28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4719 on replicon NC_008688
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008688  Pden_4719  periplasmic nitrate reductase NapE  100 
 
 		 59 aa  120  7e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0612346  normal  0.0196306 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3987  hypothetical protein  54.55 
 
 		 60 aa  73.2  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0679301  normal  0.255025 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4113  NapE component of periplasmic nitrate reductase  56.36 
 
 		 60 aa  70.9  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0888  periplasmic nitrate reductase NapE  52.73 
 
 		 74 aa  69.3  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5177  periplasmic nitrate reductase NapE  55.36 
 
 		 61 aa  68.2  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2941  periplasmic nitrate reductase, NapE protein  47.27 
 
 		 63 aa  59.7  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.732722 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1060  napE protein  52.94 
 
 		 53 aa  59.7  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2979  periplasmic nitrate reductase NapE  48.21 
 
 		 55 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0578173 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1021  periplasmic nitrate reductase NapE  42.86 
 
 		 59 aa  57  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4761  periplasmic nitrate reductase NapE  58.14 
 
 		 55 aa  57  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4065  putative periplasmic nitrate reductase  58.14 
 
 		 54 aa  56.6  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.023379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003827  periplasmic nitrate reductase component NapE  66.67 
 
 		 59 aa  55.5  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0082  hypothetical protein  50 
 
 		 73 aa  55.1  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1298  trimethylamine N-oxide reductase system, TorE protein  64.44 
 
 		 72 aa  54.7  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2436  periplasmic nitrate reductase, NapE protein  53.49 
 
 		 88 aa  54.3  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2842  periplasmic nitrate reductase, NapE protein  53.49 
 
 		 88 aa  54.7  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49210  periplasmic nitrate reductase protein NapE  55.81 
 
 		 55 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.400509  hitchhiker  0.00215401 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01855  hypothetical protein  64.44 
 
 		 59 aa  53.1  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1864  putative periplasmic nitrate reductase NapE  57.5 
 
 		 61 aa  50.1  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0774  putative periplasmic nitrate reductase protein NapE  45.61 
 
 		 58 aa  50.4  0.000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.91317  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1495  periplasmic nitrate reductase NapE  42.86 
 
 		 70 aa  49.7  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0357609  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0950  periplasmic nitrate reductase NapE  48.94 
 
 		 57 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2682  periplasmic nitrate reductase NapE  42.86 
 
 		 52 aa  47.8  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2555  periplasmic nitrate reductase NapE  42.86 
 
 		 52 aa  47  0.00009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1901  periplasmic nitrate reductase NapE  40.82 
 
 		 52 aa  46.6  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1620  periplasmic nitrate reductase NapE  38.18 
 
 		 61 aa  46.2  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.476073  normal  0.0844581 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4202  periplasmic nitrate reductase protein NapE  70.83 
 
 		 55 aa  41.6  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.132988  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1831  membrane protein TorE  45.45 
 
 		 57 aa  42  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>