28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1831 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1831  membrane protein TorE  100 
 
 		 57 aa  113  8.999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3524  trimethylamine N-oxide reductase system, TorE protein  60 
 
 		 73 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2796  periplasmic nitrate reductase NapE  60 
 
 		 66 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.212441 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3350  trimethylamine N-oxide reductase system, TorE protein  60.34 
 
 		 58 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3211  periplasmic nitrate reductase NapE  60.34 
 
 		 58 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1156  trimethylamine N-oxide reductase system, TorE protein  60.34 
 
 		 58 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3358  periplasmic nitrate reductase NapE  52.73 
 
 		 56 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3211  trimethylamine N-oxide reductase system TorE  56.9 
 
 		 58 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1053  periplasmic nitrate reductase NapE  62 
 
 		 56 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1118  periplasmic nitrate reductase NapE  62 
 
 		 56 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.11468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1057  periplasmic nitrate reductase NapE  62 
 
 		 56 aa  62.8  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1234  WARNINIG torE protein  60 
 
 		 56 aa  62.4  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3341  periplasmic nitrate reductase NapE  49.09 
 
 		 56 aa  55.1  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0989  warning TorE protein  46.94 
 
 		 54 aa  52.4  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1298  trimethylamine N-oxide reductase system, TorE protein  46 
 
 		 72 aa  50.8  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003827  periplasmic nitrate reductase component NapE  53.06 
 
 		 59 aa  50.4  0.000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1996  periplasmic nitrate reductase NapE  52.63 
 
 		 56 aa  49.3  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.450817  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01855  hypothetical protein  53.06 
 
 		 59 aa  49.3  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0082  hypothetical protein  43.14 
 
 		 73 aa  47.8  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4761  periplasmic nitrate reductase NapE  40 
 
 		 55 aa  45.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2979  periplasmic nitrate reductase NapE  46.51 
 
 		 55 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0578173 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2842  periplasmic nitrate reductase, NapE protein  36 
 
 		 88 aa  45.1  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2436  periplasmic nitrate reductase, NapE protein  36 
 
 		 88 aa  44.3  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4065  putative periplasmic nitrate reductase  40 
 
 		 54 aa  44.3  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.023379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0774  putative periplasmic nitrate reductase protein NapE  46.51 
 
 		 58 aa  44.3  0.0006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.91317  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4719  periplasmic nitrate reductase NapE  45.45 
 
 		 59 aa  42  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0612346  normal  0.0196306 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0950  periplasmic nitrate reductase NapE  28.85 
 
 		 57 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4113  NapE component of periplasmic nitrate reductase  41.86 
 
 		 60 aa  41.2  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>