17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0950 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0950  periplasmic nitrate reductase NapE  100 
 
 		 57 aa  118  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1864  putative periplasmic nitrate reductase NapE  74.55 
 
 		 61 aa  75.5  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4761  periplasmic nitrate reductase NapE  46.15 
 
 		 55 aa  53.9  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49210  periplasmic nitrate reductase protein NapE  46 
 
 		 55 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.400509  hitchhiker  0.00215401 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2941  periplasmic nitrate reductase, NapE protein  45.65 
 
 		 63 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.732722 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3987  hypothetical protein  51.22 
 
 		 60 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0679301  normal  0.255025 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4065  putative periplasmic nitrate reductase  44.68 
 
 		 54 aa  50.1  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.023379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4719  periplasmic nitrate reductase NapE  48.94 
 
 		 59 aa  49.3  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0612346  normal  0.0196306 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4113  NapE component of periplasmic nitrate reductase  51.22 
 
 		 60 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5177  periplasmic nitrate reductase NapE  44.64 
 
 		 61 aa  47  0.00009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2842  periplasmic nitrate reductase, NapE protein  45.45 
 
 		 88 aa  46.2  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2436  periplasmic nitrate reductase, NapE protein  43.18 
 
 		 88 aa  44.3  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0082  hypothetical protein  46.51 
 
 		 73 aa  43.9  0.0008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0888  periplasmic nitrate reductase NapE  46.34 
 
 		 74 aa  42.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1831  membrane protein TorE  28.85 
 
 		 57 aa  41.6  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1298  trimethylamine N-oxide reductase system, TorE protein  40 
 
 		 72 aa  41.6  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003827  periplasmic nitrate reductase component NapE  40 
 
 		 59 aa  40  0.01  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>