23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3987 on replicon NC_009430
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009430  Rsph17025_3987  hypothetical protein  100 
 
 		 60 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0679301  normal  0.255025 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4113  NapE component of periplasmic nitrate reductase  76.67 
 
 		 60 aa  96.3  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4719  periplasmic nitrate reductase NapE  54.55 
 
 		 59 aa  73.2  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0612346  normal  0.0196306 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0888  periplasmic nitrate reductase NapE  49.15 
 
 		 74 aa  69.3  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5177  periplasmic nitrate reductase NapE  50 
 
 		 61 aa  62  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2941  periplasmic nitrate reductase, NapE protein  63.64 
 
 		 63 aa  60.8  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.732722 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1021  periplasmic nitrate reductase NapE  46.55 
 
 		 59 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2979  periplasmic nitrate reductase NapE  55.56 
 
 		 55 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0578173 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49210  periplasmic nitrate reductase protein NapE  50 
 
 		 55 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.400509  hitchhiker  0.00215401 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4065  putative periplasmic nitrate reductase  48.15 
 
 		 54 aa  50.8  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.023379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1864  putative periplasmic nitrate reductase NapE  51.22 
 
 		 61 aa  50.4  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0950  periplasmic nitrate reductase NapE  51.22 
 
 		 57 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4761  periplasmic nitrate reductase NapE  46.3 
 
 		 55 aa  48.5  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1298  trimethylamine N-oxide reductase system, TorE protein  61.11 
 
 		 72 aa  47.4  0.00006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0082  hypothetical protein  41.07 
 
 		 73 aa  46.6  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003827  periplasmic nitrate reductase component NapE  61.11 
 
 		 59 aa  46.6  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1495  periplasmic nitrate reductase NapE  40.82 
 
 		 70 aa  45.1  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0357609  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2436  periplasmic nitrate reductase, NapE protein  39.62 
 
 		 88 aa  45.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2842  periplasmic nitrate reductase, NapE protein  39.62 
 
 		 88 aa  45.1  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01855  hypothetical protein  58.33 
 
 		 59 aa  44.3  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4202  periplasmic nitrate reductase protein NapE  61.54 
 
 		 55 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.132988  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1060  napE protein  42.86 
 
 		 53 aa  40.8  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2682  periplasmic nitrate reductase NapE  47.62 
 
 		 52 aa  40.4  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>