36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1298 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1298  trimethylamine N-oxide reductase system, TorE protein  100 
 
 		 72 aa  145  1.0000000000000001e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003827  periplasmic nitrate reductase component NapE  91.38 
 
 		 59 aa  109  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01855  hypothetical protein  89.66 
 
 		 59 aa  107  4.0000000000000004e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0774  putative periplasmic nitrate reductase protein NapE  64.41 
 
 		 58 aa  73.2  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.91317  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2436  periplasmic nitrate reductase, NapE protein  44.44 
 
 		 88 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2842  periplasmic nitrate reductase, NapE protein  44.44 
 
 		 88 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4065  putative periplasmic nitrate reductase  53.06 
 
 		 54 aa  56.6  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.023379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4761  periplasmic nitrate reductase NapE  48.15 
 
 		 55 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49210  periplasmic nitrate reductase protein NapE  49.02 
 
 		 55 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.400509  hitchhiker  0.00215401 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4719  periplasmic nitrate reductase NapE  64.44 
 
 		 59 aa  54.7  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0612346  normal  0.0196306 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2979  periplasmic nitrate reductase NapE  54.17 
 
 		 55 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0578173 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0082  hypothetical protein  59.09 
 
 		 73 aa  53.5  0.0000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4113  NapE component of periplasmic nitrate reductase  50.94 
 
 		 60 aa  53.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1831  membrane protein TorE  46 
 
 		 57 aa  50.8  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5177  periplasmic nitrate reductase NapE  44.83 
 
 		 61 aa  50.1  0.000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1901  periplasmic nitrate reductase NapE  47.92 
 
 		 52 aa  48.5  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2682  periplasmic nitrate reductase NapE  48.94 
 
 		 52 aa  47.8  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3987  hypothetical protein  61.11 
 
 		 60 aa  47.4  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0679301  normal  0.255025 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1060  napE protein  47.17 
 
 		 53 aa  47  0.00009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1620  periplasmic nitrate reductase NapE  48.89 
 
 		 61 aa  47  0.00009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.476073  normal  0.0844581 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2555  periplasmic nitrate reductase NapE  50 
 
 		 52 aa  46.6  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2729  hypothetical protein  43.48 
 
 		 61 aa  46.6  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3524  trimethylamine N-oxide reductase system, TorE protein  43.14 
 
 		 73 aa  46.2  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1864  putative periplasmic nitrate reductase NapE  50 
 
 		 61 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1495  periplasmic nitrate reductase NapE  39.39 
 
 		 70 aa  46.2  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0357609  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0888  periplasmic nitrate reductase NapE  42.59 
 
 		 74 aa  44.7  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2796  periplasmic nitrate reductase NapE  43.59 
 
 		 66 aa  43.5  0.0009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.212441 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2941  periplasmic nitrate reductase, NapE protein  41.18 
 
 		 63 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.732722 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3358  periplasmic nitrate reductase NapE  40 
 
 		 56 aa  42.4  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1053  periplasmic nitrate reductase NapE  45.45 
 
 		 56 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1118  periplasmic nitrate reductase NapE  45.45 
 
 		 56 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.11468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1021  periplasmic nitrate reductase NapE  39.22 
 
 		 59 aa  42.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1234  WARNINIG torE protein  43.18 
 
 		 56 aa  42.4  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1057  periplasmic nitrate reductase NapE  45.45 
 
 		 56 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0950  periplasmic nitrate reductase NapE  40 
 
 		 57 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1156  trimethylamine N-oxide reductase system, TorE protein  42.31 
 
 		 58 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>