18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1996 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1996  periplasmic nitrate reductase NapE  100 
 
 		 56 aa  113  8.999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.450817  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3358  periplasmic nitrate reductase NapE  67.86 
 
 		 56 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2796  periplasmic nitrate reductase NapE  62.5 
 
 		 66 aa  79  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.212441 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3350  trimethylamine N-oxide reductase system, TorE protein  62.07 
 
 		 58 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3211  periplasmic nitrate reductase NapE  62.07 
 
 		 58 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1156  trimethylamine N-oxide reductase system, TorE protein  62.07 
 
 		 58 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1118  periplasmic nitrate reductase NapE  60.71 
 
 		 56 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.11468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1057  periplasmic nitrate reductase NapE  60.71 
 
 		 56 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1053  periplasmic nitrate reductase NapE  60.71 
 
 		 56 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1234  WARNINIG torE protein  58.93 
 
 		 56 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3211  trimethylamine N-oxide reductase system TorE  60.34 
 
 		 58 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3524  trimethylamine N-oxide reductase system, TorE protein  63.27 
 
 		 73 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1831  membrane protein TorE  52.63 
 
 		 57 aa  65.1  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0989  warning TorE protein  58.14 
 
 		 54 aa  57  0.00000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3341  periplasmic nitrate reductase NapE  46.43 
 
 		 56 aa  55.5  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4065  putative periplasmic nitrate reductase  33.93 
 
 		 54 aa  44.3  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.023379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4761  periplasmic nitrate reductase NapE  32.14 
 
 		 55 aa  43.5  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1298  trimethylamine N-oxide reductase system, TorE protein  38 
 
 		 72 aa  40  0.01  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>