33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1060 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1060  napE protein  100 
 
 		 53 aa  107  5e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1620  periplasmic nitrate reductase NapE  54.72 
 
 		 61 aa  62  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.476073  normal  0.0844581 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2682  periplasmic nitrate reductase NapE  52.94 
 
 		 52 aa  61.2  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1901  periplasmic nitrate reductase NapE  57.78 
 
 		 52 aa  60.1  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4719  periplasmic nitrate reductase NapE  52.94 
 
 		 59 aa  59.7  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0612346  normal  0.0196306 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1495  periplasmic nitrate reductase NapE  54.72 
 
 		 70 aa  59.3  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0357609  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2555  periplasmic nitrate reductase NapE  58.7 
 
 		 52 aa  58.2  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4761  periplasmic nitrate reductase NapE  54.55 
 
 		 55 aa  57.8  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0082  hypothetical protein  45.1 
 
 		 73 aa  57.8  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4065  putative periplasmic nitrate reductase  52.27 
 
 		 54 aa  57  0.00000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.023379  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2436  periplasmic nitrate reductase, NapE protein  52.27 
 
 		 88 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2842  periplasmic nitrate reductase, NapE protein  50 
 
 		 88 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49210  periplasmic nitrate reductase protein NapE  44.23 
 
 		 55 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.400509  hitchhiker  0.00215401 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003827  periplasmic nitrate reductase component NapE  50 
 
 		 59 aa  49.7  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2979  periplasmic nitrate reductase NapE  40.38 
 
 		 55 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0578173 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01855  hypothetical protein  50 
 
 		 59 aa  48.5  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4113  NapE component of periplasmic nitrate reductase  50 
 
 		 60 aa  47.4  0.00006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1768  periplasmic nitrate reductase NapE  56 
 
 		 52 aa  47  0.00008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1298  trimethylamine N-oxide reductase system, TorE protein  47.17 
 
 		 72 aa  47  0.00009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2429  periplasmic nitrate reductase NapE  58 
 
 		 52 aa  46.6  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0796488  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0888  periplasmic nitrate reductase NapE  40 
 
 		 74 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2137  periplasmic nitrate reductase NapE  62.22 
 
 		 52 aa  43.9  0.0008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000202936 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1840  periplasmic nitrate reductase NapE  62.22 
 
 		 52 aa  43.9  0.0008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00661274 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0774  putative periplasmic nitrate reductase protein NapE  47.73 
 
 		 58 aa  43.9  0.0008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.91317  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1898  hypothetical protein  63.64 
 
 		 52 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000221723 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2941  periplasmic nitrate reductase, NapE protein  45.45 
 
 		 63 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.732722 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1934  periplasmic nitrate reductase NapE  56.25 
 
 		 52 aa  41.2  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.309548  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1941  periplasmic nitrate reductase NapE  56.25 
 
 		 52 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.533787  normal  0.778481 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2385  periplasmic nitrate reductase NapE  56.25 
 
 		 52 aa  41.2  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.420875  normal  0.191476 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1908  periplasmic nitrate reductase NapE  56.25 
 
 		 52 aa  41.2  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3987  hypothetical protein  42.86 
 
 		 60 aa  40.8  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0679301  normal  0.255025 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1021  periplasmic nitrate reductase NapE  42.86 
 
 		 59 aa  40.4  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5177  periplasmic nitrate reductase NapE  44.19 
 
 		 61 aa  40.4  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>