More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A0404 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A0184  IS285 transposase  100 
 
 
402 aa  836    Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000394328  hitchhiker  0.000122824 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3088  IS285 transposase  99.75 
 
 
402 aa  835    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0113  IS256 family transposase  100 
 
 
402 aa  836    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  7.859819999999999e-35  hitchhiker  3.4908100000000004e-107 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0899  IS285 transposase  100 
 
 
402 aa  836    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0200567  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0404  IS285 transposase  100 
 
 
402 aa  836    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0078485 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4201  transposase mutator type  99.75 
 
 
402 aa  833    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.102983  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1806  transposase mutator type  99.75 
 
 
402 aa  833    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.337522  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1493  transposase mutator type  91.29 
 
 
402 aa  772    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0209  IS285 transposase  100 
 
 
402 aa  836    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.976414 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1925  IS285 transposase  100 
 
 
402 aa  836    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.124366  normal  0.380546 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1244  IS285 transposase  100 
 
 
402 aa  836    Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000250762  hitchhiker  0.0000000000571449 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0144  IS285 transposase  100 
 
 
402 aa  836    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.278135  hitchhiker  0.0000241688 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2690  IS285 transposase  100 
 
 
402 aa  836    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.1618  normal  0.0882844 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2585  IS285 transposase  99.75 
 
 
402 aa  835    Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000265507  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2868  IS285 transposase  100 
 
 
402 aa  836    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4091  IS285 transposase  100 
 
 
402 aa  836    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0015  IS285, transposase  99.75 
 
 
402 aa  833    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000501092  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0610  IS285 transposase  100 
 
 
402 aa  836    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0069093  normal  0.361449 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0017  IS285 transposase  100 
 
 
402 aa  836    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0178633  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0563  IS285 transposase  100 
 
 
402 aa  836    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0878  IS285 transposase  100 
 
 
402 aa  836    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.601324  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2169  IS285 transposase  100 
 
 
402 aa  836    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0142554 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1936  IS285 transposase  100 
 
 
402 aa  836    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.912598  normal  0.504152 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2370  IS285 transposase  100 
 
 
402 aa  836    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.284063 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2692  IS285 transposase  100 
 
 
402 aa  836    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0200567  normal  0.0604339 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2640  IS285 transposase  100 
 
 
402 aa  836    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.989951  normal  0.230148 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2337  IS285 transposase  100 
 
 
402 aa  836    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000509727  normal  0.0644428 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0005  IS1414, transposase  75.62 
 
 
402 aa  653    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0682409  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0427  transposase mutator type  100 
 
 
402 aa  836    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00329499  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3068  transposase mutator type  99.75 
 
 
402 aa  833    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0291  IS285, transposase  99.75 
 
 
402 aa  833    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0178576  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0400  IS285 transposase  100 
 
 
402 aa  836    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.104694 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2007  transposase mutator type  91.29 
 
 
402 aa  772    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.715039  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1704  IS285 transposase  100 
 
 
402 aa  836    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0510914  hitchhiker  0.000569964 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2146  IS285 transposase  100 
 
 
402 aa  836    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0965299  normal  0.0604339 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2356  transposase mutator type  91.29 
 
 
402 aa  772    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2822  IS285 transposase  100 
 
 
402 aa  836    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0900869 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2188  IS285 transposase  100 
 
 
402 aa  836    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.49748 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2551  IS285 transposase  100 
 
 
402 aa  836    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.554053  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2328  IS285 transposase  100 
 
 
402 aa  836    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0755498  normal  0.441869 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1891  IS285 transposase  100 
 
 
402 aa  836    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.940968  hitchhiker  0.000645661 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2902  IS285 transposase  100 
 
 
402 aa  836    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000738457  normal  0.356669 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0238  transposase mutator type  91.29 
 
 
402 aa  772    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3508  IS285 transposase  100 
 
 
402 aa  836    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0195612  normal  0.0648986 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3007  IS285 transposase  100 
 
 
402 aa  836    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000643247  hitchhiker  0.00100345 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4124  IS285 transposase  100 
 
 
402 aa  836    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.410453  normal  0.412793 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2292  transposase mutator type  96.49 
 
 
286 aa  573  1.0000000000000001e-162  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0121086  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0885  transposase mutator family protein  57.5 
 
 
404 aa  508  1e-143  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.767788  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1983  transposase mutator family protein  57.5 
 
 
404 aa  508  1e-143  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.365641 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0534  transposase mutator family protein  57.83 
 
 
402 aa  502  1e-141  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3704  transposase, mutator type  56.2 
 
 
404 aa  474  1e-132  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0244  transposase, mutator type  56.2 
 
 
404 aa  474  1e-132  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2884  transposase, mutator type  56.2 
 
 
404 aa  474  1e-132  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3703  transposase, mutator type  55.95 
 
 
404 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0108  transposase, mutator type  55.95 
 
 
404 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4081  transposase, mutator type  55.95 
 
 
404 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3099  transposase, mutator type  55.95 
 
 
404 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2158  transposase, mutator type  55.95 
 
 
404 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.560206  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2555  transposase, mutator type  55.95 
 
 
404 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.176663  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3917  transposase, mutator type  55.95 
 
 
404 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3665  transposase, mutator type  55.95 
 
 
404 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1107  transposase, mutator type  56.68 
 
 
408 aa  461  1e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.931145  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0914  transposase, mutator type  56.68 
 
 
408 aa  462  1e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.251188  normal  0.127076 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3336  transposase mutator type  56.68 
 
 
408 aa  463  1e-129  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0708  transposase mutator family protein  55.61 
 
 
403 aa  462  1e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2663  transposase, mutator type  56.68 
 
 
408 aa  463  1e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.279268 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2121  transposase mutator type  56.42 
 
 
408 aa  461  1e-129  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.630372  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3165  transposase mutator type  56.68 
 
 
408 aa  463  1e-129  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3782  transposase, mutator type  56.68 
 
 
408 aa  461  1e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2222  transposase, Mutator family  78.31 
 
 
289 aa  463  1e-129  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00694083  hitchhiker  0.0000000000000060867 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6038  transposase mutator family protein  57.64 
 
 
408 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3066  transposase mutator family protein  57.64 
 
 
408 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0106  transposase, mutator type  56.64 
 
 
393 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0155  hypothetical protein  51.39 
 
 
408 aa  437  1e-121  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1218  transposase, mutator type  50.88 
 
 
411 aa  432  1e-120  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2905  transposase mutator type  51.01 
 
 
435 aa  420  1e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.482411  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8282  transposase for insertion sequence element isrm3  50 
 
 
406 aa  403  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4677  transposase mutator type  50.12 
 
 
400 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4398  transposase mutator type  50.12 
 
 
400 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5112  transposase, mutator type  49.19 
 
 
407 aa  400  9.999999999999999e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.540626  normal  0.120028 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1824  transposase, mutator type  48.6 
 
 
403 aa  395  1e-109  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0888  transposase mutator type  46.75 
 
 
401 aa  396  1e-109  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000010764  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1079  transposase mutator type  46.75 
 
 
401 aa  396  1e-109  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.120456  normal  0.0282753 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0782  transposase mutator type  47.36 
 
 
425 aa  393  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622618  normal  0.382155 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1574  transposase mutator type  47.36 
 
 
425 aa  393  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0158  transposase  46.19 
 
 
419 aa  394  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.590957  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0568  transposase  46.19 
 
 
419 aa  394  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0638  transposase  46.19 
 
 
419 aa  394  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2200  transposase  46.19 
 
 
419 aa  394  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0110  transposase, mutator type  48.38 
 
 
407 aa  392  1e-108  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.335509  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3015  transposase, mutator type  48.38 
 
 
407 aa  392  1e-108  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2859  transposase mutator type  47.36 
 
 
425 aa  393  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622618  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3417  transposase mutator type  47.36 
 
 
425 aa  394  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257312  normal  0.128425 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6788  transposase mutator type  45.96 
 
 
426 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.1599  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1812  transposase mutator type  45.14 
 
 
416 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.39638 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3187  transposase mutator type  45.96 
 
 
426 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361508  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5785  transposase mutator type  45.14 
 
 
416 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.544377  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6124  transposase mutator type  45.96 
 
 
426 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0271  transposase mutator family protein  50.13 
 
 
422 aa  391  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2305  transposase mutator type  47.36 
 
 
425 aa  391  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.524508  normal  0.505688 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>