More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_4284 on replicon NC_014159
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014159  Tpau_4287  transposase mutator type  89.95 
 
 
428 aa  787    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0323  transposase mutator type  89.95 
 
 
428 aa  787    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2471  transposase mutator type  89.95 
 
 
428 aa  787    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4268  transposase mutator type  89.95 
 
 
428 aa  787    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4284  transposase mutator type  100 
 
 
428 aa  883    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4522  transposase, mutator type  69.21 
 
 
430 aa  601  1.0000000000000001e-171  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0698256  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3667  transposase mutator type  66.75 
 
 
427 aa  581  1.0000000000000001e-165  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0491111  normal  0.134883 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3465  transposase mutator type  66.51 
 
 
425 aa  567  1e-160  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000204255  normal  0.0284562 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10938  transposase  66.02 
 
 
439 aa  559  1e-158  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1651  transposase mutator type  49.14 
 
 
429 aa  388  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.511407  normal  0.0343529 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5974  transposase, mutator type  49.87 
 
 
424 aa  380  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.713861  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0586  transposase, mutator type  49.74 
 
 
478 aa  365  1e-99  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3661  transposase mutator type  55.96 
 
 
432 aa  358  9.999999999999999e-98  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.356207  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2050  transposase mutator type  45.95 
 
 
459 aa  354  1e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0245972  decreased coverage  0.002439 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3629  transposase mutator type  45.71 
 
 
462 aa  353  4e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00281606  decreased coverage  0.00170148 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0426  transposase mutator type  45.71 
 
 
462 aa  353  4e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4943  transposase mutator type  45.71 
 
 
462 aa  353  4e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3472  transposase mutator type  45.71 
 
 
462 aa  353  4e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00565212  hitchhiker  0.00216931 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1455  transposase mutator type  45.71 
 
 
462 aa  353  4e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.451123  normal  0.366718 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6124  transposase mutator type  46.07 
 
 
426 aa  352  5e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6788  transposase mutator type  46.07 
 
 
426 aa  352  5e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.1599  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3187  transposase mutator type  46.07 
 
 
426 aa  352  5e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361508  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2044  transposase mutator type  45.48 
 
 
459 aa  352  8.999999999999999e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0327519  hitchhiker  0.00538259 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3417  transposase mutator type  44.5 
 
 
425 aa  345  7e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257312  normal  0.128425 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1574  transposase mutator type  44.5 
 
 
425 aa  345  7e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0782  transposase mutator type  44.5 
 
 
425 aa  345  7e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622618  normal  0.382155 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2859  transposase mutator type  44.5 
 
 
425 aa  345  8e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622618  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1107  transposase, mutator type  42.82 
 
 
408 aa  342  5e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.931145  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3782  transposase, mutator type  42.82 
 
 
408 aa  342  5e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2663  transposase, mutator type  42.57 
 
 
408 aa  342  5.999999999999999e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.279268 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3165  transposase mutator type  42.57 
 
 
408 aa  342  5.999999999999999e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3336  transposase mutator type  42.57 
 
 
408 aa  342  5.999999999999999e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2121  transposase mutator type  42.57 
 
 
408 aa  341  1e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.630372  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2305  transposase mutator type  44.24 
 
 
425 aa  341  1e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.524508  normal  0.505688 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0914  transposase, mutator type  42.57 
 
 
408 aa  341  2e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.251188  normal  0.127076 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4451  transposase mutator type  45.65 
 
 
416 aa  338  9e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3703  transposase, mutator type  42.12 
 
 
404 aa  336  3.9999999999999995e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2555  transposase, mutator type  42.12 
 
 
404 aa  336  3.9999999999999995e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.176663  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0108  transposase, mutator type  42.12 
 
 
404 aa  336  3.9999999999999995e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3917  transposase, mutator type  42.12 
 
 
404 aa  336  3.9999999999999995e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3665  transposase, mutator type  42.12 
 
 
404 aa  336  3.9999999999999995e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4081  transposase, mutator type  42.12 
 
 
404 aa  336  3.9999999999999995e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2158  transposase, mutator type  42.12 
 
 
404 aa  336  3.9999999999999995e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.560206  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3099  transposase, mutator type  42.12 
 
 
404 aa  336  3.9999999999999995e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3315  transposase mutator type  44.85 
 
 
415 aa  334  2e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0027  ISMca5, transposase  45.84 
 
 
411 aa  333  3e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0677305  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1219  ISMca5, transposase  45.84 
 
 
411 aa  333  3e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0428861  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6038  transposase mutator family protein  40.8 
 
 
408 aa  333  3e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5112  transposase, mutator type  44.82 
 
 
407 aa  333  3e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.540626  normal  0.120028 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3066  transposase mutator family protein  40.8 
 
 
408 aa  333  3e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0244  transposase, mutator type  41.63 
 
 
404 aa  333  4e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16070  transposase, mutator family  46.36 
 
 
447 aa  333  4e-90  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2884  transposase, mutator type  41.63 
 
 
404 aa  333  4e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3704  transposase, mutator type  41.63 
 
 
404 aa  333  4e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06470  transposase, mutator family  46.36 
 
 
447 aa  333  4e-90  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.239932  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2914  transposase mutator type  45.04 
 
 
415 aa  333  5e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0255  transposase mutator type  45.65 
 
 
416 aa  332  6e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.531318 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0720  transposase mutator type  45.65 
 
 
416 aa  332  6e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.216231  normal  0.208766 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3172  transposase mutator type  45.65 
 
 
416 aa  332  6e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3142  transposase mutator type  45.65 
 
 
416 aa  332  6e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.394881  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10430  transposase, mutator family  46.09 
 
 
447 aa  332  6e-90  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0190487  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1272  transposase mutator type  45.65 
 
 
416 aa  332  6e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.437771 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0089  transposase mutator type  45.65 
 
 
416 aa  332  6e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14000  transposase, mutator family  46.09 
 
 
447 aa  332  6e-90  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18450  transposase, mutator family  46.09 
 
 
447 aa  332  6e-90  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.667016  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0480  transposase, mutator type  45.12 
 
 
416 aa  331  1e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.690571  normal  0.698094 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1262  transposase, mutator type  45.12 
 
 
416 aa  331  1e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.050865  normal  0.0250992 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1503  transposase, mutator type  45.12 
 
 
416 aa  331  1e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00430758  normal  0.0104636 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2268  transposase, mutator type  45.12 
 
 
416 aa  331  1e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.1465  normal  0.242714 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2656  transposase, mutator type  42.54 
 
 
451 aa  330  3e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3425  transposase, mutator type  42.54 
 
 
451 aa  330  3e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0177952  normal  0.280372 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0007  transposase mutator type  45.38 
 
 
416 aa  330  3e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1812  transposase mutator type  44.59 
 
 
416 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.39638 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5785  transposase mutator type  44.59 
 
 
416 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.544377  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18020  transposase  44.15 
 
 
449 aa  329  6e-89  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000163557  normal  0.244286 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8282  transposase for insertion sequence element isrm3  43.53 
 
 
406 aa  329  6e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0252  ISRSO7-transposase protein  45.38 
 
 
416 aa  328  9e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.123171  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0478  ISRSO7-transposase protein  45.38 
 
 
416 aa  328  9e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22340  transposase  44.15 
 
 
449 aa  327  2.0000000000000001e-88  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.17718  normal  0.556688 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20190  transposase  44.15 
 
 
449 aa  327  2.0000000000000001e-88  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.792875  normal  0.0322803 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24220  transposase  44.15 
 
 
449 aa  327  2.0000000000000001e-88  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.23622  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14440  transposase  44.15 
 
 
449 aa  327  2.0000000000000001e-88  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.269037  normal  0.131884 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3556  transposase mutator type  43.92 
 
 
455 aa  327  3e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000326438  hitchhiker  0.00200472 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3735  transposase mutator type  43.92 
 
 
455 aa  327  3e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0636761  normal  0.116734 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3889  transposase mutator type  43.92 
 
 
455 aa  327  3e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00321636  normal  0.0880622 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0005  IS1414, transposase  40.69 
 
 
402 aa  327  3e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0682409  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0708  transposase mutator family protein  40.65 
 
 
403 aa  326  4.0000000000000003e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4528  transposase mutator family protein  44.59 
 
 
416 aa  325  9e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.407435  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0155  hypothetical protein  39.27 
 
 
408 aa  325  1e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0106  transposase, mutator type  42.04 
 
 
393 aa  323  3e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1743  transposase mutator type  42.47 
 
 
462 aa  323  3e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.219665  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1590  transposase mutator type  42.47 
 
 
462 aa  323  3e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.418194  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1626  transposase mutator type  42.47 
 
 
462 aa  323  3e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.187256  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5439  transposase mutator type  44.36 
 
 
406 aa  323  3e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2641  transposase mutator type  42.47 
 
 
462 aa  323  3e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2013  transposase mutator type  39.43 
 
 
407 aa  323  3e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2905  transposase mutator type  41.45 
 
 
435 aa  323  4e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.482411  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2592  transposase mutator type  42.47 
 
 
462 aa  323  5e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0568  transposase  41.86 
 
 
419 aa  322  8e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0638  transposase  41.86 
 
 
419 aa  322  8e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>