24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2796 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2796  periplasmic nitrate reductase NapE  100 
 
 		 66 aa  136  1e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.212441 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3524  trimethylamine N-oxide reductase system, TorE protein  66.15 
 
 		 73 aa  89  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3358  periplasmic nitrate reductase NapE  73.21 
 
 		 56 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1234  WARNINIG torE protein  65.45 
 
 		 56 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1053  periplasmic nitrate reductase NapE  63.64 
 
 		 56 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1118  periplasmic nitrate reductase NapE  63.64 
 
 		 56 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.11468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1057  periplasmic nitrate reductase NapE  63.64 
 
 		 56 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1156  trimethylamine N-oxide reductase system, TorE protein  69.23 
 
 		 58 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3350  trimethylamine N-oxide reductase system, TorE protein  69.23 
 
 		 58 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3211  periplasmic nitrate reductase NapE  69.23 
 
 		 58 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3211  trimethylamine N-oxide reductase system TorE  64.91 
 
 		 58 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1831  membrane protein TorE  60 
 
 		 57 aa  68.6  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1996  periplasmic nitrate reductase NapE  62.5 
 
 		 56 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.450817  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0989  warning TorE protein  48.15 
 
 		 54 aa  57.8  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3341  periplasmic nitrate reductase NapE  44.26 
 
 		 56 aa  53.5  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0774  putative periplasmic nitrate reductase protein NapE  38.18 
 
 		 58 aa  43.9  0.0008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.91317  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1298  trimethylamine N-oxide reductase system, TorE protein  43.59 
 
 		 72 aa  43.5  0.0009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4065  putative periplasmic nitrate reductase  37.78 
 
 		 54 aa  43.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.023379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4761  periplasmic nitrate reductase NapE  37.78 
 
 		 55 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2436  periplasmic nitrate reductase, NapE protein  37.78 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003827  periplasmic nitrate reductase component NapE  43.59 
 
 		 59 aa  43.5  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2979  periplasmic nitrate reductase NapE  48.57 
 
 		 55 aa  42  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0578173 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2842  periplasmic nitrate reductase, NapE protein  35.56 
 
 		 88 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01855  hypothetical protein  41.03 
 
 		 59 aa  41.2  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>