28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_4053 on replicon NC_009430
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009430  Rsph17025_4053  hypothetical protein  100 
 
 		 890 aa  1805    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0957492  normal  0.154927 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0898  hypothetical protein  62 
 
 		 892 aa  1049    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.256823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1963  virulence factor SrfC-like protein  36.43 
 
 		 862 aa  508  9.999999999999999e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1314  virulence factor SrfC-like protein  32.45 
 
 		 878 aa  429  1e-119  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3153  virulence factor protein  33.44 
 
 		 901 aa  375  1e-102  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.490604  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1844  hypothetical protein  31.91 
 
 		 893 aa  363  7.0000000000000005e-99  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52070  hypothetical protein  30.96 
 
 		 910 aa  333  7.000000000000001e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3217  virulence factor SrfC-like protein  31.66 
 
 		 835 aa  313  5.999999999999999e-84  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.933423 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4238  hypothetical protein  29.16 
 
 		 881 aa  285  2.0000000000000002e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0469  Virulence effector, SrfC  28.49 
 
 		 888 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2872  HopL1 protein  27.94 
 
 		 899 aa  283  1e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0638681  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2631  hypothetical protein  33.5 
 
 		 899 aa  281  4e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.631713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6480  hypothetical protein  26.4 
 
 		 938 aa  217  7e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2095  putative virulence factor  31.18 
 
 		 820 aa  197  7e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.180077  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1880  putative virulence factor  29.66 
 
 		 832 aa  183  1e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.332226  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2383  Virulence effector, SrfC  29.64 
 
 		 815 aa  182  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.971346  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2100  putative virulence factor  30.13 
 
 		 844 aa  177  9.999999999999999e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1842  hypothetical protein  29.3 
 
 		 846 aa  166  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2110  putative virulence protein  25.31 
 
 		 726 aa  97.1  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.867276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2282  virulence factor  37.35 
 
 		 185 aa  92.4  3e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1952  putative virulence factor  28.86 
 
 		 679 aa  92  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2284  hypothetical protein  28.46 
 
 		 674 aa  90.1  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.869648 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1433  putative virulence factor  25.44 
 
 		 743 aa  84.3  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1565  putative virulence effector protein  26.64 
 
 		 714 aa  77.8  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1710  putative virulence effector protein  26.64 
 
 		 714 aa  77.8  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1775  putative virulence effector protein  26.64 
 
 		 714 aa  77  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.837936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1713  putative virulence effector protein  26.17 
 
 		 714 aa  77  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.82636 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1746  putative virulence effector protein  26.64 
 
 		 714 aa  77  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.431963  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>