32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1620 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_1620  periplasmic nitrate reductase NapE  100 
 
 		 61 aa  121  3e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.476073  normal  0.0844581 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1901  periplasmic nitrate reductase NapE  78.43 
 
 		 52 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1495  periplasmic nitrate reductase NapE  71.43 
 
 		 70 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0357609  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2555  periplasmic nitrate reductase NapE  72.55 
 
 		 52 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2682  periplasmic nitrate reductase NapE  70.59 
 
 		 52 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1768  periplasmic nitrate reductase NapE  84.91 
 
 		 52 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1840  periplasmic nitrate reductase NapE  79.25 
 
 		 52 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00661274 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2137  periplasmic nitrate reductase NapE  79.25 
 
 		 52 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000202936 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1898  hypothetical protein  88.89 
 
 		 52 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000221723 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2429  periplasmic nitrate reductase NapE  77.36 
 
 		 52 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0796488  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1060  napE protein  54.72 
 
 		 53 aa  62  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1941  periplasmic nitrate reductase NapE  76.47 
 
 		 52 aa  61.2  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.533787  normal  0.778481 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2385  periplasmic nitrate reductase NapE  76.47 
 
 		 52 aa  60.5  0.000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.420875  normal  0.191476 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1934  periplasmic nitrate reductase NapE  76.47 
 
 		 52 aa  60.5  0.000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.309548  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1908  periplasmic nitrate reductase NapE  76.47 
 
 		 52 aa  60.5  0.000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0774  putative periplasmic nitrate reductase protein NapE  50.88 
 
 		 58 aa  53.5  0.0000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.91317  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0082  hypothetical protein  48.15 
 
 		 73 aa  52.8  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49210  periplasmic nitrate reductase protein NapE  44.23 
 
 		 55 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.400509  hitchhiker  0.00215401 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1021  periplasmic nitrate reductase NapE  46.81 
 
 		 59 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2979  periplasmic nitrate reductase NapE  50 
 
 		 55 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0578173 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4065  putative periplasmic nitrate reductase  44.68 
 
 		 54 aa  48.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.023379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1298  trimethylamine N-oxide reductase system, TorE protein  48.89 
 
 		 72 aa  47  0.00009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2842  periplasmic nitrate reductase, NapE protein  45.24 
 
 		 88 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2436  periplasmic nitrate reductase, NapE protein  44.19 
 
 		 88 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4761  periplasmic nitrate reductase NapE  41.67 
 
 		 55 aa  46.6  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0888  periplasmic nitrate reductase NapE  36.73 
 
 		 74 aa  46.2  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4719  periplasmic nitrate reductase NapE  38.18 
 
 		 59 aa  46.2  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0612346  normal  0.0196306 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003827  periplasmic nitrate reductase component NapE  47.83 
 
 		 59 aa  46.2  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01855  hypothetical protein  47.83 
 
 		 59 aa  44.7  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2941  periplasmic nitrate reductase, NapE protein  37.74 
 
 		 63 aa  44.3  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.732722 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4113  NapE component of periplasmic nitrate reductase  37.29 
 
 		 60 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1864  putative periplasmic nitrate reductase NapE  45 
 
 		 61 aa  41.6  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>