19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2941 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2941  periplasmic nitrate reductase, NapE protein  100 
 
 
63 aa  124  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.732722 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5177  periplasmic nitrate reductase NapE  64.15 
 
 
61 aa  74.3  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0888  periplasmic nitrate reductase NapE  51.56 
 
 
74 aa  66.6  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4113  NapE component of periplasmic nitrate reductase  58.18 
 
 
60 aa  63.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3987  hypothetical protein  63.64 
 
 
60 aa  60.8  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0679301  normal  0.255025 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4719  periplasmic nitrate reductase NapE  47.27 
 
 
59 aa  59.7  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0612346  normal  0.0196306 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1021  periplasmic nitrate reductase NapE  50.85 
 
 
59 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0950  periplasmic nitrate reductase NapE  45.65 
 
 
57 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49210  periplasmic nitrate reductase protein NapE  39.22 
 
 
55 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.400509  hitchhiker  0.00215401 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4761  periplasmic nitrate reductase NapE  45.83 
 
 
55 aa  46.2  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4065  putative periplasmic nitrate reductase  44.44 
 
 
54 aa  45.4  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.023379  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1864  putative periplasmic nitrate reductase NapE  45.45 
 
 
61 aa  46.2  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1620  periplasmic nitrate reductase NapE  37.74 
 
 
61 aa  44.3  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.476073  normal  0.0844581 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2979  periplasmic nitrate reductase NapE  35.85 
 
 
55 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0578173 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1298  trimethylamine N-oxide reductase system, TorE protein  41.18 
 
 
72 aa  43.1  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003827  periplasmic nitrate reductase component NapE  41.18 
 
 
59 aa  43.5  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1060  napE protein  45.45 
 
 
53 aa  42  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1495  periplasmic nitrate reductase NapE  35.85 
 
 
70 aa  41.2  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0357609  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01855  hypothetical protein  39.22 
 
 
59 aa  40.8  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>