More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_4268 on replicon NC_014159
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014159  Tpau_4268  transposase mutator type  100 
 
 		 428 aa  882    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4287  transposase mutator type  100 
 
 		 428 aa  882    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4284  transposase mutator type  89.95 
 
 		 428 aa  794    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2471  transposase mutator type  100 
 
 		 428 aa  882    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0323  transposase mutator type  100 
 
 		 428 aa  882    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4522  transposase, mutator type  67.32 
 
 		 430 aa  592  1e-168  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0698256  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3667  transposase mutator type  66.12 
 
 		 427 aa  579  1e-164  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0491111  normal  0.134883 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3465  transposase mutator type  65.33 
 
 		 425 aa  568  1e-161  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000204255  normal  0.0284562 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10938  transposase  64.89 
 
 		 439 aa  560  1e-158  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1651  transposase mutator type  49.07 
 
 		 429 aa  396  1e-109  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.511407  normal  0.0343529 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5974  transposase, mutator type  49.11 
 
 		 424 aa  382  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.713861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0586  transposase, mutator type  49.38 
 
 		 478 aa  372  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3661  transposase mutator type  56.27 
 
 		 432 aa  367  1e-100  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.356207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3187  transposase mutator type  45.29 
 
 		 426 aa  355  1e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6788  transposase mutator type  45.29 
 
 		 426 aa  355  1e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.1599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2050  transposase mutator type  45.48 
 
 		 459 aa  355  1e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0245972  decreased coverage  0.002439 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6124  transposase mutator type  45.29 
 
 		 426 aa  355  1e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4943  transposase mutator type  45.24 
 
 		 462 aa  354  2e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1455  transposase mutator type  45.24 
 
 		 462 aa  354  2e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.451123  normal  0.366718 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3472  transposase mutator type  45.24 
 
 		 462 aa  354  2e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00565212  hitchhiker  0.00216931 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3629  transposase mutator type  45.24 
 
 		 462 aa  354  2e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00281606  decreased coverage  0.00170148 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0426  transposase mutator type  45.24 
 
 		 462 aa  354  2e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1574  transposase mutator type  43.72 
 
 		 425 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0782  transposase mutator type  43.72 
 
 		 425 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622618  normal  0.382155 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2044  transposase mutator type  45 
 
 		 459 aa  352  5.9999999999999994e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0327519  hitchhiker  0.00538259 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2859  transposase mutator type  43.72 
 
 		 425 aa  352  7e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4451  transposase mutator type  46.7 
 
 		 416 aa  352  8e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3417  transposase mutator type  43.72 
 
 		 425 aa  350  2e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257312  normal  0.128425 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8282  transposase for insertion sequence element isrm3  45.66 
 
 		 406 aa  349  6e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2305  transposase mutator type  43.46 
 
 		 425 aa  348  1e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.524508  normal  0.505688 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5112  transposase, mutator type  45.6 
 
 		 407 aa  347  2e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.540626  normal  0.120028 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0027  ISMca5, transposase  44.5 
 
 		 411 aa  344  2e-93  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0677305  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1219  ISMca5, transposase  44.5 
 
 		 411 aa  344  2e-93  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0428861  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0252  ISRSO7-transposase protein  46.97 
 
 		 416 aa  344  2e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.123171  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0478  ISRSO7-transposase protein  46.97 
 
 		 416 aa  344  2e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0708  transposase mutator family protein  42.79 
 
 		 403 aa  344  2e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3315  transposase mutator type  43.06 
 
 		 415 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1812  transposase mutator type  45.91 
 
 		 416 aa  343  5e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.39638 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5785  transposase mutator type  45.91 
 
 		 416 aa  343  5e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.544377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1107  transposase, mutator type  41.83 
 
 		 408 aa  340  2.9999999999999998e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.931145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3782  transposase, mutator type  41.83 
 
 		 408 aa  340  2.9999999999999998e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3336  transposase mutator type  41.58 
 
 		 408 aa  340  4e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3165  transposase mutator type  41.58 
 
 		 408 aa  340  4e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2663  transposase, mutator type  41.58 
 
 		 408 aa  340  4e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.279268 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2121  transposase mutator type  41.58 
 
 		 408 aa  339  7e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.630372  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5439  transposase mutator type  47.42 
 
 		 406 aa  339  7e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3703  transposase, mutator type  43.15 
 
 		 404 aa  338  9e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2555  transposase, mutator type  43.15 
 
 		 404 aa  338  9e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.176663  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3665  transposase, mutator type  43.15 
 
 		 404 aa  338  9e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0108  transposase, mutator type  43.15 
 
 		 404 aa  338  9e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4081  transposase, mutator type  43.15 
 
 		 404 aa  338  9e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3917  transposase, mutator type  43.15 
 
 		 404 aa  338  9e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0914  transposase, mutator type  41.58 
 
 		 408 aa  338  9e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.251188  normal  0.127076 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2158  transposase, mutator type  43.15 
 
 		 404 aa  338  9e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.560206  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3099  transposase, mutator type  43.15 
 
 		 404 aa  338  9e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4528  transposase mutator family protein  47.23 
 
 		 416 aa  338  9e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.407435  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0110  transposase, mutator type  45.6 
 
 		 407 aa  338  9.999999999999999e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.335509  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3015  transposase, mutator type  45.6 
 
 		 407 aa  338  9.999999999999999e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2914  transposase mutator type  43.04 
 
 		 415 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3172  transposase mutator type  46.7 
 
 		 416 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3142  transposase mutator type  46.7 
 
 		 416 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.394881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2656  transposase, mutator type  43.53 
 
 		 451 aa  337  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1272  transposase mutator type  46.7 
 
 		 416 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.437771 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0089  transposase mutator type  46.7 
 
 		 416 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0255  transposase mutator type  46.7 
 
 		 416 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.531318 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0720  transposase mutator type  46.7 
 
 		 416 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.216231  normal  0.208766 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3425  transposase, mutator type  43.53 
 
 		 451 aa  337  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0177952  normal  0.280372 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0007  transposase mutator type  46.7 
 
 		 416 aa  337  2.9999999999999997e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0480  transposase, mutator type  45.91 
 
 		 416 aa  337  2.9999999999999997e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.690571  normal  0.698094 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1262  transposase, mutator type  45.91 
 
 		 416 aa  337  2.9999999999999997e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.050865  normal  0.0250992 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1503  transposase, mutator type  45.91 
 
 		 416 aa  337  2.9999999999999997e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00430758  normal  0.0104636 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2268  transposase, mutator type  45.91 
 
 		 416 aa  337  2.9999999999999997e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.1465  normal  0.242714 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06470  transposase, mutator family  45.99 
 
 		 447 aa  336  3.9999999999999995e-91  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.239932  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16070  transposase, mutator family  45.99 
 
 		 447 aa  336  3.9999999999999995e-91  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1179  transposase, mutator type  45.91 
 
 		 416 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3752  transposase, mutator type  45.91 
 
 		 416 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.223248 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0700  transposase, mutator type  45.91 
 
 		 416 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.531735  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4611  transposase, mutator type  45.91 
 
 		 416 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10430  transposase, mutator family  45.74 
 
 		 447 aa  336  5e-91  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0190487  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18450  transposase, mutator family  45.74 
 
 		 447 aa  336  5e-91  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.667016  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0244  transposase, mutator type  42.89 
 
 		 404 aa  336  5.999999999999999e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2884  transposase, mutator type  42.89 
 
 		 404 aa  336  5.999999999999999e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3704  transposase, mutator type  42.89 
 
 		 404 aa  336  5.999999999999999e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14000  transposase, mutator family  45.74 
 
 		 447 aa  336  5.999999999999999e-91  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6038  transposase mutator family protein  40.09 
 
 		 408 aa  335  1e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3066  transposase mutator family protein  40.09 
 
 		 408 aa  335  1e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3735  transposase mutator type  44.42 
 
 		 455 aa  334  2e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0636761  normal  0.116734 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3889  transposase mutator type  44.42 
 
 		 455 aa  334  2e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00321636  normal  0.0880622 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3556  transposase mutator type  44.42 
 
 		 455 aa  334  2e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000326438  hitchhiker  0.00200472 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0155  hypothetical protein  39.76 
 
 		 408 aa  330  2e-89  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0534  transposase mutator family protein  41.5 
 
 		 402 aa  329  4e-89  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18020  transposase  44.15 
 
 		 449 aa  329  5.0000000000000004e-89  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000163557  normal  0.244286 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6034  transposase mutator type  42.47 
 
 		 400 aa  328  1.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0363265  normal  0.408755 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14440  transposase  44.15 
 
 		 449 aa  328  1.0000000000000001e-88  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.269037  normal  0.131884 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20190  transposase  44.15 
 
 		 449 aa  328  1.0000000000000001e-88  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.792875  normal  0.0322803 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22340  transposase  44.15 
 
 		 449 aa  328  1.0000000000000001e-88  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.17718  normal  0.556688 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24220  transposase  44.15 
 
 		 449 aa  328  1.0000000000000001e-88  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.23622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3615  transposase, mutator type  45.45 
 
 		 407 aa  328  2.0000000000000001e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0885  transposase mutator family protein  40.75 
 
 		 404 aa  327  2.0000000000000001e-88  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.767788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1983  transposase mutator family protein  40.75 
 
 		 404 aa  327  2.0000000000000001e-88  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.365641 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>