14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0989 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_0989  warning TorE protein  100 
 
 		 54 aa  110  5e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3524  trimethylamine N-oxide reductase system, TorE protein  56.86 
 
 		 73 aa  67  0.00000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1053  periplasmic nitrate reductase NapE  60.71 
 
 		 56 aa  67  0.00000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1118  periplasmic nitrate reductase NapE  60.71 
 
 		 56 aa  67  0.00000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.11468  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1234  WARNINIG torE protein  58.93 
 
 		 56 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1057  periplasmic nitrate reductase NapE  58.93 
 
 		 56 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3211  trimethylamine N-oxide reductase system TorE  53.45 
 
 		 58 aa  62.4  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1156  trimethylamine N-oxide reductase system, TorE protein  58.33 
 
 		 58 aa  61.6  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3211  periplasmic nitrate reductase NapE  58.33 
 
 		 58 aa  61.2  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3350  trimethylamine N-oxide reductase system, TorE protein  58.33 
 
 		 58 aa  61.2  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3341  periplasmic nitrate reductase NapE  56 
 
 		 56 aa  60.1  0.000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3358  periplasmic nitrate reductase NapE  50 
 
 		 56 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2796  periplasmic nitrate reductase NapE  48.15 
 
 		 66 aa  57.8  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.212441 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1831  membrane protein TorE  46.94 
 
 		 57 aa  52.4  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>