447 aa  319  5e-86  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1107  transposase, mutator type  45.19 
 
 
408 aa  319  7e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.931145  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3782  transposase, mutator type  45.19 
 
 
408 aa  319  7e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2663  transposase, mutator type  45.19 
 
 
408 aa  319  7.999999999999999e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.279268 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3165  transposase mutator type  45.19 
 
 
408 aa  319  7.999999999999999e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3336  transposase mutator type  45.19 
 
 
408 aa  319  7.999999999999999e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3661  transposase mutator type  44.94 
 
 
432 aa  318  1e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.356207  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2121  transposase mutator type  44.9 
 
 
408 aa  317  2e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.630372  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0914  transposase, mutator type  45.19 
 
 
408 aa  318  2e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.251188  normal  0.127076 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5112  transposase, mutator type  45.91 
 
 
407 aa  313  5.999999999999999e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.540626  normal  0.120028 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6038  transposase mutator family protein  44.61 
 
 
408 aa  312  7.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3066  transposase mutator family protein  44.61 
 
 
408 aa  312  7.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0708  transposase mutator family protein  42.11 
 
 
403 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1590  transposase mutator type  41.21 
 
 
462 aa  306  6e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.418194  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0534  transposase mutator family protein  40.5 
 
 
402 aa  306  6e-82  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1626  transposase mutator type  41.21 
 
 
462 aa  306  6e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.187256  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1743  transposase mutator type  41.21 
 
 
462 aa  306  6e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.219665  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2641  transposase mutator type  41.21 
 
 
462 aa  306  6e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2656  transposase, mutator type  43.97 
 
 
451 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3425  transposase, mutator type  43.97 
 
 
451 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0177952  normal  0.280372 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0005  IS1414, transposase  44.55 
 
 
402 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0682409  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0110  transposase, mutator type  45.91 
 
 
407 aa  305  2.0000000000000002e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.335509  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2592  transposase mutator type  40.94 
 
 
462 aa  305  2.0000000000000002e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3015  transposase, mutator type  45.91 
 
 
407 aa  305  2.0000000000000002e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0885  transposase mutator family protein  40.5 
 
 
404 aa  303  3.0000000000000004e-81  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.767788  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1983  transposase mutator family protein  40.5 
 
 
404 aa  303  3.0000000000000004e-81  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.365641 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18020  transposase  44.09 
 
 
449 aa  303  4.0000000000000003e-81  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000163557  normal  0.244286 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20190  transposase  44.09 
 
 
449 aa  302  7.000000000000001e-81  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.792875  normal  0.0322803 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22340  transposase  44.09 
 
 
449 aa  302  7.000000000000001e-81  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.17718  normal  0.556688 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24220  transposase  44.09 
 
 
449 aa  302  7.000000000000001e-81  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.23622  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14440  transposase  44.09 
 
 
449 aa  302  7.000000000000001e-81  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.269037  normal  0.131884 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3099  transposase, mutator type  42.44 
 
 
404 aa  301  1e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4081  transposase, mutator type  42.44 
 
 
404 aa  301  1e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0106  transposase, mutator type  42.44 
 
 
393 aa  302  1e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3703  transposase, mutator type  42.44 
 
 
404 aa  301  1e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3917  transposase, mutator type  42.44 
 
 
404 aa  301  1e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2158  transposase, mutator type  42.44 
 
 
404 aa  301  1e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.560206  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0108  transposase, mutator type  42.44 
 
 
404 aa  301  1e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3665  transposase, mutator type  42.44 
 
 
404 aa  301  1e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2555  transposase, mutator type  42.44 
 
 
404 aa  301  1e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.176663  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2007  transposase mutator type  42.86 
 
 
402 aa  300  3e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.715039  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0238  transposase mutator type  42.86 
 
 
402 aa  300  3e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1493  transposase mutator type  42.86 
 
 
402 aa  300  3e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3615  transposase, mutator type  44.74 
 
 
407 aa  300  3e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2356  transposase mutator type  42.86 
 
 
402 aa  300  3e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3247  transposase, mutator type  44.74 
 
 
407 aa  300  3e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.203349  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3735  transposase mutator type  43.82 
 
 
455 aa  298  1e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0636761  normal  0.116734 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3556  transposase mutator type  43.82 
 
 
455 aa  298  1e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000326438  hitchhiker  0.00200472 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3889  transposase mutator type  43.82 
 
 
455 aa  298  1e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00321636  normal  0.0880622 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2905  transposase mutator type  44.48 
 
 
435 aa  298  1e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.482411  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0244  transposase, mutator type  42.15 
 
 
404 aa  297  2e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2884  transposase, mutator type  42.15 
 
 
404 aa  297  2e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3704  transposase, mutator type  42.15 
 
 
404 aa  297  2e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3613  transposase, mutator type  44.54 
 
 
375 aa  298  2e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.230884  normal  0.701856 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0805  transposase, mutator type  44.44 
 
 
407 aa  298  2e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0287  transposase, mutator type  44.44 
 
 
407 aa  296  5e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.286188  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5439  transposase mutator type  44.19 
 
 
406 aa  295  8e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0776  transposase, mutator type  44.15 
 
 
407 aa  295  1e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4451  transposase mutator type  43.03 
 
 
416 aa  295  2e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1936  IS285 transposase  41.54 
 
 
402 aa  294  3e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.912598  normal  0.504152 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6788  transposase mutator type  43.11 
 
 
426 aa  294  3e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.1599  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5785  transposase mutator type  43.62 
 
 
416 aa  294  3e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.544377  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2822  IS285 transposase  41.54 
 
 
402 aa  294  3e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0900869 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1925  IS285 transposase  41.54 
 
 
402 aa  294  3e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.124366  normal  0.380546 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1812  transposase mutator type  43.62 
 
 
416 aa  294  3e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.39638 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6124  transposase mutator type  43.11 
 
 
426 aa  294  3e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3417  transposase mutator type  42.94 
 
 
425 aa  293  3e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257312  normal  0.128425 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0563  IS285 transposase  41.54 
 
 
402 aa  294  3e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2692  IS285 transposase  41.54 
 
 
402 aa  294  3e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0200567  normal  0.0604339 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0404  IS285 transposase  41.54 
 
 
402 aa  294  3e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0078485 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0610  IS285 transposase  41.54 
 
 
402 aa  294  3e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0069093  normal  0.361449 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2169  IS285 transposase  41.54 
 
 
402 aa  294  3e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0142554 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0878  IS285 transposase  41.54 
 
 
402 aa  294  3e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.601324  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2146  IS285 transposase  41.54 
 
 
402 aa  294  3e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0965299  normal  0.0604339 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2188  IS285 transposase  41.54 
 
 
402 aa  294  3e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.49748 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1244  IS285 transposase  41.54 
 
 
402 aa  294  3e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000250762  hitchhiker  0.0000000000571449 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1704  IS285 transposase  41.54 
 
 
402 aa  294  3e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0510914  hitchhiker  0.000569964 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>