19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5177 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5177  periplasmic nitrate reductase NapE  100 
 
 		 61 aa  123  7e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2941  periplasmic nitrate reductase, NapE protein  64.15 
 
 		 63 aa  74.3  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.732722 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4719  periplasmic nitrate reductase NapE  55.36 
 
 		 59 aa  68.2  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0612346  normal  0.0196306 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4113  NapE component of periplasmic nitrate reductase  56.14 
 
 		 60 aa  64.7  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3987  hypothetical protein  50 
 
 		 60 aa  62  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0679301  normal  0.255025 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0888  periplasmic nitrate reductase NapE  54.39 
 
 		 74 aa  62  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1021  periplasmic nitrate reductase NapE  52.54 
 
 		 59 aa  57  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1298  trimethylamine N-oxide reductase system, TorE protein  44.83 
 
 		 72 aa  50.1  0.000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003827  periplasmic nitrate reductase component NapE  46.55 
 
 		 59 aa  50.1  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01855  hypothetical protein  44.83 
 
 		 59 aa  47.4  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0950  periplasmic nitrate reductase NapE  44.64 
 
 		 57 aa  47  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2979  periplasmic nitrate reductase NapE  40.43 
 
 		 55 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0578173 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4761  periplasmic nitrate reductase NapE  43.75 
 
 		 55 aa  45.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49210  periplasmic nitrate reductase protein NapE  47.62 
 
 		 55 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.400509  hitchhiker  0.00215401 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4065  putative periplasmic nitrate reductase  41.18 
 
 		 54 aa  44.3  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.023379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1495  periplasmic nitrate reductase NapE  45.45 
 
 		 70 aa  43.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0357609  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1864  putative periplasmic nitrate reductase NapE  47.5 
 
 		 61 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2729  hypothetical protein  45.76 
 
 		 61 aa  41.2  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1060  napE protein  44.19 
 
 		 53 aa  40.4  0.009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>